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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4b8cD_ | PDB header: hydrolase/cell cycle | Chain: D: PDB Molecule: glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional | PDBTitle: nuclease module of the yeast ccr4-not complex |
Added to library: Wed Jan 9 20:35:29 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | N | A | S | N | P | L | L | H | P | H | L | D | D | P | S | L | L | N | N | P | I | W | K | L | Q | L | H | L | A | A | V | S | A | Q | S | L | G | Q | P | N | I | Y | A | R | Q | N | A | M | K | K | Y | L | C | T | K | Q | A | L | M | E | M | A | D | T | L | T | D | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | G | G | G | T | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | K | D | D | Q | L | W | H | A | L | D | L | S | N | L | Q | I | F | N | I | S | A | N | I | F | K | Y | D | F | L | T | R | L | Y | L | N | G | N | S | L | T | E | L | P | A | E | I | K | N | L | S | N | L | R | V | L | D | L | S | H | N | R | L | T | S | L | P | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | S | G | G | G | G | G | S | S | B | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | G | S | C | F | Q | L | K | Y | F | Y | F | F | D | N | M | V | T | T | L | P | W | E | F | G | N | L | C | N | L | Q | F | L | G | V | E | G | N | P | L | E | K | Q | F | L | K | I | L | T | E | K | S | V | T | G | L | I | F | Y | L | R | D | N | R | P | E | I | P | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | E | T | L | C | Q | H | Y | A | T | P | K | M | Y | R | Y | T | P | S | W | A | L | S | W | D | Y | R | R | N | K | L | K | E | Q | I | L | S | Y | D | S | D | L | L | C | L | Q | V | E | S | K | T | F | E | E | Y | W | V | P | T | G | I | F | V | D | G | C | C | I | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | L | P | F | T | N | F | T | P | S | F | T | D | V | I | E | V | D | P | E | Y | V | S | K | F | I | G | F | P | N | D | K | F | P | S | D | H | I | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | B | T | T | S | S | S | S | B | T | T | B | S | S | B |
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