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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2lftA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: major prion protein; | PDBTitle: human prion protein with e219k protective polymorphism |
Added to library: Thu Jan 10 02:36:39 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | Q | G | G | G | T | H | S | Q | W | N | K | P | S | K | P | K | T | N | M | K | H | M | A | G | A | A | A | A | G | A | V | V | G | G | L | G | G | Y | M | L | G | S | A | M | S | R | P | I | I | H | F | G | S | D | Y | E | D | R | Y | Y | R | E | N | M | H | R | Y | P | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | V | Y | Y | R | P | M | D | E | Y | S | N | Q | N | N | F | V | H | D | C | V | N | I | T | I | K | Q | H | T | V | T | T | T | T | K | G | E | N | F | T | E | T | D | V | K | M | M | E | R | V | V | E | Q | M | C | I | T | Q | Y | K | R | E | S | Q | A | Y | Y | Q | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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