Job Description P00634 Confidence 99.37% Date Wed Jan 25 15:20:09 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 307 % Identity 19% Template c2zktB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate PDBTitle: structure of ph0037 protein from pyrococcus horikoshii Resolution 2.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.									.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	N	I	I	L	L	I	G	D	G	M	G	D	S	E	I	T	A	A	R	N	Y	A	E	G	A	G	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	G	I	D	A	L	P	L	T	G	Q	Y	T	H	Y	A	L	N	K	K	T	G	K	P	D	Y	V	T	D	S	A	A	S	A	T	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	G	L	L	I	I	L	D	G	L	G	D	R	P	I	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	L	N	G	L	T	P	L	E	Y	A	N	T	P	N	M	D	K	L	A	E	I	G	I	L	G	Q	Q	D	P	I	K	.	.	.	.	.	P	G	Q	P	A	G	S	D	T	A	H	L	S	I	F	G	Y	D
Template Known Secondary structure										T	T	B	B				B	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T	T	B						S												S							S	S	S	.	.	.	.	.	T	T													T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20									.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.						.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
				130	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence		.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		.	.	A	W	S	T	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	Y	N	G	A	L	G	V	D	I	H	E	.	K	D	H	P	T	I	L	E	M	A	K	A	A	G	L	A	T	G	N	V	S	T	A	E	L	Q	D	A	T	P	A	A	L	V	A	H	V	T	S
Query Conservation		.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence		.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Y	E	T	Y	R	G	R	G	F	F	E	A	L	G	V	G	L	D	L	S	K	D	D	L	A	F	R	V	N	F	A	T	L	E	N	A	R	A	I	Q	E	E	V	D	I	G	V	D	F	I	F	K	T	G	H	R	A	V	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	G	M	S
Template Known Secondary structure									S								T	T					T	T																																		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.															.	.	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	K	C	Y	G	P	S	A	T	S	E	K	C	P	G	N	A	L	E	K	G	G	K	G	S	I	T	E	Q	L	L	N	A	R	A	D	V	T	L	G	G	G	A	K	T	F	A	E	T	A	T	A	G	E	W	Q	G	K	T	L	R	E	Q	A	Q	A	R	G	Y	Q	L	V	S	D	A	A	S	L	N	S
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	Y	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	N	D	P	H	E	A	G	K	P	P	S	K	K	V	A	E	I	L	E	E	F	V	K	K	A	Q	E	V	L	E	K	H	P	I	N	E	R	R
Template Known Secondary structure		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T		G	G	G																							T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.															.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	E	A	N	Q	Q	K	P	L	L	G	L	F	A	D	G	N	M	P	V	R	W	L	G	P	K	A	T	Y	H	G	N	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	A	V	T	C	T	P	N	P	Q	R	N	D	S	V	P	T	L	A	Q	M	T	D	K	A	I	E	L	L	S
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	K	E	G	K	P	I	A	N	Y	L	L	I	R	G	A	G	T	Y	P	N	I	P	M	K	F	T	E	Q	W	K	V	K	A	A	G	V	I	A	V	A	L	V	K	G	V	A	R	A	V	G	F	D	V	Y	T	P	E	G	A	T	G	E	Y	N	T	N	E	M	A	K	A	K	K	A	V	E	L	L	K
Template Known Secondary structure				T	T															S				S	S							T									S										T	T							T	T			S	S	T	T															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	E	K	G	F	F	L	Q	V	E	G	A	S	I	D	K	Q	D	H	A	A	N	P	C	G	Q	I	G	E	T	V	D	L	D	E	A	V	Q	R	A	L	E	F	A	K	K	E	G	N	T	L	V	I	V	T	A	D	H	A	H	A	S	Q	I	V	A	P	D	T	K	A	P	G	L	T	Q	A	L	N
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.																																											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.																																											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	D	.	.	.	F	V	F	L	H	F	K	P	T	D	A	A	G	H	D	N	K	P	K	L	K	A	E	L	I	E	R	A	D	R	M	I	G	Y	I	L	D	H	V	D	L	E	.	E	V	V	I	A	I	T	G	D	H	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T		S	.	.	.															T	T																					T	T			T	T	.	T								S	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.																																											.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		293	.	.				.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.		.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.						.	450	.	.										.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	K	D	G	A	V	M	V	M	S	Y	G	N	S	E	E	D	S	Q	E	H	T	G	S	Q	L	R	I	A	A	Y	G	P	H	A	.	.	.	.	.	A	N	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	T	D	Q	T	D	L	F	Y	T	M	K	A	A	L	G	L
Query Conservation																																					.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	C	E	V	M	N	H	S	G	D	P	V	P	L	L	I	A	G	G	G	V	R	T	D	D	T	K	R	F	G	E	R	E	A	M	K	G	G	L	G	R	I	R	G	H	D	I	V	P	I	M	M	D	L	M	N	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T	S		B										S	T	T					S			S		S					T	T		T	T					G	G	G									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.