Job Description P33363 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:06 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 661 % Identity 33% Template c3ac0B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:beta-glucosidase i; PDBTitle: crystal structure of beta-glucosidase from kluyveromyces marxianus in2 complex with glucose Resolution 2.54 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		V	T	E	L	L	K	K	M	T	V	D	E	K	I	G	Q	L	R	L	I	S	V	G	P	D	N	P	K	E	A	I	R	E	M	I	K	D	G	Q	V	G	A	I	F	N	T	V	T	R	Q	D	I	R	A	M	Q	D	Q	V	M	E	L	S	R	L	K	I	P	L	F	F	A	Y	D	V	L	H	G	Q	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	E	Q	L	L	S	E	L	N	Q	D	E	K	I	S	L	L	S	A	V	D	F	W	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	K	K	I	E	R	L	G	I	P	A	V	R	V	S	D	G	P	N	G	I	R
Template Known Secondary structure																	T	T	B		S	S	S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B	G	G	G	T	B				B					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.
											117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	V	F	P	I	S	L	G	L	A	S	S	F	N	L	D	A	V	K	T	V	G	R	V	S	A	Y	E	A	A	D	D	G	L	N	M	T	W	A	P	M	V	D	V	S	R	D	P	R	W	G	R	A	S	E	G	F	G	E	D	T	Y	L	T	S	T	M	G	K	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	K	F	F	D	G	V	P	S	G	C	F	P	N	G	T	G	L	A	S	T	F	D	R	D	L	L	E	T	A	G	K	L	M	A	K	E	S	I	A	K	N	A	A	V	I	L	G	P	T	T	N	M	Q	R	G	P	L	G	G	R	G	F	E	S	F	S	E	D	P	Y	L	A	G	M	A	T	S	S
Template Known Secondary structure			S		S	T	T				B											T	T																			T	T	T		S						B					S	S	T	T		T	T	T	T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.
Query SS confidence																																																											.
Query Sequence		M	V	E	A	M	Q	G	K	S	P	A	D	R	Y	S	V	M	T	S	V	K	H	F	A	A	Y	G	A	V	E	G	G	K	E	Y	N	T	V	D	M	S	P	Q	R	L	F	N	D	Y	M	P	P	Y	K	A	G	L	.	D	A	G	S	G	A	V	M	V	A	L	N	S	L	N	G	T	P	A	T	S	D
Query Conservation																																																											.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.															.																													.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		V	V	K	G	M	Q	G	E	.	.	.	.	.	.	G	I	A	A	T	V	K	H	F	V	C	N	D	L	.	E	D	Q	R	F	S	S	N	S	I	V	S	E	R	A	L	R	E	I	Y	L	E	P	F	R	L	A	V	K	H	A	N	P	V	C	I	M	T	A	Y	N	K	V	N	G	E	H	C	S	Q	S
Template Known Secondary structure									T	.	.	.	.	.	.	T									T	T				.		T	T	T	T	T													T	T	S													S						S	S			T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.							140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.		.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.					.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.
Query Sequence		S	W	L	L	K	D	V	L	R	D	Q	W	G	F	K	G	I	T	V	S	D	H	G	A	I	K	E	L	I	K	H	G	T	A	A	D	P	E	D	A	V	R	V	A	L	K	S	G	I	N	M	S	M	S	D	E	Y	.	.	.	.	Y	S	K	Y	L	P	G	L	I	K	S	G	K	V	T	M	A	E	L
Query Conservation																																																											.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	L	L	I	D	I	L	R	D	E	W	K	W	D	G	M	L	M	S	D	W	F	G	T	Y	T	T	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	K	N	G	L	D	I	E	F	P	G	P	T	R	W	R	T	R	A	L	V	S	H	S	L	N	S	R	E	Q	I	T	T	E	D	V
Template Known Secondary structure						T							T									S	T	T					S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T			B	B		S	S	S		S	S												T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.														.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		D	D	A	A	R	H	V	L	N	V	.	K	Y	D	M	G	L	F	N	D	P	Y	S	H	L	G	P	K	E	S	D	P	V	D	T	N	A	E	S	R	L	H	R	K	E	A	R	E	V	A	R	E	S	L	V	L	L	K	N	R	L	E	T	L	P	L	K	K	S	A	T	I	A	V	V	G	P	L	A	D
Query Conservation												.
Alig confidence												.													.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.
Template Sequence		D	D	R	V	R	Q	V	L	K	M	I	K	F	V	V	D	N	L	E	K	T	G	I	.	.	.	.	V	E	N	G	P	E	S	T	S	N	N	T	K	E	T	S	D	L	L	R	K	I	A	A	D	S	I	V	L	L	K	N	K	N	N	I	L	P	L	K	K	E	D	N	I	I	V	I	G	P	N	A	K
Template Known Secondary structure																		T							.	.	.	.		T	T						T	T		S																					G	G	G			S			T	T	S						S	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.					.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	R	D	V	M	G	S	W	S	A	A	G	V	A	D	Q	S	V	T	V	L	T	G	I	K	N	A	V	G	E	N	G	K	V	L	Y	A	K	G	A	N	V	T	S	D	K	G	I	I	D	F	L	N	Q	Y	E	E	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.																						.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.																						.	.
Template Sequence		A	K	T	S	S	G	G	G	S	.	A	S	M	N	S	Y	Y	V	V	S	P	Y	E	G	I	V	N	K	L	G	K	.	.	E	V	D	Y	T	V	G	A	Y	S	H	K	S	I	G	G	L	A	E	S	S	L	I	D	A	A	K	P	A	D	A	E	N	S	G	L	I	A	K	F	Y	S	N	P	R	S	D
Template Known Secondary structure						S		B	S	T	.	T				B	S														T	S	.	.												S	S				S	G	G	G		B	S	S	T	T	S				T	T	T	B	S							S					T
Template Predicted Secondary structure											.																						.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.		.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.			.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	E	P	F	H	V	T	K	V	N	R	S	N	V	H	L	F	K	H	E	K	V	D	P	K	N	P	Y	F	F	V	T	L	T	G	Q	Y	V	P	Q	E	D	G	D	Y	I	F	S	L	Q	V	Y	G	S	G	L	F	Y	L	N	D	E	L	I	I	D	Q	K	H	N	Q	E	R	G	G	A	G	T	K
Template Known Secondary structure		T				S							S	S								T	T	S		T	T	S														S	S	S										S	S							T	T							S	S	S			B				S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
																																	482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	D	P	R	S	P	Q	E	M	I	D	E	A	V	Q	T	A	K	Q	S	D	V	V	V	A	V	V	G	E	A	Q	G	M	A	H	E	A	S	S	R	T	D	I	T	I	P	Q	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	T	K	K	L	T	L	K	K	G	Q	V	Y	N	V	R	V	E	Y	G	S	G	P	A	G	G	F	Q	A	G	V	I	K	A	I	D	D	D	E	E	I	R	N	A	A	E	L	A	A	K	H	D	K	A	V	L	I	I	G	L	N	G	E	W	E	T	E	G	Y	D	R	E	N	M	D	L	P	K	R
Template Known Secondary structure											T	T																																								T	S	S										T	T	T	S	B	T	T	B			S		S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
		531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	R	D	L	I	A	A	L	K	A	T	G	K	P	L	V	L	V	L	M	N	G	R	P	L	A	L	V	K	E	D	Q	Q	A	D	A	I	L	E	T	W	F	A	G	T	E	G	G	N	A	I	A	D	V	L	F	G	D	Y	N	P	S	G	K	L	P	M	S	F	P	R	S	V	G	Q	I	P	V	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence																																.
Template Conservation																																.
Template Sequence		T	N	E	L	V	R	A	V	L	K	A	N	P	N	T	V	I	V	N	Q	S	G	T	P	V	E	F	P	W	L	.	E	D	A	N	A	L	V	Q	A	W	Y	G	G	N	E	L	G	N	A	I	A	D	V	L	Y	G	D	V	V	P	N	G	K	L	S	L	S	W	P	F	K	L	Q	D	N	P	A	F	L
Template Known Secondary structure														S	S								S	S					T	T	G	.	G	G		S										T	T											T	S	S							S	S		B		S	S	G	G	G	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.		.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.		.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680		.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.																																													.
Query SS confidence																												.																																													.
Query Sequence		S	H	L	N	T	G	R	P	Y	N	A	D	K	P	N	K	Y	T	S	R	Y	F	D	E	A	N	.	G	A	L	Y	P	F	G	Y	G	L	S	Y	T	T	F	T	V	S	D	V	K	L	S	A	P	T	M	K	R	D	G	K	V	T	A	S	V	Q	V	T	N	T	G	K	.	R	E	G	A	T	V	V	Q
Query Conservation																												.																																													.
Alig confidence																												.																										.	.	.	.																.
Template Conservation																																																						.	.	.	.
Template Sequence		N	F	K	T	E	F	G	R	V	I	Y	G	E	D	I	F	V	G	Y	R	Y	Y	E	K	L	Q	R	K	V	A	F	P	F	G	Y	G	L	S	Y	T	T	F	E	L	D	I	S	D	F	K	V	T	.	.	.	.	D	D	K	I	A	I	S	V	D	V	K	N	T	G	D	K	F	A	G	S	E	V	V	Q
Template Known Secondary structure		S		S		B	T	T					T	T	T	T			T								T				S	B		T	T					S	S													.	.	.	.	S	S													S	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.
Template SS confidence
		682	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.					.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.
		689	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.		730	.	.	.	.	.	.		.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.		.	760	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.								.																							.
Query SS confidence																																											.								.																							.
Query Sequence		M	Y	L	Q	D	V	T	A	S	M	S	R	P	V	K	Q	L	K	G	F	E	K	I	T	L	K	P	G	E	T	Q	T	V	S	F	P	I	D	I	E	A	.	L	K	F	W	N	Q	Q	.	M	K	Y	D	A	E	P	G	K	F	N	V	F	I	G	T	D	S	A	R	V	K	.	K	G	E	F	E	L
Query Conservation																																											.								.																							.
Alig confidence																																											.								.																							.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	F	S	A	L	N	S	K	V	S	R	P	V	K	E	L	K	G	F	E	K	V	H	L	E	P	G	E	K	K	T	V	N	I	D	L	E	L	K	D	A	I	S	Y	F	N	E	E	L	G	K	W	H	V	E	A	G	E	Y	L	V	S	V	G	T	S	S	D	D	I	L	S	V	K	E	F	K	V
Template Known Secondary structure							S	S		S	S				S													T	T																				T	T	T	T															S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		758	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.