Phyre 2 Results for O13535

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	O13535
Date	Mon Jul 2 19:10:10 BST 2012
Unique Job ID	b73bcf582ec0214e

Summary

Top model

Image coloured by rainbow N → C terminus

Model (left) based on template c1c0mA_

Top template information

PDB header:transferase
Chain: A: PDB Molecule:protein (integrase);
PDBTitle: crystal structure of rsv two-domain integrase

Confidence and coverage

Confidence:

100.0%

Coverage:

11%

205 residues ( 11% of your sequence) have been modelled with 100.0% confidence by the single highest scoring template.

Additional confident templates have been detected (see Domain analysis) which cover other regions of your sequence.

763 residues ( 43%) could be modelled at >90% confidence using multiple-templates.

You may wish to try resubmitting your sequence in "intensive" mode to model more of your sequence.

3D viewing

Interactive 3D view in Jmol

Sequence analysis

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M E S Q Q L S N Y P H I S H G S A C A S V T S K E V H T N Q D P L D V S A S K I Q E Y D K A S T K A N S Q Q T T T P A S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
?
?
? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence S A V P E N L H H A S P Q P A S V P P P Q N G P Y P Q Q C M M T Q N Q A N P S G W S F Y G H P S M I P Y T P Y Q M S P M

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence Y F P P G P Q S Q F P Q Y P S S V G T P L S T P S P E S G N T F T D S S S A D S D M T S T K K Y V R P P P M L T S P N D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence F P N W V K T Y I K F L Q N S N L G G I I P T V N G K P V P P M L T S P N D F P N W V K T Y I K F L Q N S N L G G I I P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence T V N G K P V R Q I T D D E L T F L Y N T F Q I F A P S Q F L P T W V K D I L S V D Y T D I M K I L S K S I E K M Q S D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence T Q E A N D I V T L A N L Q Y N G S T P A D A F E T K V T N I I D R L N N N G I H I N N K V A C Q L I M R G L S G E Y K

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence F L R Y T R H R H L N M T V A E L F L D I H A I Y E E Q Q G S R N S K P N Y R R N P S D E K N D S R S Y T N T T K P K V

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence I A R N P Q K T N N S K S K T A R A H N V S T S N N S P S T D N D S I S K S T T E P I Q L N N K H D L H L G Q K L T E S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence T V N H T N H S D D E L P G H L L L D S G A S R T L I R S A H H I H S A S S N P D I N V V D A Q K R N I P I N A I G D L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence Q F H F Q D N T K T S I K V L H T P N I A Y D L L S L N E L A A V D I T A C F T K N V L E R S D G T V L A P I V K Y G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence F Y W V S K K Y L L P S N I S V P T I N N V H T S E S T R K Y P Y P F I H R M L A H A N A Q T I R Y S L K N N T I T Y F

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence N E S D V D W S S A I D Y Q C P D C L I G K S T K H R H I K G S R L K Y Q N S Y E P F Q Y L H T D I F G P V H N L P K S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence A P S Y F I S F T D E T T K F R W V Y P L H D R R E D S I L D V F T T I L A F I K N Q F Q A S V L V I Q M D R G S E Y T

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence N R T L H K F L E K N G I T P C Y T T T A D S R A H G V A E R L N R T L L D D C R T Q L Q C S G L P N H L W F S A I E F

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence S T I V R N S L A S P K S K K S A R Q H A G L A G L D I S T L L P F G Q P V I V N D H N P N S K I H P R G I P G Y A L H

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?
?
?
?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence P S R N S Y G Y I I Y L P S L K K T V D T T N Y V I L Q G K E S R L D Q F N Y D A L T F D E D L N R L T A S Y H S F I A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence S N E I Q Q S N D L N I E S D H D F Q S D I E L H P E Q L R N V L S K A V S P T D S T P P S T H T E D S K R V S K T N I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence R A P R E V D P N I S E S N I L P S K K R S S T P Q I S D I E S T G S G G M H R L D V P L L A P M S Q S N T H E S S H A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence S K S K D F R H S D S Y S D N E T N H T N V P I S S T G G T N N K T V P Q T S E Q E T E K R I I H R S P S I D T S S S E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence S N S L H H V V P I K T S D T C P K E N T E E S I I A D L P L P D L P P E P P T E L S D S F K E L P P I N S H Q T N S S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence L G G I G D S N A Y T T I N S K K R S L E D N E T E I K V S R D T W N T K N M R S L E P P R S K K R I H L I A A V K A V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence K S I K P I R T T L R Y D E A I T Y N K D I K E K E K Y I Q A Y H K E V N Q L L M M K T W D T D R Y Y D R K E I D P K R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ?
?
? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence V I N S M F I F N R K R D G T H K A R F V A R G D I Q H P D T Y D P G M Q S N T V H H Y A L M T S L S L A L D N N Y Y I

Secondary structure

SS confidence

Disorder

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420 . . . . . . . . . 1430 . . . . . . . . . 1440

Sequence T Q L D I S S A Y L Y A D I K E E L Y I R P P P H L G M N D K L I R L K K S L Y G L K Q S G A N W Y E T I K S Y L I K Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1450 . . . . . . . . . 1460 . . . . . . . . . 1470 . . . . . . . . . 1480 . . . . . . . . . 1490 . . . . . . . . . 1500

Sequence C G M E E V R G W S C V F K N S Q V T I C L F V D D M I L F S K D L N A N K K I I T T L K K Q Y D T K I I N L G E S D N

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1510 . . . . . . . . . 1520 . . . . . . . . . 1530 . . . . . . . . . 1540 . . . . . . . . . 1550 . . . . . . . . . 1560

Sequence E I Q Y D I L G L E I K Y Q R G K Y M K L G M E N S L T E K I P K L N V P L N P K G R K L S A P G Q P G L Y I D Q D E L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1570 . . . . . . . . . 1580 . . . . . . . . . 1590 . . . . . . . . . 1600 . . . . . . . . . 1610 . . . . . . . . . 1620

Sequence E I D E D E Y K E K V H E M Q K L I G L A S Y V G Y K F R F D L L Y Y I N T L A Q H I L F P S R Q V L D M T Y E L I Q F

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1630 . . . . . . . . . 1640 . . . . . . . . . 1650 . . . . . . . . . 1660 . . . . . . . . . 1670 . . . . . . . . . 1680

Sequence M W D T R D K Q L I W H K N K P T E P D N K L V A I S D A S Y G N Q P Y Y K S Q I G N I Y L L N G K V I G G K S T K A S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1690 . . . . . . . . . 1700 . . . . . . . . . 1710 . . . . . . . . . 1720 . . . . . . . . . 1730 . . . . . . . . . 1740

Sequence L T C T S T T E A E I H A I S E S V P L L N N L S H L V Q E L N K K P I T K G L L T D S K S T I S I I I S N N E E K F R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1750 . . . . . . . . . 1760 . . . . . . . . . 1770 . . . . . . . . . 1780 . . . . . . . . . 1790 . . .

Sequence N R F F G T K A M R L R D E V S G N H L H V C Y I E T K K N I A D V M T K P L P I K T F K L L T N K W I H

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand

Domain analysis

Hover over an aligned region to see model and summary info

Please note, only up to the top 20 hits are modelled to reduce computer load

Rank	Aligned region

PDB 1c0m chain A

Region: 697 - 916
Aligned: 205
Modelled: 220
Confidence: 100.0%
Identity: 20%
PDB header:transferase
Chain: A: PDB Molecule:protein (integrase);
PDBTitle: crystal structure of rsv two-domain integrase

Phyre2

PDB 3f9k chain V

Region: 633 - 863
Aligned: 184
Modelled: 204
Confidence: 100.0%
Identity: 11%
PDB header:viral protein, recombination
Chain: V: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: two domain fragment of hiv-2 integrase in complex with ledgf ibd

Phyre2

PDB 1asu chain A

Region: 694 - 857
Aligned: 156
Modelled: 164
Confidence: 100.0%
Identity: 19%
Fold: Ribonuclease H-like motif
Superfamily: Ribonuclease H-like
Family: Retroviral integrase, catalytic domain

Phyre2

PDB 1c0m chain A domain 2

Region: 697 - 864
Aligned: 160
Modelled: 168
Confidence: 100.0%
Identity: 19%
Fold: Ribonuclease H-like motif
Superfamily: Ribonuclease H-like
Family: Retroviral integrase, catalytic domain

Phyre2

PDB 1k6y chain B

Region: 633 - 863
Aligned: 170
Modelled: 197
Confidence: 100.0%
Identity: 15%
PDB header:transferase
Chain: B: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: crystal structure of a two-domain fragment of hiv-1 integrase

Phyre2

PDB 3l2t chain B

Region: 697 - 870
Aligned: 163
Modelled: 166
Confidence: 100.0%
Identity: 21%
PDB header:recombination/dna
Chain: B: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in2 complex with magnesium and mk0518 (raltegravir)

Phyre2

PDB 3hpg chain C

Region: 633 - 863
Aligned: 179
Modelled: 197
Confidence: 100.0%
Identity: 16%
PDB header:transferase
Chain: C: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: visna virus integrase (residues 1-219) in complex with ledgf2 ibd: examples of open integrase dimer-dimer interfaces

Phyre2

PDB 1ex4 chain A

Region: 700 - 929
Aligned: 208
Modelled: 230
Confidence: 99.9%
Identity: 14%
PDB header:viral protein
Chain: A: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: hiv-1 integrase catalytic core and c-terminal domain

Phyre2

PDB 3dlr chain A

Region: 700 - 874
Aligned: 154
Modelled: 173
Confidence: 99.9%
Identity: 21%
PDB header:transferase
Chain: A: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: crystal structure of the catalytic core domain from pfv2 integrase

Phyre2

PDB 3nf9 chain A

Region: 701 - 861
Aligned: 140
Modelled: 161
Confidence: 99.9%
Identity: 16%
PDB header:hydrolase/hydrolase inhibitor
Chain: A: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: structural basis for a new mechanism of inhibition of hiv integrase2 identified by fragment screening and structure based design

Phyre2

PDB 3kks chain B

Region: 704 - 862
Aligned: 142
Modelled: 159
Confidence: 99.9%
Identity: 13%
PDB header:dna binding protein
Chain: B: PDB Molecule:integrase;
PDBTitle: crystal structure of catalytic core domain of biv integrase in crystal2 form ii

Phyre2

PDB 1cxq chain A

Region: 698 - 846
Aligned: 137
Modelled: 149
Confidence: 99.9%
Identity: 20%
Fold: Ribonuclease H-like motif
Superfamily: Ribonuclease H-like
Family: Retroviral integrase, catalytic domain

Phyre2

PDB 1exq chain A

Region: 700 - 863
Aligned: 139
Modelled: 164
Confidence: 99.9%
Identity: 14%
Fold: Ribonuclease H-like motif
Superfamily: Ribonuclease H-like
Family: Retroviral integrase, catalytic domain

Phyre2

PDB 1hyv chain A

Region: 704 - 863
Aligned: 132
Modelled: 160
Confidence: 99.9%
Identity: 17%
Fold: Ribonuclease H-like motif
Superfamily: Ribonuclease H-like
Family: Retroviral integrase, catalytic domain

Phyre2

PDB 1c6v chain A

Region: 700 - 863
Aligned: 136
Modelled: 164
Confidence: 99.8%
Identity: 10%
Fold: Ribonuclease H-like motif
Superfamily: Ribonuclease H-like
Family: Retroviral integrase, catalytic domain

Phyre2

PDB 1rth chain A

Region: 1289 - 1771
Aligned: 378
Modelled: 427
Confidence: 99.7%
Identity: 16%
PDB header:nucleotidyltransferase
Chain: A: PDB Molecule:hiv-1 reverse transcriptase;
PDBTitle: high resolution structures of hiv-1 rt from four rt-2 inhibitor complexes

Phyre2

PDB 1mu2 chain A

Region: 1261 - 1777
Aligned: 398
Modelled: 457
Confidence: 99.5%
Identity: 19%
PDB header:transferase
Chain: A: PDB Molecule:hiv-2 rt;
PDBTitle: crystal structure of hiv-2 reverse transcriptase

Phyre2

PDB 2zd1 chain B domain 1

Region: 1280 - 1702
Aligned: 319
Modelled: 368
Confidence: 99.3%
Identity: 16%
Fold: DNA/RNA polymerases
Superfamily: DNA/RNA polymerases
Family: Reverse transcriptase

Phyre2

PDB 2opq chain A

Region: 1377 - 1766
Aligned: 313
Modelled: 340
Confidence: 99.2%
Identity: 19%
PDB header:transferase
Chain: A: PDB Molecule:reverse transcriptase/ribonuclease h;
PDBTitle: crystal structure of l100i mutant hiv-1 reverse2 transcriptase in complex with gw420867x.

Phyre2

PDB 3kk1 chain B

Region: 1289 - 1702
Aligned: 315
Modelled: 360
Confidence: 99.2%
Identity: 16%
PDB header:transferase/dna
Chain: B: PDB Molecule:reverse transcriptase p51 subunit;
PDBTitle: hiv-1 reverse transcriptase-dna complex with nuceotide inhibitor gs-2 9148-diphosphate bound in nucleotide site

Phyre2

PDB 1nh0 chain A

Region: 497 - 579
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 95.7%
Identity: 14%
Fold: Acid proteases
Superfamily: Acid proteases
Family: Retroviral protease (retropepsin)

Phyre2

PDB 1bdq chain A

Region: 497 - 579
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 95.2%
Identity: 14%
Fold: Acid proteases
Superfamily: Acid proteases
Family: Retroviral protease (retropepsin)

Phyre2

PDB 1c6y chain A

Region: 497 - 579
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 94.6%
Identity: 12%
Fold: Acid proteases
Superfamily: Acid proteases
Family: Retroviral protease (retropepsin)

Phyre2

PDB 1siv chain A

Region: 497 - 579
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 94.6%
Identity: 14%
Fold: Acid proteases
Superfamily: Acid proteases
Family: Retroviral protease (retropepsin)

Phyre2

PDB 3ecg chain A domain 1

Region: 497 - 578
Aligned: 76
Modelled: 76
Confidence: 94.1%
Identity: 16%
Fold: Acid proteases
Superfamily: Acid proteases
Family: Retroviral protease (retropepsin)

Phyre2

PDB 2nmz chain A domain 1

Region: 497 - 579
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 94.1%
Identity: 16%
Fold: Acid proteases
Superfamily: Acid proteases
Family: Retroviral protease (retropepsin)

Phyre2

	1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence	M	E	S	Q	Q	L	S	N	Y	P	H	I	S	H	G	S	A	C	A	S	V	T	S	K	E	V	H	T	N	Q	D	P	L	D	V	S	A	S	K	I	Q	E	Y	D	K	A	S	T	K	A	N	S	Q	Q	T	T	T	P	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?		?			?		?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence	S	A	V	P	E	N	L	H	H	A	S	P	Q	P	A	S	V	P	P	P	Q	N	G	P	Y	P	Q	Q	C	M	M	T	Q	N	Q	A	N	P	S	G	W	S	F	Y	G	H	P	S	M	I	P	Y	T	P	Y	Q	M	S	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?															?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence	Y	F	P	P	G	P	Q	S	Q	F	P	Q	Y	P	S	S	V	G	T	P	L	S	T	P	S	P	E	S	G	N	T	F	T	D	S	S	S	A	D	S	D	M	T	S	T	K	K	Y	V	R	P	P	P	M	L	T	S	P	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence	F	P	N	W	V	K	T	Y	I	K	F	L	Q	N	S	N	L	G	G	I	I	P	T	V	N	G	K	P	V	P	P	M	L	T	S	P	N	D	F	P	N	W	V	K	T	Y	I	K	F	L	Q	N	S	N	L	G	G	I	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence	T	V	N	G	K	P	V	R	Q	I	T	D	D	E	L	T	F	L	Y	N	T	F	Q	I	F	A	P	S	Q	F	L	P	T	W	V	K	D	I	L	S	V	D	Y	T	D	I	M	K	I	L	S	K	S	I	E	K	M	Q	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?			?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence	T	Q	E	A	N	D	I	V	T	L	A	N	L	Q	Y	N	G	S	T	P	A	D	A	F	E	T	K	V	T	N	I	I	D	R	L	N	N	N	G	I	H	I	N	N	K	V	A	C	Q	L	I	M	R	G	L	S	G	E	Y	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence	F	L	R	Y	T	R	H	R	H	L	N	M	T	V	A	E	L	F	L	D	I	H	A	I	Y	E	E	Q	Q	G	S	R	N	S	K	P	N	Y	R	R	N	P	S	D	E	K	N	D	S	R	S	Y	T	N	T	T	K	P	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence	I	A	R	N	P	Q	K	T	N	N	S	K	S	K	T	A	R	A	H	N	V	S	T	S	N	N	S	P	S	T	D	N	D	S	I	S	K	S	T	T	E	P	I	Q	L	N	N	K	H	D	L	H	L	G	Q	K	L	T	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence	T	V	N	H	T	N	H	S	D	D	E	L	P	G	H	L	L	L	D	S	G	A	S	R	T	L	I	R	S	A	H	H	I	H	S	A	S	S	N	P	D	I	N	V	V	D	A	Q	K	R	N	I	P	I	N	A	I	G	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?		?	?	?	?	?	?	?	?																																							?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence	Q	F	H	F	Q	D	N	T	K	T	S	I	K	V	L	H	T	P	N	I	A	Y	D	L	L	S	L	N	E	L	A	A	V	D	I	T	A	C	F	T	K	N	V	L	E	R	S	D	G	T	V	L	A	P	I	V	K	Y	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence	F	Y	W	V	S	K	K	Y	L	L	P	S	N	I	S	V	P	T	I	N	N	V	H	T	S	E	S	T	R	K	Y	P	Y	P	F	I	H	R	M	L	A	H	A	N	A	Q	T	I	R	Y	S	L	K	N	N	T	I	T	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																									?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence	N	E	S	D	V	D	W	S	S	A	I	D	Y	Q	C	P	D	C	L	I	G	K	S	T	K	H	R	H	I	K	G	S	R	L	K	Y	Q	N	S	Y	E	P	F	Q	Y	L	H	T	D	I	F	G	P	V	H	N	L	P	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence	A	P	S	Y	F	I	S	F	T	D	E	T	T	K	F	R	W	V	Y	P	L	H	D	R	R	E	D	S	I	L	D	V	F	T	T	I	L	A	F	I	K	N	Q	F	Q	A	S	V	L	V	I	Q	M	D	R	G	S	E	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence	N	R	T	L	H	K	F	L	E	K	N	G	I	T	P	C	Y	T	T	T	A	D	S	R	A	H	G	V	A	E	R	L	N	R	T	L	L	D	D	C	R	T	Q	L	Q	C	S	G	L	P	N	H	L	W	F	S	A	I	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence	S	T	I	V	R	N	S	L	A	S	P	K	S	K	K	S	A	R	Q	H	A	G	L	A	G	L	D	I	S	T	L	L	P	F	G	Q	P	V	I	V	N	D	H	N	P	N	S	K	I	H	P	R	G	I	P	G	Y	A	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?									?					?															?		?	?		?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence	P	S	R	N	S	Y	G	Y	I	I	Y	L	P	S	L	K	K	T	V	D	T	T	N	Y	V	I	L	Q	G	K	E	S	R	L	D	Q	F	N	Y	D	A	L	T	F	D	E	D	L	N	R	L	T	A	S	Y	H	S	F	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence	S	N	E	I	Q	Q	S	N	D	L	N	I	E	S	D	H	D	F	Q	S	D	I	E	L	H	P	E	Q	L	R	N	V	L	S	K	A	V	S	P	T	D	S	T	P	P	S	T	H	T	E	D	S	K	R	V	S	K	T	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence	R	A	P	R	E	V	D	P	N	I	S	E	S	N	I	L	P	S	K	K	R	S	S	T	P	Q	I	S	D	I	E	S	T	G	S	G	G	M	H	R	L	D	V	P	L	L	A	P	M	S	Q	S	N	T	H	E	S	S	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?		?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence	S	K	S	K	D	F	R	H	S	D	S	Y	S	D	N	E	T	N	H	T	N	V	P	I	S	S	T	G	G	T	N	N	K	T	V	P	Q	T	S	E	Q	E	T	E	K	R	I	I	H	R	S	P	S	I	D	T	S	S	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?				?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence	S	N	S	L	H	H	V	V	P	I	K	T	S	D	T	C	P	K	E	N	T	E	E	S	I	I	A	D	L	P	L	P	D	L	P	P	E	P	P	T	E	L	S	D	S	F	K	E	L	P	P	I	N	S	H	Q	T	N	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence	L	G	G	I	G	D	S	N	A	Y	T	T	I	N	S	K	K	R	S	L	E	D	N	E	T	E	I	K	V	S	R	D	T	W	N	T	K	N	M	R	S	L	E	P	P	R	S	K	K	R	I	H	L	I	A	A	V	K	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence	K	S	I	K	P	I	R	T	T	L	R	Y	D	E	A	I	T	Y	N	K	D	I	K	E	K	E	K	Y	I	Q	A	Y	H	K	E	V	N	Q	L	L	M	M	K	T	W	D	T	D	R	Y	Y	D	R	K	E	I	D	P	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?										?	?	?	?	?	?	?																			?							?	?		?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence	V	I	N	S	M	F	I	F	N	R	K	R	D	G	T	H	K	A	R	F	V	A	R	G	D	I	Q	H	P	D	T	Y	D	P	G	M	Q	S	N	T	V	H	H	Y	A	L	M	T	S	L	S	L	A	L	D	N	N	Y	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence	T	Q	L	D	I	S	S	A	Y	L	Y	A	D	I	K	E	E	L	Y	I	R	P	P	P	H	L	G	M	N	D	K	L	I	R	L	K	K	S	L	Y	G	L	K	Q	S	G	A	N	W	Y	E	T	I	K	S	Y	L	I	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence	C	G	M	E	E	V	R	G	W	S	C	V	F	K	N	S	Q	V	T	I	C	L	F	V	D	D	M	I	L	F	S	K	D	L	N	A	N	K	K	I	I	T	T	L	K	K	Q	Y	D	T	K	I	I	N	L	G	E	S	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560
Sequence	E	I	Q	Y	D	I	L	G	L	E	I	K	Y	Q	R	G	K	Y	M	K	L	G	M	E	N	S	L	T	E	K	I	P	K	L	N	V	P	L	N	P	K	G	R	K	L	S	A	P	G	Q	P	G	L	Y	I	D	Q	D	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?																																			?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620
Sequence	E	I	D	E	D	E	Y	K	E	K	V	H	E	M	Q	K	L	I	G	L	A	S	Y	V	G	Y	K	F	R	F	D	L	L	Y	Y	I	N	T	L	A	Q	H	I	L	F	P	S	R	Q	V	L	D	M	T	Y	E	L	I	Q	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680
Sequence	M	W	D	T	R	D	K	Q	L	I	W	H	K	N	K	P	T	E	P	D	N	K	L	V	A	I	S	D	A	S	Y	G	N	Q	P	Y	Y	K	S	Q	I	G	N	I	Y	L	L	N	G	K	V	I	G	G	K	S	T	K	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?																																							?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1740
Sequence	L	T	C	T	S	T	T	E	A	E	I	H	A	I	S	E	S	V	P	L	L	N	N	L	S	H	L	V	Q	E	L	N	K	K	P	I	T	K	G	L	L	T	D	S	K	S	T	I	S	I	I	I	S	N	N	E	E	K	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																																																	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1790	.	.	.
Sequence	N	R	F	F	G	T	K	A	M	R	L	R	D	E	V	S	G	N	H	L	H	V	C	Y	I	E	T	K	K	N	I	A	D	V	M	T	K	P	L	P	I	K	T	F	K	L	L	T	N	K	W	I	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?
Disorder confidence