Job Description P61889 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:07:26 GMT 2012 Rank 71 Aligned Residues 295 % Identity 18% Template c1obbB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-glucosidase; PDBTitle: alpha-glucosidase a, agla, from thermotoga maritima in2 complex with maltose and nad+ Resolution 1.90 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.				.	.	.	30	.	.	.	.	.	.		.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.											.																				.	.
Query SS confidence																												.	.	.											.																				.	.
Query Sequence		M	K	V	A	V	L	G	A	A	G	G	I	G	Q	A	L	A	L	L	L	K	T	Q	L	P	S	.	.	.	G	S	E	L	S	L	Y	D	I	A	.	P	V	T	P	G	V	A	V	D	L	S	H	I	P	T	A	V	K	I	.	.	K	G	F	S	G	E	D	A	T	P	A	L	E	G	A	D	V	V	L
Query Conservation																												.	.	.											.																				.	.
Alig confidence									.																			.	.	.											.																				.	.
Template Conservation									.
Template Sequence		V	K	I	G	I	I	G	.	A	G	S	A	V	F	S	L	R	L	V	S	D	L	C	K	T	P	G	L	S	G	S	T	V	T	L	M	D	I	D	E	E	R	L	D	A	I	L	T	I	A	K	K	Y	V	E	E	V	G	A	D	L	K	F	E	K	T	M	N	L	D	D	V	I	I	D	A	D	F	V	I
Template Known Secondary structure								T	.	T	T														T		G	G	G	T	T								S																				T									S							T	T		S
Template Predicted Secondary structure									.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		75	.	.																			.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.									.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	A	R	K	P	G	M	D	R	S	D	L	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	A	G	I	V	K	N	L	V	Q	Q	V	A	K	T	C	P	K	A	C	I	G	I	I	T	N	P	V	N	T	T	V	A	I	A
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	T	A	M	V	G	G	H	T	Y	L	E	K	V	R	Q	I	G	E	K	Y	G	Y	Y	R	G	I	D	A	Q	E	F	N	M	V	S	D	Y	Y	T	F	S	N	Y	N	Q	L	K	Y	F	V	D	I	A	R	K	I	E	K	L	S	P	K	A	W	Y	L	Q	A	A	N	P	I	F	E	G	T	T	L	V
Template Known Secondary structure						T	T															T	T		T	T		T	T		B	T	T	B			T	T			S	S	S																				T	T	S						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	V	L	K	K	A	G	V	Y	D	K	N	K	L	F	G	V	T	T	L	D	I	I	R	S	N	T	F	V	A	E	L	K	G	K	Q	P	G	E	V	E	V	P	V	I	G	G	H	S	G	V	T	I	L	P	L	L	S	Q	V	P	G	V	S	F	T	E	Q	E	V	A	D	L	T	K	R	I	Q	N
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.						.	.	.								.	.	.																												.	.
Template Conservation			.	.	.	.						.	.	.								.	.	.																												.	.
Template Sequence		T	.	.	.	.	R	T	V	P	I	.	.	.	K	A	V	G	F	H	G	.	.	.	H	Y	G	V	M	E	I	V	E	K	L	G	L	E	E	E	K	V	D	W	Q	V	A	G	V	N	H	.	.	G	I	W	L	N	R	F	R	Y	N	G	G	N	A	Y	P	L	L	D	K	W	I	E	E	K	S	K	D
Template Known Secondary structure			.	.	.	.			S		S	.	.	.							G	.	.	.	G	G										T			G	G	G									T	T	.	.										T	T															G	G	G
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.						.	.	.								.	.	.																												.	.
Template SS confidence
		163					.	.	.	.	.				.	170	.	.	.	.	.				.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.			.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
															209	210	.	.	.	.	.	.										.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	T	E	V	V	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	G	G	G	S	A	T	L	S	M	G	Q	A	A	A	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	K	P	E	N	P	F	N	D	Q	L	S	P	A	A	I	D	M	Y	R	F	Y	G	V	M	P	I	G	D	T	V	R	N	S	S	W	R	Y	H	R	D	L	E	T	K	K	K	W	Y	G	E	P	W	G	G	A	D	S	E	I	G	W	K	W	Y	Q	D	T	L	G	K	V	T	E	I	T	K	K	V	A
Template Known Secondary structure					S	S	T	T			T	T	S											S	S				G	G	G	G	T				G	G	G	G	S	S										T	T	T		S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
																																														235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.						.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	S	L	V	R	A	L	Q	G	E	Q	G	V	V	E	C	A	Y	V	E	G	D	G	.	.	.	.	.	Q	Y	A	R	F	F	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	F	I	K	E	N	P	S	V	R	L	S	D	L	G	S	V	L	G	K	D	L	S	E	K	Q	F	V	L	E	V	E	K	I	L	D	P	E	R	K	S	G	E	Q	H	I	P	F	I	D	A	L	L	N	D	N	K	A	R	F	V	V	N	I	P	N	K	G	I	I	H	G	I	D	D	D	V	V	V	E
Template Known Secondary structure							S	T	T	S		G	G	G	G	G	G	G	S	T	T																S		S	S					S																							T	T	S	S	T	T	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290		.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		Q	P	L	L	L	G	K	N	G	V	E	E	R	K	S	I	G	T	L	S	A	F	E	Q	N	.	A	L	E	G	M	L	D	T	L	K	K	D	I	A	L	G	E	E
Query Conservation																											.
Alig confidence																											.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	A	L	V	D	K	N	G	I	H	P	E	K	I	E	P	P	L	P	D	R	V	V	K	Y	Y	L	R	P	R	I	M	R	M	E	M	A	L	E	A	F	L	T
Template Known Secondary structure								T	T								S	S										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low