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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5yl1A_ | 3.12 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: capsid protein; |
Added to library: Sat Dec 22 08:37:14 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | S | R | L | G | P | D | S | D | F | L | T | S | V | V | A | K | A | S | T | S | I | V | T | P | A | D | R | I | L | V | K | Q | P | L | S | A | S | S | F | P | G | T | R | I | T | G | L | S | S | Y | W | E | R | Y | K | W | L | S | A | V | A | R | Y | V | P | A | V | P | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | V | A | C | Q | F | V | M | Y | I | D | T | D | P | L | D | D | P | S | N | I | S | D | D | N | Q | I | V | R | Q | A | V | S | Q | A | G | S | N | Q | F | N | F | N | T | S | K | T | V | P | L | I | V | R | A | D | N | Q | Y | Y | Y | T | G | V | D | K | Q | N | L | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | T | T | G | G | G | S | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . |
Sequence | S | L | Q | G | I | L | Y | I | I | Q | V | T | D | L | I | N | F | N | G | E | L | I | T | Q | D | L | T | C | G | S | L | F | L | D | W | L | V | N | F | S | I | P | Q | I | N | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | T | T | S | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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