HHsearch 1.5 NAME d1jb7a3 FAM FILE d1jb7a3 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1jb7a3.a3m DATE Mon Mar 8 20:31:13 2010 LENG 167 match states, 167 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.4226 -0.3423 SEQ >ss_dssp CCSCEECEEECGGGTTSCBCCHHHHHHTTTTCHHHHTCSEEEEEEEEEEEESSSGGGGEEEEETTTTEEECSTTCGGGCEEEEEEEEEEECGGGTTSSCC EEEEEECTTSTTTTTTSSCCCCTTTCHHHHHHHHHHHHHHHSTTEEEEEEEEEETTEEEEESEEECC >sa_dssp EEEECDABEBDEEBEEDEDCCACDBDDDBEEDEEBDEEDCBCADACBDDBCCEDBCCAACABDDEDEEDCCAEECEEDDDDBACACABABBEDADECEDD BDBBACBBEECBDDABDBECDBACECDEBCDEADDBBEDADEEBBCBBAAACCDEEDBBABDADBDE >ss_pred CCCEEEEEEECCCHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCE EEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEEECCCEEEEEEEEEEC >ss_conf 9634898532120000875148998507341022220010112578986247789999875133322355767787667605899999826010258517 8999981687301110444810124835789999999997513110002432038605764222409 >Consensus xxxxvxxTxxdkxhxxlpxTxLxxlFxxxxxdkxlxxxxxFRsqFsvlKixpxxvedyVxxydxkxxxsxxxKgapxxxxxxxxvqflvkDxstqlndnx YxixLyxxddlgxxFFxgxxpxxxxnaxxxkKlekxasxLtkfnvyvDAvlErxxgxyxIrdTxxxx >d1jb7a3 SLNAVVLTEVDKKHAALPSTSLQDLFHHADSDKELQAQDTFRTQFYVTKIEPSDVKEWVKGYDRKTKKSSSLKGASGKGDNIFQVQFLVKDASTQLNNNT YRVLLYTQDGLGANFFNVKADNLHKNADARKKLEDSAELLTKFNSYVDAVVERRNGFYLIKDTKLIY >UniRef50_Q06183(312-460:460) Telomere-binding protein homolog n=1 Tax=Moneuplotes crassus RepID=TEBH_EUPCR E=2e-54 s/c=1.43 id=36% cov=90% ----VLATTTFGDYSELPLTELSEIFEDV-TDKDA----VFRARFSILKITPDRVEDYVEEY--------TPKGAP-RSKPVYKVQFLIKDPSTALNDNL YKIYLYSHGDLGKEFFPGVDPSSAQTPSGHSKLRKYASTLMKFNVHIDAVLEKVGGAFFIRDTEMKF >UniRef50_Q06184(295-445:446) Telomere-binding protein 51 kDa subunit n=1 Tax=Moneuplotes crassus RepID=TEB_EUPCR E=1e-08 s/c=0.41 id=29% cov=90% ------VTKIDKaAHNKMDITPLKKLFFNPKKSEKL-----FRSQFSVLKVDTKNLEDYVGAFDGKKWHSYKGKKTPKDAELRWNIKLIVTDYKNQQDDK AYMIHL---DD--NSFFKGINPANWSNAATKKKAEKAFSVLTNNKVnYVDAILERDKKNYHIRHTQF-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 L 2 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 V 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 5 0 * * * * * * 1495 0 0 V 6 * * * * * * * * * 1130 * * * * * * * 881 * * 6 0 * * * * * * 1495 0 0 L 7 1703 * * * * * * * * 1478 * * * * * * * 1583 * * 7 0 * * * * * * 1949 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1949 0 0 E 9 * * * 1478 * * * * 1583 * * * * * * * 1703 * * * 9 0 * * * * * * 1949 0 0 V 10 * * * * * * * 1583 * * * * * * * * 1703 1478 * * 10 0 * * * * * * 1949 0 0 D 11 * * 529 * 1703 * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1949 0 0 K 12 * * * * * 1703 * * 529 * * * * * * * * * * * 12 586 1583 * 0 * * * 1949 1000 0 K 13 1583 * 1703 * * * * * 1478 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1949 0 0 H 14 * * * * * * 529 * * * * * * * * * * * * 1703 14 0 * * * * * * 1949 0 0 A 15 1478 * * * * * * * * * * 1583 * * * 1703 * * * * 15 0 * * * * * * 1949 0 0 A 16 1478 * * 1703 * * * * 1583 * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1949 0 0 L 17 * * * * * * * * * 586 1583 * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1949 0 0 P 18 * * 1583 * * * * * * * * * 586 * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1949 0 0 S 19 * * * * * * * 1583 * 1703 * * * * * 1478 * * * * 19 0 * * * * * * 1949 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1949 0 0 S 21 * * * 1703 * * * * * * * * 1583 * * 1478 * * * * 21 0 * * * * * * 1949 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1949 0 0 Q 23 * * * * * * * * 1583 * * * * 1478 * 1703 * * * * 23 0 * * * * * * 1949 0 0 D 24 * * 1478 1703 * * * * 1583 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1949 0 0 L 25 * * * * * * * 1703 * 529 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1949 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1949 0 0 H 27 * * * 1703 1583 * 1478 * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1949 0 0 H 28 * * 1703 * * * 1478 * * * * 1583 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1949 0 0 A 29 1478 * * * * * * * * * * * 1583 * * * * 1703 * * 29 529 * 1703 * * * * 1949 0 0 D 30 * * 912 * * * * * 1094 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * 0 * 1578 0 1000 S 31 * * * * * * * * 1583 * * * * * * 1478 1703 * * * 31 0 * * * * * * 1949 0 0 D 32 * * 586 * * * * * * * * * * * * 1583 * * * * 32 0 * * * * * * 1949 0 0 K 33 * * * 1583 * * * * 586 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1949 0 0 E 34 * * 1703 1478 * * * * 1583 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1949 0 0 L 35 1703 * * * * * * * * 529 * * * * * * * * * * 35 1478 * 642 * * * * 1949 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 36 0 * * * * * 0 1000 0 1571 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * 0 1000 0 1571 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 38 0 * * * * * 0 1000 0 1571 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * 1038 963 1000 0 1571 T 40 * * * * * * * * * * * * * * * * 881 1130 * * 40 0 * * * * 0 * 1495 0 1000 F 41 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1949 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 42 0 * * * * * * 1949 0 0 T 43 1703 * * * * * * * * * * * * * * 1583 1478 * * * 43 0 * * * * * * 1949 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 529 1703 * * * * * 44 0 * * * * * * 1949 0 0 F 45 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1949 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * 642 * * * 1478 46 0 * * * * * * 1949 0 0 V 47 * * * * * * * 1703 * * * * * * * * * 529 * * 47 0 * * * * * * 1949 0 0 T 48 * * * * * * * * * 642 * * * * * * 1478 * * * 48 0 * * * * * * 1949 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1949 0 0 I 50 * * * * * * * 586 * * * * * * * * * 1583 * * 50 0 * * * * * * 1949 0 0 E 51 * * 1583 1478 * * * * * * * * * * * * 1703 * * * 51 0 * * * * * * 1949 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 586 * * * 1583 * * * 52 0 * * * * * * 1949 0 0 S 53 * * 1703 * * * * * 1583 * * * * * * 1478 * * * * 53 0 * * * * * * 1949 0 0 D 54 * * 1478 * * * * * * * * 1583 * * 1703 * * * * * 54 0 * * * * * * 1949 0 0 V 55 * * * * * * * * * 1583 * * * * * * * 586 * * 55 0 * * * * * * 1949 0 0 K 56 * * * 642 * * * * 1478 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1949 0 0 E 57 * * 642 1478 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1949 0 0 W 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1478 642 58 0 * * * * * * 1949 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 59 0 * * * * * * 1949 0 0 K 60 * * * 1703 * 1583 * * 1478 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1949 0 0 G 61 1583 * * 1703 * 1478 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1949 0 0 Y 62 * * * * 1583 * * * * * * * * * * * * * * 586 62 529 * 1703 * * * * 1949 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * 0 1578 0 1000 R 64 * * * * * 1094 * * * * * * * * 912 * * * * * 64 0 * * * * * 0 1578 0 1000 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * 0 1578 0 1000 T 66 * * * * * * * * 1094 * * * * * * * 912 * * * 66 0 * * * * * 0 1578 0 1000 K 67 * * * * * * * * 912 * * * * * * * * * 1094 * 67 0 * * * * * 0 1578 0 1000 K 68 * * * * * * 1094 * 912 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * 0 1578 0 1000 S 69 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 69 0 * * * * * 0 1578 0 1000 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 912 * * * 1094 70 0 * * * * 0 * 1578 0 1000 S 71 * * * * * * * * 1583 * * * * * * 1478 1703 * * * 71 0 * * * * * * 1949 0 0 L 72 * * * * * 1583 * * * 1478 * * 1703 * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1949 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1949 0 0 G 74 * * * * * 586 * * 1583 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1949 0 0 A 75 586 * * * * * * * * * * * * * * * 1583 * * * 75 0 * * * * * * 1949 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * 642 * * 1478 * * * * 76 529 * 1703 * * * * 1949 0 0 G 77 * * * * * 912 * * 1094 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * 0 * 1578 0 1000 K 78 * * 1583 * * * * * 1478 * * * * * 1703 * * * * * 78 0 * * * * * * 1949 0 0 G 79 1583 * * * * 1478 * * * * * * * * * 1703 * * * * 79 0 * * * * * * 1949 0 0 D 80 * * 1478 1583 * * * * 1703 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1949 0 0 N 81 * * * * * * * * * 1583 * 1478 1703 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1949 0 0 I 82 * * * * * * * 1478 * * * * * * 1583 * * 1703 * * 82 0 * * * * * * 1949 0 0 F 83 * * * * 1478 * * * * * * * * * * * * * 1583 1703 83 0 * * * * * * 1949 0 0 Q 84 * * * * * * * * 1703 * * 1583 * 1478 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1949 0 0 V 85 * * * * * * * 1583 * * * * * * * * * 586 * * 85 0 * * * * * * 1949 0 0 Q 86 * * * * * * * * 1583 * * * * 586 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1949 0 0 F 87 * * * * 586 * * * * 1583 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1949 0 0 L 88 * * * * * * * 1583 * 586 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1949 0 0 V 89 * * * * * * * 1703 * * * * * * * * * 529 * * 89 0 * * * * * * 1949 0 0 K 90 * * * * * * * * 586 * * * * * * * 1583 * * * 90 0 * * * * * * 1949 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1949 0 0 A 92 1478 * * * * * * * * * * * 1703 * * * * * * 1583 92 0 * * * * * * 1949 0 0 S 93 * * * * * * * * 1583 * * * * * * 586 * * * * 93 0 * * * * * * 1949 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * 1583 * * * * 586 * * * 94 0 * * * * * * 1949 0 0 Q 95 1703 * * * * * * * * * * * * 529 * * * * * * 95 0 * * * * * * 1949 0 0 L 96 * * * * * * * * * 586 * * * 1583 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1949 0 0 N 97 * * 1583 * * * * * * * * 586 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1949 0 0 N 98 * * 642 * * * * * * * * 1478 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1949 0 0 N 99 * * * * * * * * 1583 * * 586 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1949 0 0 T 100 1583 * * * * * * * * 1703 * * * * * * 1478 * * * 100 0 * * * * * * 1949 0 0 Y 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 101 0 * * * * * * 1949 0 0 R 102 * * * * * * * * 1703 * 1583 * * * 1478 * * * * * 102 0 * * * * * * 1949 0 0 V 103 * * * * * * * 642 * * * * * * * * * 1478 * * 103 0 * * * * * * 1949 0 0 L 104 * * * * * * 1583 * * 1478 * * * * * * * * * 1703 104 0 * * * * * * 1949 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 586 * 1583 * * * * 1949 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * 0 1495 0 1000 T 107 * * * * * * * * * * * * * * * 1130 881 * * * 107 0 * * * * * 0 1495 0 1000 Q 108 * * * * * * 1130 * * * * * * 881 * * * * * * 108 0 * * * * 0 * 1495 0 1000 D 109 * * 529 * * 1703 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1949 0 0 G 110 * * 642 * * 1478 * * * * * * * * * * * * * * 110 586 * 1583 * * * * 1949 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * 0 1495 0 1000 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * 0 * 1495 0 1000 A 113 1478 * * * * * * * 1703 * * 1583 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1949 0 0 N 114 * * * 1703 * * * * * * * 1478 * * * 1583 * * * * 114 0 * * * * * * 1949 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1949 0 0 F 116 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1949 0 0 N 117 * * * * * * * * 1583 * * 1478 1703 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1949 0 0 V 118 * * * * * 642 * * * * * * * * * * * 1478 * * 118 0 * * * * * * 1949 0 0 K 119 * * * * * * * 1583 1478 * * * * * * * * 1703 * * 119 0 * * * * * * 1949 0 0 A 120 1478 * 1703 * * * * * * * * 1583 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1949 0 0 D 121 * * 1478 * * * * * * * * * 642 * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1949 0 0 N 122 1583 * * * * * * * * * * 1478 * * * 1703 * * * * 122 0 * * * * * * 1949 0 0 L 123 * * * * * * * * * 1478 * 1583 * * * 1703 * * * * 123 0 * * * * * * 1949 0 0 H 124 1703 * * * * * 1478 * * * * * * * * * * * 1583 * 124 0 * * * * * * 1949 0 0 K 125 * * * * * * * * 1478 * * * * 1703 * 1583 * * * * 125 0 * * * * * * 1949 0 0 N 126 * * * * * * * * * * * 529 * * * * 1703 * * * 126 0 * * * * * * 1949 0 0 A 127 529 * * * * * * * * * * * 1703 * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1949 0 0 D 128 1583 * 1478 * * * * * * * * * * * * 1703 * * * * 128 0 * * * * * * 1949 0 0 A 129 1478 * * * * 1703 * * * * * * * * * * 1583 * * * 129 0 * * * * * * 1949 0 0 R 130 * * * * * * 1703 * 1583 * * * * * 1478 * * * * * 130 0 * * * * * * 1949 0 0 K 131 * * * * * * * * 529 * * * * * * 1703 * * * * 131 0 * * * * * * 1949 0 0 K 132 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1949 0 0 L 133 1583 * * * * * * * * 586 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1949 0 0 E 134 * * * 529 * * * * * * * * * * 1703 * * * * * 134 0 * * * * * * 1949 0 0 D 135 * * 1478 * * * * * 642 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1949 0 0 S 136 1583 * * * * * * * * * * * * * * 1478 * * * 1703 136 0 * * * * * * 1949 0 0 A 137 586 * * * 1583 * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1949 0 0 E 138 * * * 1478 * * * * * * * * * * * 642 * * * * 138 0 * * * * * * 1949 0 0 L 139 * * * * * * * * * 1478 * * * * * * 1703 1583 * * 139 0 * * * * * * 1949 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1949 0 0 T 141 * * * * * * * * * * 1703 * * * * * 529 * * * 141 0 * * * * * * 1949 0 0 K 142 * * * * * * * * 586 * * 1583 * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1949 0 0 F 143 * * * * 586 * * * * * * 1583 * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1949 0 0 N 144 * * * * * * * * 1583 * * 586 * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1949 0 0 S 145 * * * * * * * * * * * * * * * 1478 * 642 * * 145 586 1583 * 0 * * * 1949 1000 0 Y 146 * * * * * * 1703 * * * * * * * * * * * * 529 146 0 * * * * * * 1949 0 0 V 147 * * * * * * * 1703 * * * * * * * * * 529 * * 147 0 * * * * * * 1949 0 0 D 148 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1949 0 0 A 149 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1949 0 0 V 150 * * * * * * * 1583 * * * * * * * * * 586 * * 150 0 * * * * * * 1949 0 0 V 151 * * * * * * * * * 642 * * * * * * * 1478 * * 151 0 * * * * * * 1949 0 0 E 152 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1949 0 0 R 153 * * * * * * * * 1703 * * * * * 529 * * * * * 153 0 * * * * * * 1949 0 0 R 154 * * 1583 * * * * * * * * * * * 1478 * * 1703 * * 154 0 * * * * * * 1949 0 0 N 155 * * * * * 1703 * * 1583 * * 1478 * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1949 0 0 G 156 * * * * * 586 * * 1583 * * * * * * * * * * * 156 0 * * * * * * 1949 0 0 F 157 1703 * * * 1478 * * * * * * 1583 * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1949 0 0 Y 158 * * * * 1703 * * * * * * * * * * * * * * 529 158 0 * * * * * * 1949 0 0 L 159 * * * * 1703 * 1583 * * 1478 * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1949 0 0 I 160 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1949 0 0 K 161 * * * * * * * * 1478 * * * * * 642 * * * * * 161 0 * * * * * * 1949 0 0 D 162 * * 586 * * * 1583 * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1949 0 0 T 163 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 163 0 * * * * * * 1949 0 0 K 164 * * * 1703 * * * * 1478 * * * * 1583 * * * * * * 164 0 * * * * * * 1949 0 0 L 165 * * * * 1583 * * * * 1478 1703 * * * * * * * * * 165 0 * * * * * * 1949 0 0 I 166 * * * * * * * 881 1130 * * * * * * * * * * * 166 0 * * * * * * 1495 0 0 Y 167 * * * * 1130 * * * * * * * * * * * * * * 881 167 0 * * 0 * * * 1495 0 0 //