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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4h56M_ | PDB header: toxin | Chain: M: PDB Molecule: necrotic enteritis toxin b; | PDBTitle: crystal structure of the clostridium perfringens netb toxin in the2 membrane inserted form |
Added to library: Wed Jan 9 14:50:39 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | A | I | K | Y | T | S | S | D | T | A | S | H | K | G | W | K | A | T | L | S | G | T | F | I | E | D | P | H | S | D | K | K | T | A | L | L | N | L | E | G | F | I | P | S | D | K | Q | I | F | G | S | K | Y | Y | G | K | M | K | W | P | E | T | Y | R | I | N | V | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | V | N | N | N | I | K | I | A | N | S | I | P | K | N | T | I | D | K | K | D | V | S | N | S | I | G | Y | S | I | G | G | N | I | S | V | E | G | K | T | A | G | A | G | I | N | A | S | Y | N | V | Q | N | T | I | S | Y | E | Q | P | D | F | R | T | I | Q | R | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | A | N | L | A | S | W | D | I | K | F | V | E | T | K | D | G | Y | N | I | D | S | Y | H | A | I | Y | G | N | Q | L | F | M | K | S | R | L | Y | N | N | G | D | K | N | F | T | D | D | R | D | L | S | T | L | I | S | G | G | F | S | P | N | M | A | L | A | L | T | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | B | T | T | B | S | S | S | S | S | T | G | G | G | B | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | K | N | A | K | E | S | V | I | I | V | E | Y | Q | R | F | D | N | D | Y | I | L | N | W | E | T | T | Q | W | R | G | T | N | K | L | S | S | T | S | E | Y | N | E | F | M | F | K | I | N | W | Q | D | H | K | I | E | Y | Y | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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