HHsearch 1.5 NAME c3zn5D_ FAM FILE c3zn5D_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3zn5D_.a3m DATE Sat May 25 08:32:37 2013 LENG 161 match states, 161 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3747 -2.0933 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHCTTCCCCCCCTTSTTCCCCCSCCCEEEEEEECCTTCEEEECSSEECEEECBBTTSCBCCTTCEEEEEEECTTCSSCEEEEEEETHHHHSS CHHHHHSGGGHHHHEECCCCCCCEEECTTCEEEEEEECSTTCCBCTTSTTCEEECCCEEEC >sa_dssp EEDCEEDDEEEEEDEDEEEEEECEDDEEEEDDEDEDCCDDEBDEDBCCDADDDACABABABBEEDECACDEACABAABDDEEEEECCDABEAEADDADEB DCECADDEECDEDBCBEBECEEEBDADDCBBBABBBBBCEECECCDEBEDCCCDCDDDEEE >ss_pred CHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEEEEEECCCEEEECCCHHHEEHEECCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCC CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEEEEEEECCCCEEEECCCCCCEEEEEEEECC >ss_conf 9067888621878884588972787047513323662015641362688568334100110278872655320344543046861477761857642002 3786421589999998515431268626988999983687548970688637897653069 >Consensus qeafxrikxlxPxARPxxIlxsxPxxsxyxGxQRvkvxEfvVPxGxxxxxxNPxxvixKLYxxGxxQlPxttxvflArxxrGfDFxExLakxxYAxYyxL txxQqxDAxfxqxIxxxxsxxxGxxxxEGDxLxixvEsxxgxtVnxndpxtRIexxxxVdN >c3zn5D_ QEAFNRIKALRPGARPATILRSGPEFSVYSGTQRVKVGEFVVPAGASWVLPNPVPVILKLYDTGGNQLPHTTDVFLAKRTKGFDFPEFLAKVQYASYYDL TEAQLRDAKFYQNILQTLSPLRGVVLREGDVLEVYVEAPAGVTVNLNDPRTRIELPIGVDN >UniRef50_C1XTI8(1-153:153) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Meiothermus silvanus DSM 9946 RepID=C1XTI8_9DEIN E=6e-15 s/c=0.54 id=35% cov=93% ---------MNPSAgRPTEIIINDPNASFFAGPQRLRLWEYLVPVGVELKIQNPFRLIAKLYGAGNVQIPASSKLYLARIRRG-DFEiEDLAEIPYAPYF SLTIDQQLDANFAERITHVIenTGRMGYAFDEGDRLAILIEST--LAVDTTNPNNRIQFTGLVNN >UniRef50_Q859S8(2-168:171) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=root RepID=Q859S8_9VIRU E=1e-70 s/c=1.59 id=80% cov=101% QEAFERIKRLRPGARPVTILRSGPEFQAYTGRQRVKVGEFVVPSGATWVFPNPVPVVLKLYDSGGNQLPHTTDVFFARRIRGFDFPEFLVKAQYASYYDL SEAQQRDAKYYQNILQTASPLyaptppQGIVLREGDTLEIYVETDPGITVNLNDSRTRIELPVGVDN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1148 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1148 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1148 0 0 F 4 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1148 0 0 N 5 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1148 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1148 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1148 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1148 0 0 A 9 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 9 0 * * * * * * 1148 0 0 L 10 * * * * * * * * * 741 1315 * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1658 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * 1315 * * 741 * * * * * 11 0 * * * * * * 1658 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1658 0 0 G 13 * * * * * 741 * * * * * * * * * 1315 * * * * 13 0 * * * * * * 1658 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 741 1315 * 0 * * * 1658 1000 0 R 15 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 15 0 * * * * * * 1658 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1658 0 0 A 17 1753 * * * * * * * * * * * * * * * 1315 1730 * * 17 0 * * * * * * 1658 0 0 T 18 * * * 1315 * * * * * * * * * * * * 741 * * * 18 0 * * * * * * 1658 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1658 0 0 L 20 * * * * * * * 1315 * 741 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1658 0 0 R 21 * * * * * * * 1315 * * * * * * 741 * * * * * 21 0 * * * * * * 1658 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * 1315 * * * 741 * * * * 22 0 * * * * * * 1658 0 0 G 23 * * 1315 * * 741 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1658 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1658 0 0 E 25 * * * 741 * * * * * * * 1315 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1658 0 0 F 26 1315 * * * 741 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1658 0 0 S 27 * * * * * * * * * * * * * 1730 * 518 * * * * 27 0 * * * * * * 1658 0 0 V 28 1730 * * * 1315 * * * * * * * * * * * * 1753 * * 28 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 29 * * * * 1315 * * * * * * * * * * * * * * 741 29 0 * * * * * * 1658 0 0 S 30 1315 * * * * * * * * * * * * * * 1753 1730 * * * 30 0 * * * * * * 1658 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1658 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * 1315 * 1730 * 1753 * * * 32 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1658 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1658 0 0 V 35 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * 741 * * 35 0 * * * * * * 1658 0 0 K 36 * * * * * * * * 741 * * * * * 1315 * * * * * 36 0 * * * * * * 1658 0 0 V 37 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * 741 * * 37 0 * * * * * * 1658 0 0 G 38 * * * * * 741 * * * * * * * * * * * * 1315 * 38 0 * * * * * * 1658 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1658 0 0 F 40 * * * * 741 * * * * * * * * * * * * * * 1315 40 0 * * * * * * 1658 0 0 V 41 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * 741 * * 41 0 * * * * * * 1658 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1658 0 0 P 43 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1658 0 0 A 44 1753 * * * * * * * * * * * * * * 1730 * 1315 * * 44 0 * * * * * * 1658 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1658 0 0 A 46 741 * * * * * * * * * * * * * * * * 1315 * * 46 0 * * * * * * 1658 0 0 S 47 * * * 1315 * * * * * * * * * * * 1753 1730 * * * 47 0 * * * * * * 1658 0 0 W 48 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * * 741 * 48 0 * * * * * * 1658 0 0 V 49 * * * * * * * * 1315 * * * * * * * * 741 * * 49 0 * * * * * * 1658 0 0 L 50 * * * * 1730 * * 1315 * 1753 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1658 0 0 P 51 * * * * * * * * * * * * 741 1315 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1658 0 0 N 52 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1658 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1658 0 0 V 54 * * * * 1315 * * * * * * * * * * * * 741 * * 54 0 * * * * * * 1658 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 741 * 1315 * * * * * 55 0 * * * * * * 1658 0 0 V 56 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * 741 * * 56 0 * * * * * * 1658 0 0 I 57 * * * * * * * 518 * * * * * * * * * 1730 * * 57 0 * * * * * * 1658 0 0 L 58 1315 * * * * * * * * 741 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1658 0 0 K 59 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1658 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 1658 0 0 D 62 * * 741 * * 1315 * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1658 0 0 T 63 1315 * * * * * * * * * * * * * * 1730 1753 * * * 63 0 * * * * * * 1658 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1658 0 0 G 65 * * * * * 741 * * * * * 1315 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1658 0 0 N 66 * * * * * * * * * * * 741 * * * * * 1315 * * 66 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1658 0 0 L 68 * * * * * * * 1315 * 741 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1658 0 0 P 69 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1658 0 0 H 70 1315 * * * * * 741 * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1658 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * 1315 741 * * * 71 0 * * * * * * 1658 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * 1315 741 * * * 72 0 * * * * * * 1658 0 0 D 73 * * 741 * * * * * 1315 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1658 0 0 V 74 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * 741 * * 74 0 * * * * * * 1658 0 0 F 75 * * * * 741 * * * * * * * * * * * * * * 1315 75 0 * * * * * * 1658 0 0 L 76 * * * * 1730 * * * * 518 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1658 0 0 A 77 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1658 0 0 K 78 * * * * * * * * 1753 * * * * * 508 * * * * * 78 0 * * * * * * 1658 0 0 R 79 * * * * * * * 1315 * * * * * * 741 * * * * * 79 0 * * * * * * 1658 0 0 T 80 * * * * * * * 1730 * * * * * * 1315 * 1753 * * * 80 0 * * * * * * 1658 0 0 K 81 * * * * * * * * 1753 * * * * * 508 * * * * * 81 0 * * * * * * 1658 0 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 741 * 1315 * * * * 1658 0 0 F 83 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * 0 * 1148 0 1000 D 84 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1658 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1658 0 0 P 86 * * * 1315 * * * * * * * * 741 * * * * * * * 86 741 1315 * 0 * * * 1658 1000 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1658 0 0 F 88 * * 1315 * 741 * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1658 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1658 0 0 A 90 518 * * * * * * * * * * * * * * * * 1730 * * 90 0 * * * * * * 1658 0 0 K 91 * * * 1315 * * * * 741 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1658 0 0 V 92 1730 * * * * * * 1315 * * * * * * * * * 1753 * * 92 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * 1315 741 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 94 0 * * * * * * 1658 0 0 A 95 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1658 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * 1315 * * 741 * * * * 96 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 98 * * * * 1315 * * * * * * * * * * * * * * 741 98 0 * * * * * * 1658 0 0 D 99 * * 741 * * * * * * * * * * * * 1315 * * * * 99 0 * * * * * * 1658 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1658 0 0 T 101 * * * * * * * * * * * * * * * 1730 518 * * * 101 0 * * * * * * 1658 0 0 E 102 * * * 741 * * * 1315 * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1658 0 0 A 103 741 * 1315 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 104 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 104 0 * * * * * * 1658 0 0 L 105 * * * * * * * * * 1753 * * * 508 * * * * * * 105 0 * * * * * * 1658 0 0 R 106 * * * * * * * * * 1315 * * * * 741 * * * * * 106 0 * * * * * * 1658 0 0 D 107 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1658 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1658 0 0 K 109 * * * * * * * * 741 * * 1315 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1658 0 0 F 110 * * * * 518 * * * * * * * * * * * * * * 1730 110 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 111 1315 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 741 111 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 112 * * * 1315 * * * * * * * * * 741 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1658 0 0 N 113 * * * * * * * * * * * 741 * * 1315 * * * * * 113 0 * * * * * * 1658 0 0 I 114 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1658 0 0 L 115 * * * * * * * * * 741 * * * * * * 1315 * * * 115 0 * * * * * * 1658 0 0 Q 116 * * * * * * 1315 * * * * * * 741 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1658 0 0 T 117 * * * * * * * * * * * * * * * * 741 1315 * * 117 0 * * * * * * 1658 0 0 L 118 1730 * * * * * * 1315 * 1753 * * * * * * * * * * 118 741 1315 * 1000 1000 * * 1658 1000 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 741 1315 * * * 119 0 * * * * * * 1658 0 0 P 120 * * * * * 1315 * * * * * * 741 * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1658 0 0 L 121 * * * * * * * * * 741 * * * * 1315 * * * * * 121 518 1730 * 2585 263 * * 1658 1000 0 R 122 * * * * * * * * * * 1315 * * 1730 1753 * * * * * 122 0 * * * * * * 1658 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1658 0 0 V 124 * * * * * * * 1730 * * * * * * * * * 1753 * 1315 124 0 * * * * * * 1658 0 0 V 125 1315 * * * * * * * * * * * * * * * * 741 * * 125 0 * * * * * * 1658 0 0 L 126 * * * * 1315 * * * * 741 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1658 0 0 R 127 * * 1315 * * * * * * * * * * * 741 * * * * * 127 0 * * * * * * 1658 0 0 E 128 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1658 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1658 0 0 D 130 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1658 0 0 V 131 * * * * * * * * * * * * * * 1315 * 1730 1753 * * 131 0 * * * * * * 1658 0 0 L 132 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1658 0 0 E 133 1315 * * 741 * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1658 0 0 V 134 * * * * * * * 508 * * * * * * * * * 1753 * * 134 0 * * * * * * 1658 0 0 Y 135 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * * * * 741 135 0 * * * * * * 1658 0 0 V 136 * * * * * * * 1315 * * * * * * * * * 741 * * 136 0 * * * * * * 1658 0 0 E 137 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1658 0 0 A 138 1753 * * * * * * * * * * * * * * 1315 1730 * * * 138 0 * * * * * * 1658 0 0 P 139 * * 1730 * * * * * * * * * 1753 * * * 1315 * * * 139 741 * 1315 * * * * 1658 0 0 A 140 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 140 0 * * * * * 0 1148 0 1000 G 141 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * 0 * 1148 0 1000 V 142 * * * * * * * 1730 * 1315 * * * * * * * 1753 * * 142 0 * * * * * * 1658 0 0 T 143 1315 * * * * * * * * * * * * * * * 741 * * * 143 0 * * * * * * 1658 0 0 V 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 144 0 * * * * * * 1658 0 0 N 145 * * 1315 * * * * * * * * 741 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1658 0 0 L 146 * * * * * * * * * 741 * * * * * * 1315 * * * 146 0 * * * * * * 1658 0 0 N 147 * * * * * * * * * * * 741 * * * * 1315 * * * 147 0 * * * * * * 1658 0 0 D 148 * * 741 * * * * * * * * 1315 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1658 0 0 P 149 * * * * * * * * * * * * 518 * * 1730 * * * * 149 0 * * * * * * 1658 0 0 R 150 * * * * * * * * * * * 1315 * * 741 * * * * * 150 0 * * * * * * 1658 0 0 T 151 * * * * * * * * * * * 1315 * * * * 741 * * * 151 0 * * * * * * 1658 0 0 R 152 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 152 0 * * * * * * 1658 0 0 I 153 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1658 0 0 E 154 * * * 741 * * * * * * * * * 1315 * * * * * * 154 0 * * * * * * 1658 0 0 L 155 * * * * 1315 * * * * 741 * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1658 0 0 P 156 * * * * * * * * * * * * 741 * * * 1315 * * * 156 0 * * * * * * 1658 0 0 I 157 * * * * * 1315 * 1753 * * * * * * * * * 1730 * * 157 0 * * * * * * 1658 0 0 G 158 * * * * * 741 * * * 1315 * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1658 0 0 V 159 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 159 0 * * * * * * 1658 0 0 D 160 * * 741 * * * * * * * * 1315 * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1658 0 0 N 161 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 161 0 * * 0 * * * 1658 0 0 //