Job Description P0CB39 Confidence 98.77% Date Thu Jan 5 11:30:09 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 272 % Identity 15% Template d1zeda1 SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase Resolution 1.57

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		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.										.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	D	E	S	G	N	E	P	R	T	L	V	L	V	I	G	E	S	T	Q	R	G	R	M	S	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	P	R	E	T	T	P	E	L	D	A	L	H	K	T	D	P	N	L	T	V	F	N	N	V	V	T	S	R	P	Y	T	I	E	I	L	Q	Q	A	L	T	F	A
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																																																																	.	.
Template Sequence		L	Q	P	A	Q	T	A	A	K	N	L	I	I	F	L	G	D	G	M	G	V	S	T	V	T	A	A	R	I	L	K	G	Q	K	K	D	K	L	G	P	E	I	P	L	A	M	D	R	F	P	Y	V	A	L	S	K	T	Y	N	V	D	K	H	.	.	V	P	D	S	G	A	T	A	T	A	Y	L	C	G	V
Template Known Secondary structure						S	B			S								T	T																	T	T	S		S	T	T	S			T	G	G	G		S										S	S		S	.	.	S													S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.			.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.																310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.															330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	E	K	N	P	D	L	Y	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	S	L	M	N	M	M	K	Q	A	G	Y	K	T	F	W	I	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	T	M	T	A	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	N	F	Q	T	I	G	L	S	A	A	A	R	F	N	Q	C	N	T	T	R	G	N	E	V	I	S	V	M	N	R	A	K	K	A	G	K	S	V	G	V	V	T	T	T	R	V	Q	H	A	S	P	A	G	T	Y	A	H	T	V	N	R	N	W	Y	S	D	A	D	V	P	A	S	A	R	Q	E	G	C
Template Known Secondary structure					T	T		B	S	B		T	T	S		T	T		G	G	G		T	T		B											T	T											T	T	S					T	T	T			B	S		T	T			S	G	G	G	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
											338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.											.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.																.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	L	T	V	F	S	R	Q	T	D	K	Q	Y	Y	M	N	Q	Q	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	A	R	E	Y	D	T	N	V	L	K	P	F	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	L	N	D	P	A	P	K	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	D	I	A	T	Q	L	I	S	N	M	D	I	D	V	I	L	G	G	G	R	K	Y	M	F	R	M	G	T	P	D	P	E	Y	P	D	D	Y	S	Q	G	G	T	R	L	D	G	K	N	L	V	Q	E	W	L	A	K	R	Q	G	A	R	Y	V	W	N	R	T	E	L	M	Q	A	S	L	D	P	S	V	T
Template Known Secondary structure											T	S			S							G	G	G	G	S	B	T	T				S	S		T	T		G	G	G	S			B	S	S											T		T	T						S									T		T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	I	V	H	L	L	G	T	H	I	K	Y	K	Y	R	Y	P	E	N	Q	G	K	F	D	G	N	T	D	H	V	P	P	G	L	N	A	E	E	L	E	S	Y	N	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	A	N	L	Y
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	L	M	G	L	F	E	P	G	D	M	K	Y	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	R	D	S	T	L	D	P	S	L	M	E	M	T	E	A	A	L	R	L	L	S	R	N	P	R	G	F	F	L	F	V	E	G	G	R	I	D	H	G	H	H	E	S	R	A	Y	R	A	L	T	E	T	I	M
Template Known Secondary structure								S	S	S	S				G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G			T	T	T																T	T		T	T									T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.											.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	D	H	V	V	A	S	L	I	K	D	F	K	A	A	N	P	N	G	F	L	V	Y	F	S	D	H	G	E	E	V	Y	D	T	P	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.
Template Sequence		F	D	D	A	I	E	R	A	G	Q	L	T	S	.	.	E	E	D	T	L	S	L	V	T	A	D	H	S	H	V	F	S	F	G	G	Y	P	L	R	G	S	S	I	F	G	L	A	P	G	K	A	R	D	R	K	A	Y	T	V	L	L	Y	G	N	G	P	G	Y	V	L	K	D	G	A	R	P	D	V	T	E
Template Known Secondary structure													S		.	.	T	T	T								S				S					S				T	T			T	T	S	B		S	S			T	T	S	S			B	S						S	T	T				B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure															.	.
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.			.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
																	472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	K	T	Q	G	R	N	E	D	N	P	T	R	H	M	Y	T	I	P	F	L	L	W	T	S	E	K	W	Q	A	T	H	P	R	D	F	S	Q	D	V	D	R	K	Y	S	L	A	E	L	I	H	T	W	S	D	L	A	G	L	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	S	G	S	P	E	Y	R	Q	Q	S	A	V	P	L	D	E	E	T	H	A	G	E	D	.	.	.	.	.	.	.	V	A	V	F	A	R	G	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	L	V	H	G	V	Q	E	Q	T	F	I	A	H	V	M	A	F	A	A	C	L	E
Template Known Secondary structure					T	S	T	T										S	S						S		.	.	.	.	.	.	.							S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G			S				T	T										T	T		G
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.								.	.	.	440	.	.	.	.	.											.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.