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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ihjA_ | 2.70 | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: nuclear rna export factor 1; |
Added to library: Sat Aug 17 08:22:16 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | G | S | L | L | E | T | K | A | S | Y | L | C | D | V | A | G | A | E | V | V | R | Q | F | L | D | Q | Y | F | R | I | F | D | S | G | N | R | Q | A | L | L | D | A | Y | H | E | K | A | M | L | S | I | S | M | P | S | A | S | Q | A | G | R | L | N | S | F | W | K | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | T | S | G | G | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | T | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | N | L | R | R | L | L | N | E | E | N | R | T | R | N | L | K | Y | G | R | L | A | C | V | S | T | L | D | E | W | P | K | T | Q | H | D | R | R | T | F | T | V | D | L | T | I | Y | N | T | S | M | M | V | F | T | V | T | G | L | F | K | E | L | D | V | R | H | F | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | T | Y | V | V | V | P | Q | N | N | G | F | C | I | R | N | E | T | I | F | I | T | N | A | T | H | E | Q | V | R | E | F | K | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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