Job Description P0A6Z1 Confidence 94.82% Date Thu Jan 5 11:04:16 GMT 2012 Rank 104 Aligned Residues 293 % Identity 18% Template c2q2rA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glucokinase 1, putative; PDBTitle: trypanosoma cruzi glucokinase in complex with beta-d-glucose and adp Resolution 2.10 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	L	L	Q	I	S	E	P	G	L	S	A	A	P	H	Q	R	R	L	A	A	G	I	D	L	G	T	T	N	S	L	V	A	T	V	R	S	G	Q	A	E	T	L	A	D	H	E	G	R	H	L	L	P	S	V	V	H	Y	Q	Q	Q	G	H	S	V	G	Y	D	A	R	T	N	A	A	L	D	T	A	N
Query Conservation
Alig confidence																		.																												.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																												.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	L	H	E	L	C	E	E	L	K	T	P	A	W	N	.	A	P	L	T	F	V	G	D	V	G	G	T	S	A	R	M	G	F	V	R	E	G	K	N	D	S	V	.	.	.	.	.	.	H	A	C	V	T	R	Y	S	M	K	R	K	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T	S	G	G	G		.	S										S	S											G	G	G			.	.	.	.	.	.										T	T		B	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.																												.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.							.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	S	S	V	K	R	L	M	G	R	S	L	A	D	I	Q	Q	R	Y	P	H	L	P	Y	Q	F	Q	A	S	E	N	G	L	P	M	I	E	T	A	A	G	L	L	N	P	V	R	V	S	A	D	I	L	K	A	L	A	A	R	A	T	E	A	L	A	G	E	L	D	G	V	V	I	T	V	P	A	Y	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	I	I	E	F	F	N	E	I	I	E	L	M	P	A	S	V	M	K	R	V	K	A	G	V	I	N	V	P	G	P	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G												S						T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																	63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.												.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	A	Q	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	T	K	D	A	A	R	L	A	G	L	H	V	L	R	L	L	N	E	P	T	A	A	A	I	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	D	S	G	Q	E
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	G	A	V	G	G	P	F	N	N	L	K	G	I	A	R	L	S	D	Y	P	K	A	L	F	P	P	G	H	S	A	I	L	N	D	L	E	A	G	G	F	G	V	L	A	V	S	D	A	H	V	F	S	E	Y	F	G	V	M	W	E	G	T	Q	W	R	T	C	E	Q	E	P	A	G	S	V	I	G	R
Template Known Secondary structure			T	T	T						S	S	S	B	S				G	G	G	S		T	T	T	S		T	T	S																				T	T													T	T	T	T	T	T		S	S		T	T	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	I	A	V	Y	D	L	G	G	G	T	F	D	I	S	I	L	R	L	S	R	G	V	F	E	V	L	A	T	G	G	D	S	A	L	G	G	D	D	F	D	H	L	L	A	D	Y	I	R	E	Q	A	G	I	P	D	R	S	D	N	R	V	Q	R	E	L	L	D	A	A	I	A	A	K	I	A	L	S	D
Query Conservation
Alig confidence															.																																																																.	.	.
Template Conservation															.																																																																.	.	.
Template Sequence		G	R	C	L	V	L	A	P	G	T	G	L	G	.	S	S	L	I	Y	Y	N	P	Q	H	I	V	V	P	L	E	L	G	S	Q	T	L	P	M	R	K	D	I	D	Y	I	Q	T	L	H	A	E	L	K	L	F	P	N	Y	E	N	M	V	S	G	A	G	L	E	F	H	Y	R	Q	V	V	R	G	.	.	.
Template Known Secondary structure		S								S	S	S			.																	G	G	G	S	B				S	S													T	S			B					S	S													T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.																																																																.	.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.		.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.								.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.									340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	D	S	V	T	V	N	V	A	G	W	Q	G	E	I	S	R	E	Q	F	N	E	L	I	A	.	.	.	.	.	.	.	P	L	V	K	R	T	L	L	A	C	R	R	A	L	K	D	A	G	V	E	A	D	E	V	L	E	V	V	M	V	G	G	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	L	V	R
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																				.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	P	P	C	S	A	G	E	I	A	K	L	A	S	E	G	D	A	N	A	C	K	A	M	K	K	Y	H	E	Y	L	M	R	V	G	S	E	A	S	M	.	A	L	L	P	L	T	I	V	L	V	G	D	N	I	V	N	N	A	F	F	Y	R	N	P	Q	N	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S														T	T																									.					S						S						T						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Template SS confidence
												255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.												.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	V	G	E	F	F	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	L	T	S	I	D	P	D	K	V	V	A	I	G	A	A	I	Q	A	D	I	L	V
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	M	H	H	E	A	L	N	H	E	M	E	R	F	G	F	Q	S	R	V	S	Y	L	R	Q	K	K	L	L	N	L	N	L	M	G	C	Y	R	C	G	L	D	L	S
Template Known Secondary structure								T		S	G	G	G	G	G	T	S	G	G	G								S																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low