Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 434 % Identity 18% Template c1cygA_ PDB info PDB header:glycosyltransferase Chain: A: PDB Molecule:cyclodextrin glucanotransferase; PDBTitle: cyclodextrin glucanotransferase (e.c.2.4.1.19) (cgtase) Resolution 2.50 Å

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		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.															.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.			.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	.	.	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.						.	.
Template Conservation																																																						.	.
Template Sequence		N	L	N	K	V	N	F	T	S	D	V	V	Y	Q	I	V	V	D	R	F	V	D	G	N	T	S	N	N	P	S	G	A	L	F	S	S	G	C	T	N	L	R	K	Y	C	G	G	D	W	Q	G	I	.	.	I	N	K	I	N	D	G	Y	L	T	D	M	G	V	T	A	I	W	I	S	Q	P	V	E	N	V
Template Known Secondary structure					T	T			T	T								G	G	G	T			S		G	G	G				G	G	G	B		G	G	G		S	T	T	S	B									.	.						T	S	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.			.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	V	M	N	D	A	S	G	S	A	S	Y	H	G	Y	W	A	R	D	F	K	K	P	N	P	F	F	G	T	.	.	.	.	.	L	S	D	F	Q	R	L	V	D	A	A	H	A	K	G	I	K	V	I	I	D	F	A	P	N	H	T	S	P	A	S	E	T	N	P	S	Y	M	E	N	G	R	L	Y	D
Template Known Secondary structure						S	S	S	S				S	T	T	S		S									T	T	T			.	.	.	.	.														T	T									T	T							S	S		T	T	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110						.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		N	G	T	L	L	G	G	Y	T	N	D	A	N	M	Y	F	H	H	N	G	G	T	T	F	S	S	L	E	D	G	I	Y	R	N	L	F	D	L	A	D	L	N	H	Q	N	P	V	I	D	R	Y	L	K	D	A	V	K	M	W	I	.	D	M	G	I	D	G	I	R	M	D	A	V	K	H	M	P	F	G	W
Template Known Secondary structure		T	T						S	T	T		T	T			B			S		B				S	S						S	S	B	S	T	T				B		T	T	S																.	T	T	T							S		G	G	G	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.				.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.
Query Sequence		E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	.	.	.	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S
Query Conservation																																						.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	S	L	M	D	E	I	D	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	R	P	V	F	T	F	G	E	W	F	L	S	E	N	E	V	D	A	N	N	H	Y	F	A	N	E	S	G	M	S	L	L	D	F	R	F	G	Q	K	L	R	Q	V	L	R	N	N	S	D	N	W	Y	G	F	N	Q	M	I	Q	D	T	A
Template Known Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.													T	T													S	S				B													T	T		S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.								.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	Y	D	E	.	.	.	.	V	L	D	Q	V	T	F	I	D	N	H	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	R	F	M	I	D	G	G	D	P	R	K	V	D	M	A	L	A	V
Template Known Secondary structure					T	T	.	.	.	.	G	G	G					S			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S			T	T			T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.					.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	T	S	R	G	V	P	N	I	Y	Y	G	T	E	Q	Y	M	T	G	N	G	D	.	.	.	.	.	.	P	N	N	R	K	M	M	S	S	F	N	K	N	T	R	A	Y	Q	V	I	Q	K	L	S	S	L	R	R	N	N	P	A	L	A	Y	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G								S		S																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.							.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.							.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.							.	.	.	.	.	.	.	.	650
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	.	.	.	.	.	.	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	.	.	.	.	.	.	T	A	V	W	Q	G	P	A	H
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																					.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	T	E	Q	R	W	I	N	G	D	V	Y	V	Y	E	R	Q	F	G	K	D	V	V	L	V	A	V	N	R	S	S	S	S	N	Y	S	I	T	G	L	F	T	A	L	P	A	G	T	Y	T	D	Q	L	G	G	L	L	D	G	N	T	I	Q	V	G	S	N	G	S	V	N	A	F	D	L	G	P	G
Template Known Secondary structure		.	.	.								S	S									T	T											S	S							S		B		S	S		S						T	T	T	T	T	T									G	G	G	B	B							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
		651	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	C	V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	V	G	V	W	A
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		482	.	.	.	.	.