Job Description P31827 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:48:51 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 635 % Identity 13% Template c1po3A_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:iron(iii) dicitrate transport protein feca PDBTitle: crystal structure of ferric citrate transporter feca in2 complex with ferric citrate Resolution 3.40 Å

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		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100				.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.
Query Sequence		P	V	P	V	P	V	N	G	N	T	H	Y	T	S	E	S	I	E	R	L	P	T	G	N	G	N	I	S	D	L	L	R	T	N	P	A	V	R	M	D	S	T	Q	S	T	S	L	N	Q	G	D	I	R	P	E	K	I	S	I	H	G	A	S	.	.	.	P	Y	Q	N	A	Y	L	I	D	G	I	S	A	T
Query Conservation																																																																	.	.	.
Alig confidence																						.	.																													.	.	.											.	.	.
Template Conservation																						.	.																													.	.	.
Template Sequence		D	V	F	E	H	A	G	A	R	D	V	I	R	R	E	D	F	A	K	T	.	.	G	A	T	T	M	R	E	V	L	N	R	I	P	G	V	S	A	P	E	N	N	G	T	G	S	H	D	L	.	.	.	A	M	N	F	G	I	R	G	L	N	P	R	L	A	S	R	S	T	V	L	M	D	G	I	P	V	P
Template Known Secondary structure			G	G	G		S	S	S						G	G	G	T	G	G	G	.	.	T			S						T	T	S	T	T						S	B	T	T	B		S	S	S	.	.	.	S						T	T				G	G	G	T	T	S					T	T				S
Template Predicted Secondary structure																						.	.																													.	.	.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.			.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.				.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160		.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		N	N	L	N	P	A	N	E	S	D	A	S	S	A	T	N	I	S	G	M	S	Q	G	Y	Y	L	D	V	S	L	L	D	N	V	T	L	Y	D	S	F	V	P	V	E	F	G	.	R	F	N	G	G	V	I	D	A	K	I	K	R	F	N	A	D	D	S	K	V	K	L	G	Y	R	T	T	R	S	D	W	L
Query Conservation																																																.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	G	Q	P	Q	L	S	L	A	P	V	S	L	G	N	M	D	A	I	D	V	V	R	G	G	G	A	V	R	Y	G	P	Q	S	V	G	G	V	V	N	F	V	T	R	A	I	P	Q	D	F	G	I	E	A	G	V	E	G	Q	L	S	P	T	S	S
Template Known Secondary structure		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T					S	S					G	G	G									S				S	S	S		S	S	G	G	G												S	S													T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		171	.													.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	S	H	I	D	E	N	N	K	S	A	F	N	Q	G	S	S	G	S	T	Y	Y	S	P	D	F	K	K	N	F	Y	T	L	S	F	N	Q	E	L	A	D	N	F	G	V	T	A	G	L	S	R	R	Q	S	D	I	T	R	A	D	Y	V	S	N	D	G	I	V	A	G	R	A	Q	Y	K	N	V	I	D	T
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	N	N	P	K	E	T	H	N	L	M	V	G	G	T	A	D	N	G	F	G	T	A	L	L	Y	S	G	T	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	W	R	E	H	S	A	T	R	I	D	D
Template Known Secondary structure				S														T	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	S	K	F	T	W	F	A	S	D	R	F	T	H	D	L	T	L	K	Y	T	G	S	S	R	D	Y	N	T	S	T	F	P	Q	S	D	R	E	M	G	N	K	S	Y	G	L	A	W	D	M	D	T	Q	L	A	W	A	K	L	R	T	T	V	G	W	D	H	I	S	D	Y	T	R	H	D	H	D	I	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	M	L	K	S	K	Y	A	P	D	E	V	H	T	F	N	S	L	L	Q	Y	Y	D	G	E	A	D	M	P	G	G	L	S	R	A	D	Y	D	A	D	R	W	Q	S	T	R	P	Y	D	R	F	W	G	R	R	K	L	A	S	L	G	Y	Q	F	Q	P	D	S	Q	H	K	F	N	I	Q	G	F	Y	T	Q
Template Known Secondary structure										S	S	S	S																													T	T			S		S	S																		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	T	E	L	S	C	T	Y	G	D	I	T	G	R	C	T	R	G	G	L	G	H	I	S	Q	A	V	D	N	Y	T	F	K	T	R	L	D	W	Q	K	F	A	V	G	N	V	S	H	Q	P	Y	F	G	A	E	Y	I	Y	S	D	A	W	T	E	R	H	N	Q	S	E	S	Y	V	I	N	A	A	G	K	K
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	R	S	G	Y	L	E	Q	G	K	R	I	T	L	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	Y	W	V	R	G	I	E	P	R	Y	S	Q	I	F	M	I	G	P	S	A	H	E	V	G	V	G	Y	R	Y	L	N	E	S	T	H	E	M	R	Y	Y	T	A	T	S	S	G	Q	L	P	S	G	S	S
Template Known Secondary structure											S	S							.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T																									T	T	S	S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.									380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.						.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.
Query Sequence		T	N	H	T	I	Y	H	K	G	K	G	R	L	G	I	D	N	Y	T	L	Y	M	A	D	R	I	S	W	.	.	.	.	.	R	N	V	S	L	M	P	G	V	R	Y	D	Y	D	N	Y	L	S	N	H	N	I	S	P	R	F	M	T	E	W	D	I	F	A	N	Q	T	S	M	I	T	A	G	Y	N	R	Y
Query Conservation																														.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	Y	D	R	D	T	R	S	G	T	E	A	H	A	W	Y	L	D	D	K	I	D	I	G	N	W	T	I	T	P	G	M	R	F	E	H	I	E	S	Y	Q	N	N	A	I	T	G	T	H	E	E	V	S	Y	N	A	P	L	P	A	L	N	V	L	Y	H	L	T	D	S	W	N	L	Y	A	N	T	E	G	S
Template Known Secondary structure																									T	T																			T	T	T																							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	G	N	I	L	D	M	G	L	R	D	I	R	N	S	W	T	E	S	V	S	G	N	K	T	L	T	R	Y	Q	D	L	K	T	P	Y	N	D	E	L	A	M	G	L	Q	Q	K	I	G	K	N	V	I	A	R	A	N	Y	V	Y	R	E	A	H	D	Q	I	S	K	S	S	R	T	D	S	A	T	K	T
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																														.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																														.	.
Template Sequence		F	G	T	V	Q	Y	S	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	A	V	Q	S	G	N	V	E	P	E	K	A	R	T	W	E	L	G	T	R	Y	D	.	D	G	A	L	T	A	E	M	G	L	F	L	I	N	F	N	N	Q	Y	D	S	N	Q	T	N	D	T	V	T	.	.
Template Known Secondary structure							G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				T	T	S	S																	.		S	S													S							T	T	T	T				.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																														.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.																.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.		.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	T	E	Y	N	N	D	G	K	T	K	T	H	S	F	S	L	S	F	E	L	A	E	P	L	H	I	R	Q	V	D	I	N	P	Q	I	V	F	S	Y	I	K	S	K	G	N	L	S	L	N	N	G	Y	E	E	S	N	T	G	D	N	Q	V	V	Y	N	G	N	L	V	S	Y	D	S	V	P	V	A	D
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	G	K	T	R	H	T	G	L	E	T	Q	A	R	Y	D	L	G	T	L	T	P	T	L	D	N	.	.	.	.	.	V	S	I	Y	A	S	Y	A	Y	V	N	A	E	I	R	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	T	Y	G	N	L	V	P
Template Known Secondary structure																			T	T	S	S		G	G	G	T	T	.	.	.	.	.																S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	T		B		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.						.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	N	N	P	L	K	I	S	L	N	M	D	F	T	H	Q	P	S	G	L	V	W	A	N	T	L	A	W	Q	E	A	R	K	A	R	I	I	L	G	K	T	N	A	Q	Y	I	S	E	Y	S	D	Y	K	Q	Y	V	D	E	K	L	D	S	S	L	T	W	D	T	R	L	S	W	T	P	Q	F	L	Q	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence																		.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																		.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		F	S	P	K	H	K	G	T	L	G	V	D	Y	K	P	G	.	.	N	W	T	F	N	L	N	S	D	F	Q	S	S	Q	F	A	D	N	A	N	T	V	K	E	S	A	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	G	R	I	P	G	F	M	L	W	G	A	R	V	A	Y	D	F	G	P	Q	.	M	A
Template Known Secondary structure		S			S	B										S	T	.	.	T													B		S	S	T	T				S			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S		B														S		T	T	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.			.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.										.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.		.	.
		749	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.			.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
Predicted Secondary structure																												.	.
Query SS confidence																												.	.
Query Sequence		N	L	T	I	S	A	D	I	L	N	V	L	D	S	K	T	A	V	D	T	T	N	T	G	V	A	.	.	T	Y	A	S	G	R	T	F	W	L	D	V	S	M	K	F
Query Conservation																												.	.
Alig confidence																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	N	L	A	F	G	V	K	N	I	F	D	Q	D	Y	F	I	R	S	Y	D	D	N	N	K	G	I	Y	A	G	Q	P	R	T	L	Y	M	Q	G	S	L	K	F
Template Known Secondary structure											S	T	T										S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.