|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c3eudE_ | PDB header: nuclear protein | Chain: E: PDB Molecule: protein shq1; | PDBTitle: structure of the cs domain of the essential h/aca rnp2 assembly protein shq1p |
Added to library: Tue Mar 16 12:03:13 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | X | I | T | P | R | F | S | I | T | Q | D | E | E | F | I | F | L | K | I | F | I | S | N | I | R | F | S | A | V | G | L | E | I | I | I | Q | E | N | X | I | I | F | H | L | S | P | Y | Y | L | R | L | R | F | P | H | E | L | I | D | D | E | R | S | T | A | Q | Y | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | D | E | C | I | N | V | K | V | A | K | L | N | K | N | E | Y | F | E | D | L | D | L | P | T | K | L | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|