![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 651 | . | . | . | . | . | . | . | . | 660 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 670 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 680 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 690 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 700 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 710 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 720 | . | . | ||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | V | I | G | G | L | A | N | I | A | E | E | Y | A | T | K | R | Y | R | S | N | . | . | . | . | . | V | I | N | W | G | M | L | P | L | Q | M | A | E | V | P | T | F | E | . | . | . | V | G | D | Y | I | Y | I | P | G | I | K | A | A | L | D | N | P | G | T | T | F | K | G | Y | V | I | H | E | D | A | P | V | T |
Template Sequence |   | K | L | V | G | A | A | T | P | L | A | T | S | P | M | . | . | L | M | T | T | T | H | S | G | G | M | A | G | M | K | M | V | P | W | L | T | I | P | A | R | G | T | L | T | L | Q | R | D | G | D | H | V | M | L | M | G | L | K | R | P | L | . | K | V | G | E | T | V | N | I | T | L | K | A | T | D | G | R | T | L |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | B | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | T | T | S | S | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | ![]() | ![]() | T | T | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | . | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | T | T | T | ![]() | |||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | |||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 723 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | E | I | T | L | Y | M | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | N | V | A | A | T | V | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 137 | . | . | 140 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|