Job Description P0CB39 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:30:09 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 324 % Identity 16% Template d1hdha_ SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Arylsulfatase Resolution 1.3

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		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		E	P	R	T	L	V	L	V	I	G	E	S	T	Q	R	G	R	M	S	L	Y	G	Y	P	R	E	T	T	P	E	L	D	A	L	H	K	T	D	P	N	L	T	V	F	N	N	V	V	T	S	R	P	Y	T	I	E	I	L	Q	Q	A	L	T	F	A	N	E	K	N	P	D	L	Y	L	T	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																												.												.	.	.									.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																												.												.	.	.									.	.
Template Sequence		K	R	P	N	F	L	V	I	V	A	D	D	L	G	F	S	D	I	G	A	F	G	G	E	I	A	.	T	P	N	L	D	A	L	A	I	A	G	.	.	.	L	R	L	T	D	F	H	T	.	.	A	S	T	S	P	T	R	S	M	L	L	T	G	T	D	H	H	I	A	G	I	G	T	M	A	E	A	L	T
Template Known Secondary structure												S	S			T	T		S	G	G	G	T			S		.											S	.	.	.				S	S				.	.											T	T	S	S						T		S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																												.												.	.	.									.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.				40	.	.	.	.	.	.	.			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
																		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	S	L	M	N	M	M	K	Q	A	G	Y	K	T	F	W	I	T	N	Q	Q	T	M	T	A	R	N	T	M	L	T	V	F	S	R	Q	T	D	K	Q	Y	Y	M	N	Q	Q	R	T	Q	S	A	R	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	E	L	E	G	K	P	G	Y	E	G	H	L	N	E	R	V	V	A	L	P	E	L	L	R	E	A	G	Y	Q	T	L	M	A	G	K	W	H	L	G	L	K	P	E	Q	T	P	H	A	R	G	F	E	R	S	F	S	L	L	P	G	A	A	N	H	Y	G	F	E	P	P	Y	D	E	S	T	P	R	I	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T		T	T		S	S	S			S	S	S									T	T	T											S		S	S	G	G	G	S	T	T	T	T	T		S							S	S				T	T							S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
																									365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.			.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	N	V	L	K	P	F	Q	E	V	L	N	D	.	.	P	A	P	K	K	L	I	I	V	H	L	L	G	T	H	I	K	Y	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	T	P	A	L	Y	V	E	D	E	R	Y	L	D	T	L	P	E	G	F	Y	S	S	D	A	F	G	D	K	L	L	Q	Y	L	K	E	R	D	Q	S	R	P	F	F	A	Y	L	P	F	S	A	P	H	W	P	L	Q	A	P	R	E	I	V	E	K	Y	R	G	R	Y	D	A	G	P	E	A	L	R	Q
Template Known Secondary structure			T								T	T				S				T	T																	T	S		T	T	S										T	T	S	S	S									G	G	G	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
																	399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.			.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	P	E	N	Q	G	K	F	D	G	N	T	D	H	V	P	P	G	L	N	A	E	E	L	E	S	Y	N	D	Y	D	N	A	N	L	Y	N	D	H	V	V	A	S	L	I	K	D	F	K	A	A	N	.	.	P	N	G	F	L	V	Y	F	S	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	L	A	R	L	K	E	L	G	L	V	E	A	D	V	E	A	H	P	V	L	A	L	T	R	E	W	E	A	L	E	D	E	E	R	A	K	S	A	R	A	M	E	V	Y	A	A	M	V	E	R	M	D	W	N	I	G	R	V	V	D	Y	L	R	R	Q	G	E	L	D	N	T	F	V	L	F	M	S	D
Template Known Secondary structure											T	S	S		T	T									S	S			G	G	G	S																																				T	T		G	G	G								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	G	E	E	V	Y	D	T	P	P	H	K	T	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	E	D	N	P	T	R	H	M	Y	T	I	P	F	L	L	W	T	S	E	K	W	Q	A
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	A	E	G	A	L	L	E	A	F	P	K	F	G	P	D	L	L	G	F	L	D	R	H	Y	D	N	S	L	E	N	I	G	R	A	N	S	Y	V	W	Y	G	P	R	W	A	Q	A	A	T	A	P	S	R	L	Y	K	A	F	T	T	Q	G	G	I	R	V	P	A	L	V	R	Y	P	R	L	S	R	Q
Template Known Secondary structure		S	S						G	G	G		G	G	G		S	S												S	G	G	G	T	T	S	T	T															T	T	S	S	S		T	T	S	S	S					B								T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.										.	.	.	.	540	.	.	.							.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	H	P	R	D	F	S	Q	D	V	D	R	K	Y	S	L	A	E	L	I	H	T	W	S	D	L	A	G	L	S	Y	D	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	T	R	S	V	V	N	.	.	.	.	.	.	P	Q	F	K	E	T	T	R	W	I	G	N	P	Y	K	K	N	A	L	I	D	Y	D
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	G	A	I	S	H	A	F	A	T	V	M	D	V	T	P	T	L	L	D	L	A	G	V	R	H	P	G	K	R	W	R	G	R	E	I	A	E	P	R	G	R	S	W	L	G	W	L	S	G	E	T	E	A	A	H	D	E	N	T	V	T	G	W	E	L	F	G	M	R	A	I	R	Q	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	S	S								G	G	G										T						S			T	T							S	S			S					T	T	S	S	S		S	S		T	T								T	T							T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		567	.	.	570
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	P	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	W	K	A
Template Known Secondary structure		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		472	.	.	.