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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5me4A_ | 1.52 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: probable phosphite transport system-binding protein htxb; |
Added to library: Sat Dec 2 08:19:35 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | K | L | H | L | R | F | A | I | A | P | M | R | P | T | P | S | Q | T | I | K | E | F | E | P | I | F | K | Y | L | A | D | Q | L | G | A | T | Y | E | I | V | S | P | E | S | W | A | A | I | S | V | A | M | T | N | G | H | V | D | V | G | W | L | G | P | W | G | Y | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | N | K | K | A | G | T | E | V | L | A | T | V | K | Y | R | G | E | P | F | Y | K | A | L | I | V | G | R | A | D | L | P | I | K | K | W | P | E | D | A | K | G | L | K | L | S | L | S | D | Q | G | N | T | S | G | W | L | I | P | M | A | Y | F | K | S | I | G | I | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | S | Y | F | E | Y | R | E | G | A | T | F | G | Q | N | E | S | Q | I | Q | H | G | L | I | D | L | G | S | D | M | D | R | G | R | N | G | M | I | E | A | G | Q | I | D | P | S | K | S | K | I | V | W | E | S | S | K | L | P | N | D | A | I | S | V | P | K | D | F | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | A | L | K | A | R | I | T | E | I | L | T | S | L | S | E | E | K | A | Q | S | L | M | G | S | G | Y | N | G | F | V | K | A | K | H | S | D | Y | K | V | I | E | D | A | G | R | I | L | G | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | G | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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