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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1raja_ | DNA/RNA polymerases | DNA/RNA polymerases | RNA-dependent RNA-polymerase |
Added to library: Tue Mar 16 14:41:44 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | D | E | Y | M | K | E | A | V | D | H | Y | A | G | Q | L | M | S | L | D | I | N | T | E | G | N | L | Y | A | A | F | H | K | N | P | G | V | I | T | G | S | A | V | G | C | D | P | D | L | F | W | S | K | I | P | V | L | M | E | E | K | L | F | A | F | D | Y | T | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | B | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | A | S | L | S | P | A | W | F | E | A | L | K | M | V | L | E | K | T | S | I | F | N | S | M | I | N | N | L | I | I | R | T | L | L | L | K | T | Y | K | G | I | D | L | D | H | L | K | M | I | A | Y | G | D | D | V | I | A | S | Y | P | H | E | V | D | A | S | L | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | S | G | K | D | Y | G | L | T | M | T | P | A | D | K | S | A | T | F | E | T | V | T | W | E | N | V | T | F | L | K | R | F | F | R | A | D | E | K | Y | P | F | L | I | H | P | V | M | P | M | K | E | I | H | E | S | I | R | W | T | K | D | P | R | N | T | Q | D | H | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | B | T | T | B | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | S | L | C | L | L | A | W | H | N | G | E | E | E | Y | N | K | F | L | A | K | I | R | S | V | P | I | G | R | A | L | A | L | P | E | Y | S | T | L | Y | D | R | W | L | D | S | F | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | T | S | T |
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