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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4dgwC_ | PDB header: splicing | Chain: C: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor prp11; | PDBTitle: crystal structure of the sf3a splicing factor complex of u2 snrnp |
Added to library: Wed Jan 9 22:47:58 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | G | S | V | G | X | A | I | Q | V | N | Y | S | S | E | V | K | E | N | S | V | D | S | D | D | K | A | K | V | P | P | L | I | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | B | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | S | G | L | E | L | S | D | T | K | Q | K | G | K | K | F | L | V | I | A | Y | E | P | F | E | N | I | A | I | E | L | P | P | N | E | I | L | F | S | E | N | N | D | X | D | N | N | N | D | G | V | D | E | L | N | K | K | C | T | F | W | D | A | I | S | K | L | Y | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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