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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1jb7a3 | OB-fold | Nucleic acid-binding proteins | Single strand DNA-binding domain, SSB |
Added to library: Tue Mar 16 12:44:26 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | N | A | V | V | L | T | E | V | D | K | K | H | A | A | L | P | S | T | S | L | Q | D | L | F | H | H | A | D | S | D | K | E | L | Q | A | Q | D | T | F | R | T | Q | F | Y | V | T | K | I | E | P | S | D | V | K | E | W | V | K | G | Y | D | R | K | T | K | K | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | S | B | T | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | L | K | G | A | S | G | K | G | D | N | I | F | Q | V | Q | F | L | V | K | D | A | S | T | Q | L | N | N | N | T | Y | R | V | L | L | Y | T | Q | D | G | L | G | A | N | F | F | N | V | K | A | D | N | L | H | K | N | A | D | A | R | K | K | L | E | D | S | A | E | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | T | K | F | N | S | Y | V | D | A | V | V | E | R | R | N | G | F | Y | L | I | K | D | T | K | L | I | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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