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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6b4cH_ | 2.80 | PDB header: antiviral protein | Chain: H: PDB Molecule: viperin; |
Added to library: Sat Jul 28 08:31:15 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | Q | V | P | V | S | V | N | Y | H | F | S | R | K | C | T | T | S | H | V | E | K | P | E | N | A | K | R | G | L | T | L | L | K | Q | A | G | M | K | K | I | N | F | A | G | G | E | P | F | L | Y | P | K | F | L | G | E | M | I | D | F | C | K | E | T | L | Q | L | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | S | I | V | T | N | G | S | L | V | K | E | Q | F | L | Q | K | H | G | R | N | I | D | I | L | A | V | S | C | D | S | F | N | E | A | T | N | I | K | I | G | R | G | S | G | D | N | V | Q | K | L | Y | E | I | G | S | W | C | Q | K | Y | D | I | K | F | K | L | N | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | S | S | S | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | N | K | F | N | H | L | E | D | M | N | D | H | L | N | A | L | Q | P | F | R | W | K | C | F | Q | V | L | I | V | T | L | R | N | A | H | S | L | T | I | S | D | D | E | F | D | R | F | C | E | R | H | S | S | Q | T | C | L | V | P | E | P | N | R | L | M | A | K | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | L | I | L | D | E | Y | M | R | F | L | D | R | N | G | Q | Q | P | S | K | S | I | L | E | V | G | V | Q | Q | A | L | Q | A | V | F | W | D | E | E | A | F | V | E | R | G | G | I | Y | D | W | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | B | T | T | S | S | B | T | T | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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