Job Description P0AEP9 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:23:54 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 399 % Identity 15% Template c1i19B_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:cholesterol oxidase; PDBTitle: crystal structure of cholesterol oxidase from b.sterolicum Resolution 1.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.							.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		C	D	G	L	S	A	Y	R	T	R	P	L	L	V	V	L	P	K	Q	M	E	Q	V	T	A	I	L	A	V	C	H	R	L	R	V	P	V	V	T	R	G	A	G	T	G	L	S	G	G	A	L	P	L	E	K	G	.	.	.	.	.	.	V	L	L	V	M	A	R	F	K	E	I	.	L	D	I	N	P	V
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence																																																						.				.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation																																																						.
Template Sequence		Q	N	W	S	K	E	I	M	L	D	A	T	W	V	C	S	P	K	T	P	Q	D	V	V	R	L	A	N	W	A	H	E	H	D	Y	K	I	R	P	R	G	A	M	H	G	W	T	P	L	T	V	E	.	K	G	A	N	V	E	K	V	I	L	A	D	T	M	T	H	L	N	G	I	T	V	N	T	G	G	P
Template Known Secondary structure				T	T	S	S	S											S	S															T								S					S	S	S	S			.	T	T				T	T						S	T	T	T										S	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.										.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	R	R	A	R	V	Q	P	G	V	R	N	L	A	I	S	Q	A	V	A	P	H	N	L	Y	Y	A	P	D	P	S	S	Q	I	A	C	S	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	V	A	E	N	A	G	G	V	H	C	L	K	Y	G	L	T	V	H	N	L	L	K	I	E	V	Q	T	L	D	G
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	T	V	T	A	G	A	G	A	S	I	E	A	I	V	T	E	L	Q	K	H	D	L	G	W	A	N	L	P	A	P	G	V	L	S	I	G	G	A	L	A	V	N	A	H	G	A	A	L	P	A	V	G	Q	T	T	L	P	G	H	T	Y	G	S	L	S	N	L	V	T	E	L	T	A	V	V	W	N	G
Template Known Secondary structure		S							T	T	S	B										T	T	T				S	S			S		T	T	S	B							T	T				S					T	T					T	T			S	S		G	G	G	G											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.							.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	L	T	L	G	S	D	A	L	D	S	P	G	F	D	L	L	A	L	F	T	G	S	E	G	M	L	G	V	T	T	E	V	T	V	K	L	L	P	K	P	P	V	A	R	V	L	L	A	S	F	.	.	.	.	.	.	D	S	V	E	K	A	G	L	A	V	G	D	I	I	A	N	G	I	I	P	G	G
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.
Template Sequence		T	T	Y	A	L	E	T	Y	Q	R	N	.	.	.	.	D	P	R	I	T	P	L	L	T	N	L	G	R	C	F	L	T	S	V	T	M	Q	A	G	P	N	F	R	Q	R	C	Q	S	Y	T	D	I	P	W	R	E	L	F	A	P	K	G	A	D	G	R	T	F	E	K	F	V	A	E	S	G	G	A	E	A
Template Known Secondary structure		S	S								T	T	.	.	.	.		T	T	S					S		T	T	S	S																							S						T			T	T		S	S	S										S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.					.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		264	.	.																																				.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	N	L	S	I	R	A	A	E	D	F	I	H	A	G	Y	P	V	D	A	E	A	I	L	L	C	E	L	D	G	V	E	S	D	V	Q	E	D	C	E	R
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	W	Y	P	F	T	E	K	P	W	M	K	V	W	T	V	S	V	G	K	P	P	Q	A	R	E	V	S	G	P	Y	N	Y	I	F	S	D	N	L	P	E	P	I	T	D	M	I	G	A	I	N	A	G	N	P	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	L	F	G	P	A	M	Y	E	I
Template Known Secondary structure					T	T		S	S														T	T	S				S	S	S								S														T	T		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.													370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.										360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	N	D	I	L	L	K	A	G	A	T	D	V	R	L	A	Q	D	E	A	E	R	V	R	F	W	A	G	R	K	N	A	F	P	A	V	G	R	I	S	P	D	Y	Y	C	M	D	G	T	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	A	L	P	G	V	L	E	G	I	A	R	L	S	Q	Q	Y	D	L
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	K	L	G	L	A	A	T	N	A	N	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	W	S	K	D	V	Q	F	Y	I	K	A	T	T	L	R	L	T	E	G	G	G	A	V	V	T	S	R	A	N	I	A	T	V	I	N	D	F	T	E	W	F	H	E	R	I	E	F	Y	R	A	K	G	E
Template Known Secondary structure									T	T		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													T	T	S														G	G	G																						T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.													.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
		380	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	A	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	H	A	G	D	G	N	M	H	P	L	I	L	F	D	A	N	E	P	G	E	F	A	R	A	E	E	L	G	G	K	I	L	E	L	C	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	P	L	N	G	P	V	E	I	R	C	C	G	L	D	Q	A	A	D	V	K	V	P	S	V	G	P	P	T	I	S	A	T	R	P	R	P	D	H	P	D	W	D	V	A	I	W	L	N	V	L	G	V	P	G	T	P	G	M	F	E	F	Y	R	E	M	E	Q	W	M	R	S	H	Y	N	N	D	D	A	T
Template Known Secondary structure						S												G	G	G			S			S		S		T	T		T	T				T	T		T	T													T	T		T	T																S	B	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
												421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.		.	.			.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.			.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.			.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	V	G	G	S	I	S	G	E	H	G	I	G	R	E	K	I	N	Q	M	C	A	Q	F	N	S	D	E	I	T	T	F	H	A	V	K	A	A	F	D	P	D	G	L	L	.	N	P	.	.	G	K	N	I	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.			.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.			.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	P	E	W	S	K	G	W	A	F	G	P	D	P	Y	T	D	N	D	I	V	T	N	K	M	R	A	T	Y	I	E	G	V	P	T	T	E	N	W	D	T	A	R	A	R	Y	N	Q	I	D	P	H	R	V	F	T	N	G	F	M	D	K	L	L	P
Template Known Secondary structure						T	T	S			S		S	S	S	T	T								T						T	T	T	T	S		T	T	S	S													T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.