Job Description P77585 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:48 GMT 2012 Rank 39 Aligned Residues 329 % Identity 15% Template c1lfwA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:pepv; PDBTitle: crystal structure of pepv Resolution 1.80 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20													.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	L	L	K	A	L	S	E	A	D	A	I	A	S	S	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	R	Q	I	L	L	E	E	A	D	R	L	Q	K	E	V	R	F	D	G	L	G	S	V	L	I	R	L	N	E	S	T	G	P	K	V	M	I	C	A	H	M	D	E	V	G	F	M	V
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		L	K	D	L	E	E	L	I	A	I	D	S	S	E	D	L	E	N	A	T	E	E	Y	P	V	G	K	G	P	V	D	A	M	T	K	F	L	S	F	A	K	R	D	G	F	D	T	E	N	F	A	N	Y	A	G	R	V	N	F	G	A	G	D	.	K	R	L	G	I	I	G	H	M	D	V	V	P	A	G	E
Template Known Secondary structure										T	S			B			G	G	G			S	S	S	T	T																		T	T							T	T	T										S	.	S										B					S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
		71									.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.						.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Query Sequence		R	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	S	R	E	G	A	I	D	V	L	P	V	G	N	V	R	M	A	A	R	Q	L	Q	P	V	R	I	T	T	.	.	.	.	.	R	E	E	C	K	I	P	G	L	L	D	G	D	R	Q	G	N	D	V	S	A	M	R	V	D	I	G	A	R	S	Y	D	E	V	M	Q
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	W	T	R	D	P	F	K	M	E	I	D	E	E	G	R	I	Y	G	R	G	S	A	D	D	K	G	P	S	L	T	A	Y	Y	G	M	L	L	L	K	E	A	G	F	K	P	K	K	K	I	D	F	V	L	G	T	N	E	E	T	N	W	V	G	I	D	Y	Y	L	K	H	E	P	T	P	D	I	V	F	S
Template Known Secondary structure				S	S		T	T	S					T	T					S	T	T	S	S	S	S																		T				S	S								S		T	T	T	T											S				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		138	.																																																																								140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	P	G	D	R	V
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	A	E	Y	P	I	I	N	G	E	Q	G	I	F	T	L	E	F	S	F	K	N	D	D	T	K	G	D	Y	V	L	D	K	F	K	A	G	I	A	T	N	V	T	P	Q	V	T	R	A	T	I	S	G	P	D	L	E	A	V	K	L	A	Y	E	S	F	L	A	D	K	E	L	D	G	S	F	E	I	N
Template Known Secondary structure		S	S			S	S																							S	B									S	B	T	T	B			S									S																	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	F	D	T	T	F	Q	V	L	P	H	Q	R	V	M	G	K	A	F	D	D	R	L	G	C	Y	L	L	V	T	L	L	R	E	L	H	D	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	A	E	V	W	L	V	A	S	S	S	E	E	V	G	L	R	G	G	Q	T	A
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	S	A	D	I	V	L	I	G	Q	G	A	H	A	S	A	P	Q	V	G	K	N	S	A	T	F	L	A	L	F	L	D	Q	Y	A	F	A	G	R	D	K	N	F	L	H	F	L	A	E	V	E	H	E	D	F	Y	G	K	K	L	G	I	F	H	H	D	D	L	M	G	D	L	A	S	S	P	S	M	F
Template Known Secondary structure		T	T									B			B	T	T		G	G	G	S	B											T	T	S		B														T	T	T	T		T	T	S	T	T	T	T						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.			.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.					.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.																	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.																	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	A	V	S	P	D	V	A	I	V	L	D	T	A	C	W	A	K	N	F	D	Y	G	A	A	N	H	R	Q	.	.	I	G	N	G	P	M	L	V	L	S	D	K	S	L	I	A	.	.	.	.	P	P	K	L	T	A	W	V	E	T	V	A	A	E	I	G	V	P	L	Q	A	D	M	F	S	N	G	G
Query Conservation																																.	.																	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.																	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	E	H	A	G	K	A	S	L	L	N	N	V	R	Y	P	Q	G	T	D	P	D	T	M	I	K	Q	V	L	D	K	F	S	G	I	L	D	V	T	Y	N	G	F	E	E	P	H	Y	V	P	G	S	D	P	M	V	Q	T	L	L	K	V	Y	E	K	Q	T	G	K	P	G	H	E	V	V	I	G	G	G
Template Known Secondary structure					T	T	S												T	T															T	T	T						S			B							T	T																									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.		.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.
Query SS confidence																							.
Query Sequence		T	D	G	G	A	V	H	L	T	G	T	G	V	P	T	V	V	M	G	P	A	.	T	R	H	G	H	C	A	A	S	I	A	D	C	R	D	I	L	Q	M	Q	Q	L	L	S	A	L	I	Q	R	L	T	R
Query Conservation																							.
Alig confidence									.	.	.												.
Template Conservation									.	.	.
Template Sequence		T	Y	G	R	L	F	E	.	.	.	R	G	V	A	F	G	A	Q	P	E	N	G	P	M	V	M	H	A	A	N	E	F	M	M	L	D	D	L	I	L	S	I	A	I	Y	A	E	A	I	Y	E	L	T	K
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	S	T	.	.	.	T									T	T					T	T	S	T	T																								S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.
Template SS confidence
		416	.	.	.	420	.	.				.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.