Job Description P31827 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:48:51 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 644 % Identity 11% Template c1xkwA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:fe(iii)-pyochelin receptor; PDBTitle: pyochelin outer membrane receptor fpta from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 2.00 Å

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.						40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.
Query Sequence		N	M	Y	M	H	F	F	E	E	M	T	V	Y	A	P	V	.	.	.	.	.	P	V	P	V	N	G	N	T	H	Y	T	S	E	S	I	E	R	L	P	T	G	N	G	N	I	S	D	L	L	R	T	N	P	A	V	R	M	D	S	T	Q	S	T	S	L	N	Q	G	D	I	R	P	E	K	I	S	I	H	G
Query Conservation																		.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.																			.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	S	T	S	A	T	Q	P	P	G	V	T	T	L	G	K	V	P	L	K	P	R	E	L	P	Q	S	A	S	V	I	D	H	E	R	L	E	Q	Q	.	.	N	L	F	S	L	D	E	A	M	Q	Q	A	T	G	V	T	V	Q	P	F	Q	L	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	Y	Y	V	R	G
Template Known Secondary structure					T	T				T	T		B		T	T	S	S		B		G	G	G		S	S													T	.	.	T			B							T	S	T	T								T	T		.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.			.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.									.	120	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160		.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		A	S	P	Y	Q	N	A	Y	L	I	D	G	I	S	A	T	N	N	L	N	P	A	N	E	S	D	A	S	S	A	T	N	I	S	G	M	S	Q	G	Y	Y	L	D	V	S	L	L	D	N	V	T	L	Y	D	S	F	V	P	V	E	F	G	.	R	F	N	G	G	V	I	D	A	K	I	K	R	F	N	A	D
Query Conservation																																																																.
Alig confidence					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	K	V	.	.	D	S	F	E	L	D	G	V	P	A	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	A	S	S	P	Q	D	M	A	I	Y	E	R	V	E	I	L	R	G	S	N	G	L	L	H	G	T	G	N	P	A	A	T	V	N	L	V	R	K	R	P	Q	R	E
Template Known Secondary structure					.	.						T	T						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T					B		T	T									S			T	T	T	T		S			S	S												S	S
Template Predicted Secondary structure					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.			.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		178	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		D	S	K	.	V	K	L	G	Y	R	T	T	R	S	D	W	L	T	S	H	I	D	E	N	N	K	S	A	F	N	Q	G	S	S	G	S	T	Y	Y	S	P	D	F	K	K	N	F	Y	T	L	S	F	N	Q	E	L	A	D	N	F	G	V	T	A	G	L	S	R	R	Q	S	D	I	T	R	A	D	Y	V	S
Query Conservation					.
Alig confidence					.																																																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	A	S	T	T	L	S	A	G	R	W	D	R	Y	R	A	E	V	D	V	G	G	P	L	S	A	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	E	D	R	D	Y	F	Y	D	V	A	D	Q	G	T	R	L	L	Y	G	V	T	E	F	D	L	S	P	D	T	L	L	T	V	G	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T	T	T												S	S	S	S	S	S															S	S	S	S																		T	T							.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	D	G	I	V	A	G	R	A	Q	Y	K	N	V	I	D	T	A	L	S	K	F	T	W	F	A	S	D	R	F	T	H	D	L	T	L	K	Y	T	G	S	S	R	D	Y	N	T	S	T	F	P	Q	S	D	R	E	M	G	N	K	S	Y	G	L	A	W	D	M	D	T	Q	L	A	W	A	K	L	R	T	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	Y	Q	H	I	D	S	I	T	N	M	A	G	V	P	M	A	K	D	G	S	N	L	G	L	S	R	D	T	Y	L	D	V	D	W	D	R	F	K	W	D	T	Y	R	A	F	G	S	L	E	Q	Q	L	G	G	G	W	K	G	K	V	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S		B			B	T	T	S							T	T				B		T	T																				T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	W	D	H	I	S	D	Y	T	R	H	D	H	D	I	W	Y	T	E	L	S	C	T	Y	G	D	I	T	G	R	C	T	R	G	G	L	G	H	I	S	Q	A	V	D	N	Y	T	F	K	T	R	L	D	W	Q	K	F	A	V	G	N	V	S	H	Q	P	Y	F	G	A	E	Y	I	Y	S	D	A	W	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	E	Y	Q	E	A	D	S	R	L	R	Y	A	G	S	F	G	A	I	D	P	Q	T	G	D	G	G	Q	L	M	G	A	A	Y	K	F	K	S	I	Q	R	S	L	D	A	N	L	N	G	P	V	R	L	F	G	L	T	H	E	L	L	G	G	V	T	Y	A	Q	G	E	T	R	Q	D	T	A	R	F	L	N
Template Known Secondary structure																		S		B		T	T	T																															T	T																							B	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.		.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		E	R	H	N	Q	S	E	S	Y	V	I	N	A	A	G	K	K	T	N	H	T	I	Y	H	K	G	K	G	R	L	G	I	D	N	Y	T	L	Y	M	A	D	R	I	S	W	.	R	N	V	S	L	M	P	G	V	R	Y	D	Y	D	N	Y	L	S	N	H	N	I	S	P	R	F	M	T	E	W	D	I	F	A
Query Conservation																																															.
Alig confidence																																															.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	P	N	T	P	V	N	V	Y	R	W	D	P	H	G	V	P	R	P	Q	I	G	Q	Y	T	S	P	G	T	T	T	T	T	Q	K	G	L	Y	A	L	G	R	I	K	L	A	E	P	L	T	L	V	V	G	G	R	E	S	W	W	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	T	P	A	T	R	F	K	P
Template Known Secondary structure									T	T	T			S	S	S						B				B		S																				T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.										.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Q	T	S	M	I	T	A	G	Y	N	R	Y	Y	G	G	N	I	L	D	M	G	L	R	D	I	R	N	S	W	T	E	S	V	S	G	N	K	T	L	T	R	Y	Q	D	L	K	T	P	Y	N	D	E	L	A	M	G	L	Q	Q	K	I	G	K	N	V	I	A	R	A	N	Y	V	Y	R	E	A	H	D	Q
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		G	R	Q	F	T	P	Y	G	G	L	I	W	D	F	A	R	D	W	S	W	Y	V	S	Y	A	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	P	P	L	S	P	V	E	G	K	T	Y	E	T	G	I	K	G	E	L	A	D	.	G	R	L	N	L	S	L	A	A	F	R	I	D	L	E
Template Known Secondary structure																	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						G	G	.	G	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500															.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.		.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	K	S	S	R	T	D	S	A	T	K	T	T	I	T	E	Y	N	N	D	G	K	T	K	T	H	S	F	S	L	S	F	E	L	A	E	P	L	H	I	R	Q	V	D	I	N	P	Q	I	V	F	S	Y	I	K	S	K	G	N	L	S	L	N	N	G	Y	E	E	S	N	T	G	D	N	Q	V	V	Y	N
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	N	P	Q	E	D	P	D	H	P	G	P	P	N	N	P	F	Y	I	S	G	G	K	V	R	S	Q	G	F	E	L	E	G	T	G	Y	L	T	P	Y	.	.	.	.	.	W	S	L	S	A	G	Y	T	Y	T	S	T	E	Y	L	K	D	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S	S			S	T	T																									T	T	.	.	.	.	.																		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		549	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.						.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.			.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.
Query SS confidence																															.	.
Query Sequence		G	N	L	V	S	Y	D	S	V	P	V	A	D	F	N	N	P	L	K	I	S	L	N	M	D	F	T	H	Q	.	.	P	S	G	L	V	W	A	N	T	L	A	W	Q	E	A	R	K	A	R	I	I	L	G	K	T	N	A	Q	Y	I	S	E	Y	S	D	Y	K	Q	Y	V	D	E	K	L	D	S	S	L	T
Query Conservation																															.	.
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	N	D	S	G	T	R	Y	S	T	F	T	P	R	H	L	L	R	L	W	S	N	Y	D	L	P	W	Q	D	R	R	W	S	V	G	G	G	L	Q	A	Q	S	D	Y	S	V	D	Y	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	M	R	Q	G	G	Y	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S		T	T		B	S		T	T	S		S												S																							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	660	.	.	.	.	.	.
		734	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.		770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		W	D	T	R	L	S	W	T	P	Q	F	L	Q	Q	Q	N	L	T	I	S	A	D	I	L	N	V	L	D	S	K	T	A	V	D	T	T	.	N	T	G	V	A	T	Y	A	S	G	R	T	F	W	L	D	V	S	M	K	F
Query Conservation																																						.
Alig confidence											.	.	.	.																								.
Template Conservation											.	.	.	.
Template Sequence		V	N	M	R	L	G	Y	K	I	.	.	.	.	D	E	H	W	T	A	A	V	N	V	N	N	L	F	D	R	T	Y	Y	Q	S	L	S	N	P	N	W	N	N	R	Y	G	E	P	R	S	F	N	V	S	L	R	G	A	F
Template Known Secondary structure										S	.	.	.	.	S	S	S									S	T	T											T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.
Template SS confidence
		667	.	.	670	.	.	.	.	.					.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720