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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ivuB_ | UNK | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: rna polymerase sigma factor sigi1; |
Added to library: Sat May 18 08:24:56 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | D | I | E | A | R | E | D | I | E | E | L | K | K | K | L | Q | E | F | G | I | T | F | L | D | L | V | L | N | V | P | K | H | R | D | S | R | Q | L | C | I | R | L | A | K | M | L | A | E | D | E | Q | M | Y | N | A | L | M | K | N | K | N | I | P | R | N | E | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | K | K | A | K | V | H | G | R | T | I | G | N | N | R | K | Y | I | I | A | L | C | L | I | F | R | S | N | L | N | L | S | K | R | Y | L | E | Y | Y | T | M | L | E | H | H | H | H | H | H | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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