Job Description P31827 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:48:51 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 689 % Identity 13% Template c3cslB_ PDB info PDB header:membrane protein/heme binding protein Chain: B: PDB Molecule:hasr protein; PDBTitle: structure of the serratia marcescens hemophore receptor hasr in2 complex with its hemophore hasa and heme Resolution 2.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		V	P	V	P	V	N	G	N	T	H	Y	T	S	E	S	I	E	R	L	P	T	G	N	G	N	I	S	D	L	L	R	T	N	P	A	V	R	M	D	S	T	Q	S	T	S	L	N	Q	G	D	I	R	P	E	K	I	S	I	H	G	A	.	S	P	Y	Q	N	A	Y	L	I	D	G	I	S	A	T	N	N	L
Query Conservation																																																															.
Alig confidence																					.	.																											.	.	.	.	.	.	.								.																		.
Template Conservation																					.	.																											.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Sequence		V	Y	D	E	P	R	S	V	S	V	I	S	R	E	Q	M	D	N	R	.	.	P	A	R	H	A	A	D	I	L	E	Q	T	T	G	A	Y	S	S	V	S	Q	Q	D	P	A	L	.	.	.	.	.	.	.	S	V	N	I	R	G	I	Q	D	Y	G	R	V	N	M	N	I	D	G	M	R	Q	N	F	Q	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	S	S	S													S	.	.			S	S	G	G	G	T	T	T	T	S	T	T							T	T				B	.	.	.	.	.	.	.					T	T	B		S	G	G	G						T	T							.
Template Predicted Secondary structure																					.	.																											.	.	.	.	.	.	.																										.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.			.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160								.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160		.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.								.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	P	A	N	E	S	D	A	S	S	A	T	N	I	S	G	M	S	Q	G	Y	Y	L	D	V	S	L	L	D	N	V	T	L	Y	D	S	F	V	P	V	E	F	G	.	R	F	N	G	G	V	I	D	A	K	I	K	R	F	N	A	D	D	.	.	.	.	.	.	.	S	K	V	K	L	G	Y	R	T	T	R
Query Conservation																																													.																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	G	H	G	Q	R	N	G	T	M	Y	I	D	S	E	L	L	S	G	V	T	I	D	K	G	T	T	G	G	M	G	S	A	G	T	L	G	G	I	A	T	F	N	T	V	S	A	S	D	F	L	A	P	G	K	E	L	G	G	K	L	H	A	S	T	G	D	N	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S		S	S		B				S	T	T									S	S			S	T	T		T	T		S	S										G	G	G	T			S	S													S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	W	L	T	S	H	I	D	E	N	N	K	S	A	F	N	Q	G	S	S	G	S	T	Y	Y	S	P	D	F	K	K	N	F	Y	T	L	S	F	N	Q	E	L	A	D	N	F	G	V	T	A	G	L	S	R	R	Q	S	D	I	T	R	A	D	Y	V	S	N	D	G	I	V	A	G	R	A	Q	Y	K	N
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	H	F	I	G	S	G	I	L	A	L	G	N	E	T	G	D	I	L	L	A	A	S	E	R	H	L	G	D	Y	W	P	G	N	K	G	D	I	G	N	I	R	I	N	N	D	T	G	N	Y	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	E	S	I	K	N	N	K	I	P	D	T	H	Y
Template Known Secondary structure															S	S																				B	S				S	S	S	S		S		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.														.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	D	T	A	L	S	K	F	T	W	F	A	S	D	R	F	T	H	D	L	T	L	K	Y	T	G	S	S	R	D	Y	N	T	S	T	F	P	Q	S	D	R	E	M	G	N	K	S	Y	G	L	A	W	D	M	D	T	Q	L	A	W	A	K	L	R	T	T	V	G	W	D	H	I	S	D	Y	T	R	H	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	M	H	S	R	L	A	K	V	G	W	N	L	P	A	N	Q	R	L	Q	L	S	Y	L	Q	T	Q	T	A	S	P	I	A	G	T	L	T	N	L	G	T	R	P	P	Y	E	L	G	W	K	R	T	G	Y	T	D	V	M	A	R	N	A	A	F	D	Y	S	L	A	P	E	D	V	D	W	L	D	F	Q	A
Template Known Secondary structure															T	T	T																				S				S	S	S	S	S																											T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	D	I	W	Y	T	E	L	S	C	T	Y	G	D	I	T	G	R	C	T	R	G	G	L	G	H	I	S	Q	A	V	D	N	Y	T	F	K	T	R	L	D	W	Q	K	F	A	V	G	N	V	S	H	Q	P	Y	F	G	A	E	Y	I	Y	S	D	A	W	T	E	R	H	N	Q	S	E	S	Y	V	I	N	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	L	Y	Y	V	D	T	Q	D	D	S	D	T	Y	S	T	S	S	L	L	D	N	G	Y	A	T	R	T	R	L	R	T	Y	G	A	Q	A	Q	N	T	S	R	F	S	L	A	P	G	H	D	F	R	A	N	Y	G	L	E	F	Y	Y	D	K	A	T	S	D	S	S	R	Q	G	M	E	G	V	T	P	A	G
Template Known Secondary structure																	S		S	S	S																											T	T																					S	S	T	T		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	K	K	T	N	H	T	I	Y	H	K	G	K	G	R	L	G	I	D	N	Y	T	L	Y	M	A	D	R	I	S	W	R	N	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	M	P	G	V	R	Y	D	Y	D	N	Y	L	S	N	H	N
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	S	V	A	S	L	F	A	N	L	T	Y	D	Y	D	G	W	L	T	L	E	G	G	L	R	Y	D	R	Y	R	L	R	G	Q	T	G	L	S	Y	P	D	L	A	K	D	G	Q	R	Y	T	I	D	N	P	C	K	A	L	R	L	T	G	C	S	T	T	T	R	E	D	W	D	V	D	R	D	Q	G	K
Template Known Secondary structure																	T	T	T																										B	S	S	S		B			T	T	S					S	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		I	S	P	R	F	M	T	E	W	D	I	F	A	N	Q	T	S	M	I	T	A	G	Y	N	R	Y	Y	G	G	N	I	L	D	M	G	L	R	D	I	R	N	S	W	T	E	S	V	S	G	N	K	T	L	T	R	Y	Q	D	L	K	T	P	Y	N	D	E	L	A	M	G	L	Q	Q	K	I	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																	.																						.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	P	T	L	A	V	A	V	R	P	G	V	E	W	.	L	E	L	Y	T	T	Y	G	K	S	W	R	P	P	A	I	T	E	T	L	T	.	.	.	.	.	.	N	G	S	A	H	S	S	S	T	Q	Y	P	N	P	F	L	Q	P	E	R	S	R	A	W	E	V	G	F	N	V	Q	Q	P	D	L	W	F
Template Known Secondary structure													S	S	T	T	.																						.	.	.	.	.	.		B		S	S	T	T							T	T																			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																	.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.		.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.							.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
			558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580						.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Predicted Secondary structure		.																								.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																								.	.	.	.	.
Query Sequence		.	G	K	N	V	I	A	R	A	N	Y	V	Y	R	E	A	H	D	Q	I	S	K	S	S	.	.	.	.	.	R	T	D	S	A	T	K	T	T	I	T	E	Y	N	N	D	G	K	T	K	T	H	S	F	S	L	S	F	E	L	A	E	P	L	H	I	R	Q	V	D	I	N	P	Q	I	V	F	S	Y	I	K
Query Conservation		.																								.	.	.	.	.
Alig confidence		.																								.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	D	R	L	V	A	K	V	A	Y	F	D	T	K	V	D	N	Y	I	N	L	A	I	D	R	N	K	P	G	L	V	Q	P	S	I	G	N	A	A	Y	V	N	N	L	S	K	T	R	F	R	G	L	E	Y	Q	L	N	Y	D	A	G	.	.	.	.	.	.	V	F	Y	A	D	L	T	Y	T	H	M	I
Template Known Secondary structure		T	T																S							S				S	B	S					T	T								S	S																S	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.							.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.															.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	G	N	L	S	L	N	N	G	Y	E	E	S	N	T	G	D	N	Q	V	V	Y	N	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	S	Y	D	S	V	P	V	A	D	F	N	N	P	L	K	I	S	L	N	M	D	F	T	H	Q	P	S	G	L	V	W	A	N	T	L	A	W	Q
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	N	E	F	C	S	N	K	A	W	L	G	G	R	L	R	Y	G	D	G	S	R	R	G	N	F	Y	V	E	P	D	A	A	S	N	D	F	V	T	C	D	G	G	T	Q	F	G	S	A	A	Y	L	P	G	D	R	G	S	V	T	L	G	G	R	A	F	D	R	K	L	D	A	G	V	T	V	R	F	A
Template Known Secondary structure										S	S	T	T			B					S			S	S	S												S						T	T				S	G	G	G	S															T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	R	K	A	R	I	I	L	G	K	T	N	A	Q	Y	I	S	E	Y	S	D	Y	K	Q	Y	V	D	E	K	L	D	S	S	L	T	W	D	T	R	L	S	W	T	P	Q	F	L	Q	Q	Q	N	L	T	I	S	A	D	I	L	N	V	L	D	S	K	T	A	V	D	T	T	N	T	G	V	A	T	Y	A
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Sequence		P	G	Y	Q	D	S	S	V	P	S	N	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	A	D	W	P	K	Y	T	L	F	D	L	Y	A	S	Y	K	L	.	.	.	.	T	D	S	L	T	L	R	G	S	V	E	N	L	T	N	R	A	Y	V	V	S	Y	G	E	T	L	A	N	T	L	G
Template Known Secondary structure								S	S		T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S																		S	.	.	.	.	S	S	S								S		T	T		B					T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template SS confidence
		790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.														.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.					.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.
		778	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	R	T	F	W	L	D	V	S	M	K	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	G	R	T	V	Q	G	G	V	E	Y	R	F
Template Known Secondary structure				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		853	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.