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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6gybE_ | 3.28 | PDB header: membrane protein | Chain: E: PDB Molecule: virb9 protein; |
Added to library: Sat Oct 27 09:12:49 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | V | Q | E | Y | E | Y | A | P | D | R | I | Y | Q | V | R | T | G | L | G | I | T | T | Q | V | E | L | S | P | N | E | K | I | L | D | Y | S | T | G | F | T | G | G | W | E | L | T | R | R | E | N | V | F | Y | L | K | P | K | N | V | D | V | D | T | N | M | M | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | T | H | S | Y | I | L | E | L | K | V | V | A | T | D | W | Q | R | L | E | Q | A | K | Q | A | G | V | Q | Y | K | V | V | F | T | Y | P | K | D | T | S | F | N | N | V | K | N | G | P | L | L | N | A | K | I | L | K | D | R | R | Y | Y | Y | D | Y | D | Y | A | T | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | B | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | K | K | S | W | L | I | P | S | R | V | Y | D | D | G | K | F | T | Y | I | N | M | D | L | T | R | F | P | T | G | N | F | P | A | V | F | A | R | E | K | E | H | A | E | D | F | L | V | N | T | T | V | E | G | N | T | L | I | V | H | G | T | Y | P | F | L | V | V | R | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | D | N | V | V | G | L | R | R | N | K | Q | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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