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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7ay2B_ | 3.20 | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1; |
Added to library: Sat Mar 27 08:50:11 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | N | L | L | P | F | V | G | L | N | N | L | G | N | T | C | Y | L | N | S | I | L | Q | V | L | Y | F | C | P | G | F | K | S | G | V | K | H | L | F | N | I | I | S | R | K | K | L | A | S | Y | E | L | I | C | S | L | Q | S | L | I | I | S | V | E | Q | L | Q | A | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | N | P | E | K | Y | T | D | E | L | A | T | Q | P | R | R | L | L | N | T | L | R | E | L | N | P | M | Y | E | G | Y | L | Q | H | D | A | Q | E | V | L | Q | C | I | L | G | N | I | Q | E | T | C | Q | L | L | K | K | E | E | V | K | N | I | G | F | E | L | V | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | F | Q | G | Q | L | V | L | R | T | R | C | L | E | C | E | S | L | T | E | R | R | E | D | F | Q | D | I | S | V | P | V | Q | E | D | E | M | K | T | L | R | W | A | I | S | Q | F | A | S | V | E | R | I | V | G | E | D | K | Y | F | C | E | N | C | H | H | Y | T | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | B | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | R | S | L | L | F | D | K | M | P | E | V | I | T | I | H | L | K | C | F | A | A | S | G | L | G | G | L | S | K | I | N | T | P | L | L | T | P | L | K | L | S | L | E | E | W | S | T | K | P | T | N | D | S | Y | G | L | F | A | V | V | M | H | S | G | I | T | I | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | G | G | G | B | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | G | H | Y | T | A | S | V | K | V | T | D | E | Q | S | L | K | E | Y | E | G | K | W | L | L | F | D | D | S | E | V | K | V | T | E | E | K | D | F | L | N | S | L | S | P | P | T | S | T | P | Y | L | L | F | Y | K | K | L | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | S |
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