Job Description Q46911 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:35:48 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 438 % Identity 17% Template c1f0xA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:d-lactate dehydrogenase; PDBTitle: crystal structure of d-lactate dehydrogenase, a peripheral2 membrane respiratory enzyme. Resolution 1.90 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	I	V	D	Q	L	K	E	I	V	G	A	D	R	V	I	T	D	E	T	V	L	K	K	N	S	I	D	R	F	R	K	F	P	D	I	H	G	I	Y	T	L	P	I	P	A	A	V	V	K	L	G	S	T	E	Q	V	S	R	V	L	N	F	M	N	A	H	K	I	N	G	V	P	R	T	G	A	S	A
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	F	L	N	E	L	A	R	L	V	G	S	S	H	L	L	T	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	S	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G
Template Known Secondary structure														G	G	G													B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S		B	B			S						S	S														T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.										.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		86	.	.	.	90	.	.	.					.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.		.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure										.	.	.	.																																																				.
Query SS confidence										.	.	.	.																																																				.
Query Sequence		T	E	G	G	L	E	T	V	.	.	.	.	V	E	N	S	V	V	L	D	G	S	A	M	N	Q	I	I	N	I	D	I	E	N	M	Q	A	T	A	Q	C	G	V	P	L	E	V	L	E	N	A	L	R	E	K	G	Y	T	T	G	H	S	P	.	Q	S	K	P	L	A	Q	M	G	G	L	V	A	T	R	S
Query Conservation										.	.	.	.																																																				.
Alig confidence										.	.	.	.																				.																																.
Template Conservation																																	.
Template Sequence		L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R	L	D	K	L	H	V	L	G	.	K	G	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S
Template Known Secondary structure		S	S	S	T	T	S			B	S			S	S								T	T								T	.	T	T	T						T	T		B									G	G	G	T				S				G	G	G	G	G	T		B							T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.		.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.																																																	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	G	Q	F	S	T	L	Y	G	A	I	E	D	M	V	V	G	L	E	A	V	L	A	D	G	T	V	T	R	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K	L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T
Template Known Secondary structure				S		T	T	S		S	S			S									T	T	S								S	S	B				S	S										T	T				G	G	G	B				S			S	S		T	T								T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		V	P	R	R	A	A	G	P	D	I	R	H	I	I	I	G	N	E	G	A	L	C	Y	I	T	E	V	T	V	K	I	F	K	F	T	P	E	N	N	L	F	Y	G	Y	I	L	E	D	M	K	T	G	F	N	I	L	R	E	I	M	V	E	.	G	Y	R	P	S	I	A	R	L	Y	D	A	E	D	G	T	Q
Query Conservation																																																																.
Alig confidence																											.									.																												.
Template Conservation																											.									.
Template Sequence		P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A	.	V	R	L	D	T	F	E	A	.	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I
Template Known Secondary structure			S			T	T		G	G	G			S	S	T	T		T	T	S	S					.									.		S	S									S																	S	S			S
Template Predicted Secondary structure																											.									.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.		.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		272	.	.	.	.							.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	F	T	H	F	.	.	.	.	.	.	A	D	G	K	C	V	L	I	F	M	A	E	G	N	P	R	I	A	K	V	T	G	E	G	I	A	E	I	V	A	R	Y	P	Q	C	Q	R	V	D	S	K	L	I	E	T	W	F	N	N	L	N	W	G	P	D	K	V	A	A	E	R	V	Q	I	L	K	T	G	N
Query Conservation							.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation																												.	.
Template Sequence		A	E	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	.	.	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V
Template Known Secondary structure																S									T	T		.	.															S	S																			T	T												T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																												.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.			.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	G	F	T	T	E	V	S	G	C	W	S	C	I	H	E	I	Y	E	S	V	I	N	R	I	R	T	E	F	P	H	A	D	D	I	T	M	L	G	G	H	S	S	H	S	Y	Q	N	G	T	N	M	Y	F	V	Y	D	Y	N	V	V	D	C	K	P	E	E	E	I	D	K	Y	H	N	P	L	N	K	I	I
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.														.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.														.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	.	.	.	.	L	V	H	K	L	Y	Y	G	H	F	M	C	Y	.	.	.	.	.	V	F	H	Q	D	Y	I	V	K	K	G	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	A	L	K	E	Q	M
Template Known Secondary structure													T	T		S			S									T	T	.	.	.	.										T	T	T	T	.	.	.	.	.										T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.														.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480					.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.						.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.										.	.	.	510	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.
Query SS confidence																																																							.
Query Sequence		C	E	E	T	I	R	L	G	G	S	M	V	H	H	H	G	I	G	K	H	R	V	H	W	S	K	L	E	H	G	S	A	W	A	L	L	E	G	L	K	K	Q	F	D	P	N	G	I	M	N	T	G	T	.	I	Y	P	I	E	K
Query Conservation																																																							.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	Y	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G	I	G	K	T	S	K	R	K
Template Known Secondary structure								T	T		B	S		S	S	S			T	T	T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T			B	S	T	T	T	T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.										.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.