Job Description P0AC86 Confidence 98.65% Date Thu Jan 5 11:17:35 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 443 % Identity 16% Template d1rzua_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	L	G	R	L	A	A	C	F	L	D	S	L	A	T	L	G	L	P	G	R	G	Y	G	I	R	Y	D	Y	G	M	F	K	Q	N	I	V	N	G	S	Q	K	E	S	P	D	Y	W	L	E	Y	G	N	P	W	E	F	K	R	H	N	T	R	Y	K	V	R	F	G	G	R	I	Q	Q	E	G	K	K	T
Query Conservation
Alig confidence																											.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	L	A	D	V	V	G	A	L	P	I	A	L	E	A	H	G	V	R	T	R	T	L	I	.	.	P	G	Y	P	A	V	K	A	A	V	T	D	P	V	K	C	F	E	F	T	D	L	L	G	E	K	A	D	L	L	E	V	Q	H	E	R	L	D	L	L	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S															T	T	T								.	.												S								S		S	S	S											T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.			.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	W	I	E	T	E	E	I	L	G	V	A	Y	D	Q	I	I	P	G	Y	D	T	D	A	T	N	T	L	R	L	W	S	A	Q	A	S	S	E	I	N	L	G	K	F	N	Q	G	D	Y	F	A	A	V	E	D	K	N	H	S	E	N	V	S	R	V	L	Y	P	D	D	S	T	Y	S	G	R	E	L	R	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	P	A	Y	Y	E	R	S	G	G	P	Y	L	G	Q	T	G	K	D	Y	P	D	.	.	.	.	.	.	.	N	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S	S		S	S	B		T	T	S	S	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.								.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Q	E	Y	F	L	V	S	S	T	I	Q	D	I	L	S	R	H	Y	Q	L	H	K	T	Y	D	N	L	A	D	K	I	A	I	H	L	N	D	T	H	P	V	L	S	I	P	E	M	M	R	L	L	I	D	E	H	Q	F	S	W	D	D	A	F	E	V	C	C	Q	V	F	S	Y	T	N	H	T	L	M	S
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	F	A	A	L	S	L	A	A	A	R	I	G	A	G	V	L	P	G	W	R	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	M	V	H	A	H	D	W	Q	A	A	M	T	P	V	Y	M	R	Y	A	E	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	S	L	L	T	I	H	N	I	A	F
Template Known Secondary structure																T	T		S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.		S										T	T								S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S		T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130									.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.														.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	L	E	T	W	P	V	D	M	L	G	K	I	L	P	R	H	L	Q	I	I	F	E	I	N	D	Y	F	L	K	T	L	Q	E	Q	Y	P	N	D	T	D	L	L	G	R	A	S	I	I	D	E	S	N	G	R	R	V	R	M	A	W	L	A	V	V	V	S	H	K	V	N	G	V	S	E	L	H	S	N
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Sequence		Q	G	Q	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	I	F	S	K	L	A	L	P	A	H	A	F	G	M	E	G	I	E	Y	Y	N	D	.	.	.	V	S	F	L	K	G	G	L	Q	T	A	T	A	L	S	T	V	S	P	S	Y	A	E
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	G	S				G	G	G	S	S	T	T	T	T			T	T		.	.	.												S					S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.				.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.					.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.
Query Sequence		L	M	V	Q	S	L	F	A	D	F	A	.	.	.	.	K	I	F	P	G	R	F	T	N	V	T	N	G	V	T	P	R	R	W	L	A	V	A	N	P	S	L	S	A	V	L	D	E	H	L	G	R	N	W	R	T	D	L	S	L	L	N	E	L	Q	Q	H	C	D	F	P	M	V	N	H	A	V	H	Q	A
Query Conservation													.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	I	L	T	A	E	F	G	M	G	L	E	G	V	I	G	S	R	A	H	V	L	H	G	I	V	N	G	I	D	A	D	V	W	N	P	A	T	D	H	L	I	H	D	N	Y	S	A	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	S					T	T							T	T	G	G	G								B		T	T	T	S		T	T	T		T	T	S	S	S			B	T	T	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	E	N	K	K	R	L	A	E	Y	I	A	Q	Q	L	N	V	V	V	N	P	K	A	L	F	D	V	Q	I	K	R	I	H	E	Y	K	R	Q	L	M	N	V	L	H	V	I	T	R	Y	N	R	I	K	A	D	P	D	A	K	W	V	P	R	V	N	I	F	G	G	K	A	A	S	A	Y	Y	M	A	K
Query Conservation
Alig confidence		.																			.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																			.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	L	K	N	R	A	L	N	K	K	A	V	A	E	H	F	R	I	D	.	D	D	G	S	P	L	F	C	V	I	S	R	L	T	W	Q	K	G	I	D	L	.	M	A	E	A	V	D	E	I	V	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	R	L	V	V	L	G	A	G	D	V	A	L	E	G	A	L
Template Known Secondary structure		.		T	T													T			.		S	S	S							S		B	S	T	T	T	T				.			T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T									B
Template Predicted Secondary structure		.																			.																						.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.		.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.		.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.										320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	I	I	H	L	I	N	D	V	A	K	V	I	N	N	D	P	Q	I	G	D	K	L	K	V	V	F	I	P	N	Y	S	V	S	L	A	Q	L	I	I	P	A	A	D	L	S	E	Q	I	S	L	A	G	T	E	A	S	G	T	S	N	M	K	F	A	L	N	G	A	L	T	I	G	T	L	D	G	A	N	V
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																														.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																														.	.
Template Sequence		L	A	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	H	H	G	.	.	R	V	G	V	A	I	G	Y	N	E	P	L	S	H	L	M	Q	A	G	C	D	A	I	I	I	P	S	R	F	.	.	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	A	L	R	Y	G	C	I	P	V	V	A	R	T	G	G	L	A
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	.	.	T						S														S							S		.	.		S	S		S									T							S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.																														.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.													.	.	.	.	.			.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		680	.	.	.	.								.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	M	L	D	H	.	.	.	.	.	.	.	V	G	A	D	N	I	F	I	F	G	N	T	A	E	E	V	E	E	L	R	R	Q	G	Y	K	P	R	E	Y	Y	E	K	D	E	E	L	H	Q	V	L	T	Q	I	G	S	G	V	F	S	P	E	D	P	G	R	Y	R	D	L	V	D	S	L	I	N	F	G	D
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Sequence		D	T	V	I	D	A	N	H	A	A	L	A	S	K	A	A	T	G	V	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	V	T	L	D	G	L	K	Q	A	I	R	R	.	.	.
Template Known Secondary structure						B								T	T				B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		S											.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		753	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Y	Q	V	L	A	D	Y	R	S	Y	V	D	C	Q	D	K	V	D	E	L	Y	E	L	Q	E	E	W	T	A	K	A	M	L	N	I	A	N	M	G	Y	F	S	S	D	R	T	I	K	E	Y	A	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	R	Y	Y	H	D	P	K	L	W	T	Q	M	Q	K	L	G	M	K	S	.	.	D	V	S	W	E	K	S	A	G	L	Y	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T														T		.	.			B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template SS confidence
																			437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.			.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470