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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3a56B_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: protein-glutaminase; | PDBTitle: crystal structure of pro- protein-glutaminase |
Added to library: Sat Aug 28 22:00:25 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | L | K | D | F | G | K | T | V | P | V | G | I | D | E | E | N | G | M | I | K | V | S | F | M | L | T | A | Q | F | Y | E | I | K | P | T | K | E | N | E | Q | Y | I | G | M | L | R | Q | A | V | K | N | E | S | P | V | H | I | F | L | K | P | N | S | N | E | I | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | E | S | A | S | P | E | D | V | R | Y | F | K | T | I | L | T | K | E | V | K | G | Q | T | N | K | L | A | S | V | I | P | D | V | A | T | L | N | S | L | F | N | Q | I | K | N | Q | S | C | G | T | S | T | A | S | S | P | C | I | T | F | R | Y | P | V | D | G | C | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | B | S | S | T | T | B | T | T | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | A | H | K | M | R | Q | I | L | M | N | N | G | Y | D | C | E | K | Q | F | V | Y | G | N | L | K | A | S | T | G | T | C | C | V | A | W | S | Y | H | V | A | I | L | V | S | Y | K | N | A | S | G | V | T | E | K | R | I | I | D | P | S | L | F | S | S | G | P | V | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | A | W | R | N | A | C | V | N | T | S | C | G | S | A | S | V | S | S | Y | A | N | T | A | G | N | V | Y | Y | R | S | P | S | N | S | Y | L | Y | D | N | N | L | I | N | T | N | C | V | L | T | K | F | S | L | L | S | G | C | S | P | S | P | A | P | D | V | S | S | C | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | G | G | G | S | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | B | T | T | B | S | S | S | T | T |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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