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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2xseA_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: thymine dioxygenase jbp1; | PDBTitle: the structural basis for recognition of j-base containing2 dna by a novel dna-binding domain in jbp1 |
Added to library: Sat Apr 2 08:45:34 2011 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | V | S | T | A | V | E | K | K | K | Y | L | D | S | E | F | L | L | H | C | I | S | A | Q | L | L | D | X | W | K | Q | A | R | A | R | W | L | E | L | V | G | K | E | W | A | H | X | L | A | L | N | P | E | R | K | D | F | L | W | K | N | Q | S | E | X | N | S | A | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | L | C | E | V | G | K | Q | V | X | L | G | L | L | G | K | E | V | A | L | P | K | E | E | Q | A | F | W | I | X | Y | A | V | H | L | S | A | A | C | A | E | E | L | H | X | P | E | V | A | X | S | L | R | K | L | N | V | K | L | K | D | F | N | F | D | X | P | P | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | K | R | R | X | E | R | K | Q | R | I | E | E | A | R | R | H | G | X | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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