Job Description P26612 Confidence 98.27% Date Thu Jan 5 11:42:59 GMT 2012 Rank 125 Aligned Residues 344 % Identity 12% Template c3a5vA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase i from mortierella vinacea Resolution 2.00 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.						.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	Y	P	E	G	G	K	L	W	P	E	L	A	E	R	A	D	G	F	N	D	.	.	.	.	.	I	G	I	N	M	V	W	L	P	P	A	Y	K	G	A	S	G	G	Y	S	V	G	Y	D	S	Y	D	L	F	D	L	G	E	F	D	Q	K	G	S	I	P	T	K	Y	G	D	K	A	Q	L	L	A	A
Query Conservation																								.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Sequence		W	N	K	Y	G	C	N	V	D	E	Q	L	I	L	D	A	A	K	A	I	A	S	S	G	L	K	D	L	G	Y	N	Y	V	I	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	W	Q	K	N	E	R	E	S	S	K	T	L	L	A	D	P	T	K	F	P	R	.	.	.	.	.	G	I	K	P	L
Template Known Secondary structure						G	G	G																	T					T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	T		T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50												.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.						.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	A	L	K	R	N	D	I	A	V	L	L	D	V	V	V	N	H	K	M	G	A	D	E	K	E	A	I	R	V	Q	R	V	N	A	D	D	R	T	Q	I	D	E	E	I	I	E	C	E	G	W	T	R	Y	T	F	P	A	R	A	G	Q	Y	S	Q	F	I	W	D	F	K	C	F	S	G	I	D	H	I
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	D	I	H	N	L	G	L	K	A	G	I	Y	S	S	A	G	T	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T									S	S	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.									.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	P	D	E	D	G	I	F	K	I	V	N	D	Y	T	G	E	G	W	N	D	Q	V	D	D	E	L	G	N	F	D	Y	L	M	G	E	N	I	D	F	R	N	H	A	V	T	E	E	I	K	Y	W	A	R	W	V	M	E	Q	T	Q	C	D	G	F	R	L	D	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	K
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	G	G	H	I	A	S	L	G	Y	E	D	I	D	A	K	T	W	A	K	W	.	G	I	D	Y	L	K	Y	D	N	C	Y	N	Q	G	Q	S	G	T	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		B			T	T													.	T									T	T		T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template SS confidence
																																									101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.		.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.								.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	I	P	A	W	F	Y	K	E	W	I	E	H	V	Q	E	V	A	P	K	P	L	F	I	V	A	E	Y	W	S	H	E	V	D	K	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	I	D	Q	V	E	G	K	T	M	L	F	D	A	P	L	Q	M	K	F	H	E	A	S	R	M	G	R	D	Y	D	M	T	Q	I
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	S	Y	D	R	Y	K	A	M	G	N	A	L	N	K	T	G	R	P	M	L	Y	S	L	C	N	W	G	E	D	G	P	W	N	F	A	S	T	I	S	N	S	W	R	I	S	G	D	V	Y	D	N	F	N	R	P	D	P	A	C	P	C	T	T	Y	D	C	V	L	A	G	F	R	C	S	V	M	N	I
Template Known Secondary structure																		T		S								S	T	T	T	T						S	T	T	T		S					S	S		B		S		S	S				T	T	S				S	S			S				S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	G	T	L	V	E	A	D	P	F	H	A	V	T	L	V	A	N	H	D	T	Q	P	L	Q	A	L	E	A	P	V	E	P	W	F	K	P	L	A	Y	A	L	I	L	L	R	E	N	G	V	P	S	V	F	Y	P	D	L	Y	G	A	H	Y	E	D	V	G	G	D	G	Q	T	Y	P	I	D	M	P	I
Query Conservation
Alig confidence																		.																												.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																												.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	K	A	V	A	V	S	Q	K	A	R	S	G	G	W	.	N	D	L	D	M	L	E	V	G	N	G	G	M	N	Q	E	E	Y	R	V	H	Y	T	I	W	A	A	.	.	.	.	L	K	S	P	L	I	L	G	N	D	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	T	N	T	T
Template Known Secondary structure									G	G	G		B	T	T	B		.						B		T	T	S	S	S	S															.	.	.	.	T	T							S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																		.																												.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.					.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.															.	.	.	.	280	.
		392	.	.	.			.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.													.
Predicted Secondary structure						.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	E	Q	L	.	.	D	E	L	I	L	A	R	Q	R	F	A	H	G	V	Q	T	L	F	F	D	H	P	N	C	I	A	F	S	R	S	G	T	D	E	F	P	G	C	V	V	V	M	S	N	G	D	D	G	E	K	T	I	H	L	G	E	N	Y	G	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Query Conservation						.	.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.																																				.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.
Template Sequence		K	E	I	I	M	N	K	E	V	I	A	V	N	Q	D	S	S	F	S	P	A	N	R	I	W	V	K	G	D	Q	Q	L	F	S	G	N	L	A	N	N	T	.	.	Q	V	V	I	L	L	N	A	G	D	S	A	A	K	M	T	A	T	W	D	D	I	W	V	Y	N	L	P	N	V	D	S	S	R	S	I	E
Template Known Secondary structure															T		T	T											T	T									T	T	T		.	.									S	S	S												T	G	G	G	T	T	S	B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.
Template SS confidence
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.			.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	D	F	L	G	N	R	Q	E	R	V	V	T	D	E	N	G	E	A	T	F	F	C	N	G	G	S	V	S	V	W	V	I	E	E	V
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.
Template Conservation														.	.	.
Template Sequence		V	R	D	L	W	K	Q	K	S	L	G	N	.	.	.	F	S	N	H	I	T	L	D	V	P	A	H	G	V	R	L	L	K	F	M	D	S
Template Known Secondary structure					T	T	T	T						.	.	.			S								T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.				.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.