Job Description P0A769 Confidence 98.07% Date Thu Jan 5 11:04:58 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 381 % Identity 13% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.			50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.									.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	I	A	A	I	G	Y	I	D	P	G	N	F	A	T	N	I	Q	A	G	A	S	F	G	.	.	Y	Q	L	L	W	V	V	V	W	A	N	L	M	A	M	L	I	Q	I	L	S	A	K	L	G	I	A	T	G	K	N	L	A	E	Q	I	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	P	R	P	V	V	W
Query Conservation																										.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A	Q	G	H	G	T	T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R	N	R	F	A	K	I	L	G	V
Template Known Secondary structure									S	S					T									T	T	T														T																	T	T	T			S									S		S								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	Y	W	V	Q	A	E	I	I	A	M	A	T	D	L	A	E	F	I	G	A	A	I	G	F	K	L	I	L	G	V	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	G	A	V	L	T	G
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P	S	L	F	A	Y	I	V	F	L	I	T	M	F
Template Known Secondary structure																															T																										T			S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.				.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.
Query Sequence		I	A	T	F	L	I	L	M	L	Q	R	R	G	Q	K	P	L	E	K	V	I	G	G	L	L	L	F	V	A	A	A	Y	I	V	E	L	I	F	S	Q	P	.	.	.	N	L	A	Q	L	G	K	G	M	V	I	P	S	L	P	T	S	E	A	V	F	L	A	A	G	V	L	G	A	T	I	M	P	H	V	I
Query Conservation																																											.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W	I	A	A	V	G	Q	I	F	F	T	L	S	L
Template Known Secondary structure								T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T	T																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.					.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.						.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	H	S	S	L	T	Q	H	L	H	G	G	S	R	Q	Q	R	Y	S	A	T	K	W	D	V	A	I	A	M	T	I	A	G	F	V	N	L	A	M	M	A	T	A	A	A	A	F	H	F	S	G	H	T	.	.	.	.	G	V	A	D	L	D	E	A	Y	L	T	L	Q	P	L	L	.	.	.	.	.	S
Query Conservation																																																								.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																								.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G	A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	A	I	F	S	Q	T	A	G	G
Template Known Secondary structure		T	S	S							T	T	S		T	T	S																			T	T																										S	S					T							T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	A	A	T	V	F	G	L	S	L	V	A	A	G	L	S	S	T	V	V	G	T	L	A	G	Q	V	V	M	Q	G	F	I	R	F	H	I	P	L	W	V	R	R	T	V	T	M	L	P	S	F	I	V	I	L	M	G	L	D	P	T	R	I	L	V	M	S	Q	V	L	L	S	F	G	I	A	L	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																					.
Template Conservation																																					.
Template Sequence		T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	K	.	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A	I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L	D	E	M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G
Template Known Secondary structure																																		T	S		.																								B	T	T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
		365	.	.	.	.	370	.												.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	P	L	L	I	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	S	K	L	M	G	D	L	V	N	S	K	R	V	K	Q	T	G	W	V	I	V	V	L	V	V	A	L	N	I	W	L	L	V	G
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E	E	I	N	R	G	G	I	I	K	V	P	R	I	Y	Y	Y	V	M	R	Y	I	T	P	A	F	L	A	V	L	L	V	V	W	A	R	E
Template Known Secondary structure										T	T	S											T	T		S	S				T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470