Job Description P00634 Confidence 99.15% Date Wed Jan 25 15:20:09 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 272 % Identity 14% Template c2w5tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:processed glycerol phosphate lipoteichoic acid PDBTitle: structure-based mechanism of lipoteichoic acid synthesis by2 staphylococcus aureus ltas. Resolution 1.60 Å

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		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.						.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	P	A	K	N	I	I	L	L	I	G	D	G	M	G	D	S	E	I	T	A	A	R	N	Y	A	E	G	A	G	G	F	F	K	G	I	D	A	L	P	L	T	G	.	.	.	.	.	Q	Y	T	H	Y	A	L	N	K	K	T	G	K	P	D	Y	V	T	D	S	A	A	S	A	T	A	W	S	T	G	V
Query Conservation																																														.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.																				.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	K	K	K	N	I	I	K	I	H	L	E	S	F	Q	T	F	L	I	N	.	.	.	.	K	K	V	N	G	K	E	V	T	P	F	L	N	K	L	S	S	G	K	E	Q	F	T	Y	F	P	N	F	F	H	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	G	K	T	S	D	S	E	F	T	M	D	N	S	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									T	T			G	G	G	T	T	.	.	.	.				T	T			S	S								T	T		S	S					T	T						.	.	.	.	.	.	.		T	T	T											S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.					.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.								.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
			136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																								.
Query SS confidence		.																								.
Query Sequence		.	K	T	Y	N	G	A	L	G	V	D	I	H	E	K	D	H	P	T	I	L	E	M	A	.	K	A	A	G	L	A	T	G	N	V	S	T	A	E	L	Q	D	A	T	P	A	A	L	V	A	H	V	T	S	R	K	C	Y	G	P	S	A	T	S	E	K	C	P	G	N	A	L	E	K	G	G	K	G	S	I
Query Conservation		.																								.
Alig confidence		.																								.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	L	P	Q	G	S	A	F	S	L	K	G	D	N	T	Y	Q	S	L	P	A	I	L	D	Q	K	Q	G	Y	K	S	D	V	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	D	Y	K	T	F	W	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R
Template Known Secondary structure					S	S	S						S	T	T	S																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		T	T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.																.	.	.	350	.	.	.	.	.																					.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	E	Q	L	L	N	A	R	A	D	V	T	L	G	G	G	A	K	T	F	A	E	T	A	T	A	G	E	W	Q	G	K	T	L	R	E	Q	A	Q	A	R	G	Y	Q	L	V	S	D	A	A	S	L	N	S	V	T	E	A	N	Q	Q	K	P	L	L	G	L	F	A	D	G	N	M	P	V	R	W	L	G	P
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	V	Y	K	H	F	G	I	D	K	F	Y	D	A	T	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T							G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	T	Y	H	G	N	I	D	K	P	A	V	T	C	T	P	N	P	Q	R	N	D	S	V	P	T	L	A	Q	M	T	D	K	A	I	E	L	L	S	K	N	E	K	G	F	F	L	Q	V	E	G	A	S	I	D	K	Q	D	H	A	A	N	P	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	M	S	D	K	N	V	V	N	L	G	L	K	D	K	I	F	F	K	D	S	A	N	Y	Q	A	K	M	K	S	P	F	Y	S	H	L	I	T	L	T	N	H	Y	P	F	T	L	D	E	K	D	A	T	I	E	K	S	N	T	G	D	A	T	V	D	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				G	G	G			T	T																	T	S		S	S									S	S		T	T					G	G	G			S					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.				.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.
Query Sequence		Q	I	G	E	T	V	D	L	D	E	A	V	Q	R	A	L	E	F	A	K	K	E	G	.	.	.	N	T	L	V	I	V	T	A	D	H	A	H	A	S	Q	I	V	A	P	D	T	K	A	P	G	L	T	Q	A	L	N	T	K	D	G	A	V	M	V	M	S	Y	G	N	S	E	E	D	S	Q	E	H	T	G
Query Conservation																									.	.	.
Alig confidence																									.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	I	Q	T	A	R	Y	L	D	E	A	L	E	E	Y	I	N	D	L	K	K	K	G	L	Y	D	N	S	V	I	M	I	Y	G	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	I	S	E	N	H	N	N	A	M	E	K	L	L	G	E	K	I	T	P	A	K	F	T	D	L
Template Known Secondary structure																								T		S	T	T	S								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		G	G	G									T	S										T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.			.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		S	Q	L	R	I	A	A	Y	G	P	H	A	.	.	A	N	V	V	G	L	T	D	Q	T	D	L	F	Y	T	M	K	A	A	L	G	L	K
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	T	G	F	W	I	K	I	P	G	K	S	G	G	I	N	N	E	Y	A	G	Q	V	D	V	M	P	T	I	L	H	L	A	G	I	D
Template Known Secondary structure		T	B								T	T												G	G	G										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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