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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3zn5D_ | PDB header: viral protein | Chain: D: PDB Molecule: vp16; | PDBTitle: vp16, a capsid protein of bacteriophage p23-77 (vp16-virus-derived) |
Added to library: Sat May 25 08:32:36 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | E | A | F | N | R | I | K | A | L | R | P | G | A | R | P | A | T | I | L | R | S | G | P | E | F | S | V | Y | S | G | T | Q | R | V | K | V | G | E | F | V | V | P | A | G | A | S | W | V | L | P | N | P | V | P | V | I | L | K | L | Y | D | T | G | G | N | Q | L | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | B | B | T | T | S | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | D | V | F | L | A | K | R | T | K | G | F | D | F | P | E | F | L | A | K | V | Q | Y | A | S | Y | Y | D | L | T | E | A | Q | L | R | D | A | K | F | Y | Q | N | I | L | Q | T | L | S | P | L | R | G | V | V | L | R | E | G | D | V | L | E | V | Y | V | E | A | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | V | T | V | N | L | N | D | P | R | T | R | I | E | L | P | I | G | V | D | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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