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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6c2lA_ | 3.20 | PDB header: transcription/dna/rna | Chain: A: PDB Molecule: rnap1; |
Added to library: Sat Feb 3 08:16:07 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | T | I | E | H | Q | M | H | L | E | K | L | Y | N | K | N | Q | L | L | P | R | M | R | Q | E | F | E | E | N | S | G | I | D | F | K | A | F | F | A | H | I | G | I | D | Y | K | F | G | I | D | A | M | V | Q | M | A | L | H | K | R | A | D | L | P | T | L | V | G | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | H | H | C | K | S | A | Q | E | V | A | D | N | L | F | K | M | A | S | E | D | C | F | N | F | D | P | T | I | D | K | F | I | V | I | Y | T | I | S | D | D | V | Q | H | E | L | D | S | F | Q | Y | P | L | P | M | V | V | R | P | K | L | L | T | K | N | Y | G | T | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | B | S | S | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | T | C | N | K | S | V | I | L | K | K | N | H | T | D | D | D | I | C | L | D | H | L | N | R | M | N | K | I | P | L | S | I | N | W | D | V | A | H | M | V | K | N | E | W | A | N | A | F | Q | K | Y | D | R | T | A | H | E | V | M | G | L | L | T | Q | E | G | N | K | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | |||||||||||
Sequence | Y | L | T | H | R | P | D | K | R | G | R | T | Y | S | Q | G | Y | H | V | N | Y | Q | G | T | S | W | N | K | A | V | L | E | F | A | E | K | E | V | I | D | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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