Job Description P0AC86 Confidence 99.39% Date Thu Jan 5 11:17:35 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 372 % Identity 18% Template c3nb0A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycogen [starch] synthase isoform 2; PDBTitle: glucose-6-phosphate activated form of yeast glycogen synthase Resolution 2.41 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	P	D	D	S	T	Y	S	G	R	E	L	R	L	R	Q	E	Y	F	L	V	S	S	T	I	Q	D	I	L	S	R	H	Y	Q	L	H	K	T	Y	D	N	L	A	D	K	I	A	I	H	L	N	D	T	H	P	V	L	S	I	P	E	M	M	R	L	L	I	D	E	H	Q	F	S	W	D	D	A	F	E
Query Conservation
Alig confidence															.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	V	G	I	P	S	P	E	N	D	F	E	T	.	.	N	D	A	I	L	L	G	Y	T	V	A	W	F	L	G	E	V	A	H	L	D	S	Q	H	.	.	.	.	.	.	A	I	V	A	H	F	H	E	W	L	A	G	V	A	L	P	L	C	R	K	R	R	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S	S					.	.																							S		.	.	.	.	.	.								S	G	G	G		T								T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.																									.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.			.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.							.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.														360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	C	C	Q	V	F	S	Y	T	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	M	S	E	A	L	E	T	W	P	V	D	M	L	G	K	I	L	P	R	H	L	Q	I	I	F	E	I	N	D	Y	F	L	K	T	L	Q	E	Q	Y	P	N	D	T	D	L	L	G	R	A	S	I	I	D	E
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	V	V	T	I	F	T	T	H	A	T	L	L	G	R	Y	L	C	A	S	G	S	F	D	F	Y	N	C	L	E	S	V	D	V	D	H	E	A	G	R	F	G	I	Y	H	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.								S	S								T	S	S	S		S						G	G	G										T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	G	R	R	V	R	M	A	W	L	A	V	V	V	S	H	K	V	N	G	V	S	E	L	H	S	N	L	M	V	Q	S	L	F	A	D	F	A	K	I	F	P	G	R	F	T	N	V	T	N	G	V	T	P	R	R	W	L	A	V	A	N	P	S	L	S	A	V	L	D	E	H	L	G	R	N	W	R	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.										.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.										.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	Y	C	I	E	R	A	A	A	H	S	A	D	V	F	T	T	V	S	Q	I	T	A	F	E	A	E	H	.	.	.	.	.	L	L	K	R	K	P	D	G	I	.	.	L	P	N	G	L	N	V	I	K	F	Q	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.											S	S					S	S										.	.	.	.	.		T	S	S			S			.	.					B						S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.										.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.						.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540				.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.		.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.														.
Query SS confidence																																															.	.	.														.
Query Sequence		D	L	S	L	L	N	E	L	Q	Q	H	C	D	F	P	M	V	N	H	A	V	H	Q	A	K	L	E	N	K	K	R	L	A	E	Y	I	A	Q	Q	L	N	V	V	V	N	.	.	.	P	K	A	L	F	D	V	Q	I	K	R	I	H	.	E	Y	K	R	Q	L	M	N	V	L	H	V	I	T	R	Y	N	R
Query Conservation																																															.	.	.														.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.														.								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	F	Q	N	L	H	A	L	K	K	E	K	I	N	D	F	V	R	G	H	F	H	G	C	F	D	F	D	L	D	N	T	L	Y	F	F	I	A	G	R	Y	E	Y	K	N	K	G	A	D	M	.	F	I	E	A	L	A	R	L	N	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																					T	T	T				S		G	G	G								S	S			T	T	T	T	T				.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.
Template SS confidence
																				280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330		.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.																.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	K	A	D	P	D	A	K	W	V	P	R	V	N	I	F	G	G	K	A	A	S	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	M	A	K	H	I	I	H	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	K	V	S	G	S	K	K	T	V	V	A	F	I	V	M	P	A	K	N	N	S	F	T	V	E	A	L	K	G	Q	A	E	V	R	A	L	E	N	T	V	H	E	V	T	T	S	I	G	K	R	I	F	D	H	A	I	R	Y	P	H	N	G	L	T	T	E	L	P	T	D	L	G	E	L	L	K	S	S
Template Known Secondary structure						T	T																																																						T	T	S	T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
																																					606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630								.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	V	A	K	V	I	N	N	D	P	Q	I	G	D	K	L	K	V	V	F	I	P	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	S	V	S	L	A	Q	L	I	I	P	A	A	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	V	M	L	K	R	R	I	L	A	L	R	R	P	E	G	Q	L	P	P	I	V	T	H	N	M	V	D	D	A	N	D	L	I	L	N	K	I	R	Q	V	Q	L	F	N	S	P	S	D	R	V	K	M	I	F	H	P	E	F	L	N	A	N	N	P	I	L	G	L	D	Y	D	E	F	V	R	G	C	H
Template Known Secondary structure																	T	T					S	B	S				T	T	G	G	G											T					T	T		S								S				T	T		S	S	S												S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
		644	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.							.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	E	Q	I	S	L	A	G	T	E	A	S	G	T	S	N	M	K	F	A	L	N	G	A	L	T	I	G	T	L	D	G	A	N	V	E	M	L	D	H	.	.	.	.	.	.	V	G	A	D	N	I	F	I	F	G	N	T	A	E	E	V	E	E	L	R	R	Q	G	Y	K	P	R	E	Y	Y	E	K	D
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.																																	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	V	F	P	S	Y	.	.	Y	E	P	W	G	Y	T	P	A	E	C	T	V	M	G	V	P	S	I	T	T	N	V	S	G	F	G	S	Y	M	E	D	L	I	E	T	N	Q	A	K	D	Y	G	I	Y	I	V	D	R	R	F	K	A	P	D	E	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	.	.	S	B	S	S										T	T							T	T	B								T	T	S								T	T							S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.			.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
		718	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.
Query SS confidence																																																																													.
Query Sequence		E	E	L	H	Q	V	L	T	Q	I	G	S	G	V	F	S	P	E	D	P	G	R	Y	R	D	L	V	D	S	L	I	N	F	G	D	H	Y	Q	V	L	A	D	Y	R	S	Y	V	D	C	Q	D	K	V	D	E	L	Y	E	L	Q	E	E	W	T	A	K	A	M	L	N	I	A	N	M	G	.	Y	F	S	S
Query Conservation																																																																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	V	D	Y	M	E	E	F	V	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	R	Q	R	I	N	Q	R	N	A	T	E	A	L	S	D	L	L	D	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															G	G	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																					566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		797	.	.	800	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	T	I	K	E	Y	A	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	R	M	G	L	E	Y	V	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		600	.	.	.	.	.	.	.	.