Job Description P0AAD6 Confidence 98.58% Date Thu Jan 5 11:12:37 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 395 % Identity 14% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.					50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.													.	.	.	.
Query SS confidence																				.													.	.	.	.
Query Sequence		K	T	D	T	M	W	M	L	G	L	Y	G	T	A	I	G	A	G	.	V	L	F	L	P	I	N	A	G	V	G	G	.	.	.	.	M	I	P	L	I	I	M	A	I	L	A	F	P	M	T	F	F	A	H	R	G	L	T	R	F	V	L	S	G	K	N	P	G	E	D	I	T	E	V	V	E	E	H	F	G
Query Conservation																				.													.	.	.	.
Alig confidence																				.													.	.	.	.																																	.	.
Template Conservation																																																																					.	.
Template Sequence		A	T	R	L	G	L	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A	Q	G	H	G	.	.	T	T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R
Template Known Secondary structure		S														S	S					T									T	T	T														T																	T	T	T			.	.	S									S
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.			.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	G	A	G	K	L	I	T	L	L	Y	F	F	A	I	Y	P	I	L	L	V	Y	S	V	A	I	T	N	T	V	E	S	F	M	S	H	Q	L	G	M	T	P	P	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	R	F	A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P	S	L	F	A
Template Known Secondary structure		S								T																														T																										T			S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
			140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.				.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																		.	.	.
Query SS confidence		.																																																		.	.	.
Query Sequence		.	A	I	L	S	L	I	L	I	V	G	M	M	T	I	V	R	F	G	E	Q	M	I	V	K	A	M	S	I	L	V	F	P	F	V	G	V	L	M	L	L	A	L	Y	L	I	P	Q	W	N	.	.	.	G	A	A	L	E	T	L	S	L	D	T	A	S	A	T	G	N	G	L	W	M	T	L	W	L	A	I
Query Conservation		.																																																		.	.	.
Alig confidence		.																																																		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	I	V	F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W	I	A	A	V
Template Known Secondary structure																	T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		P	V	M	V	F	S	F	N	H	S	P	I	I	S	S	F	A	V	A	K	R	E	E	Y	G	D	M	A	E	Q	K	C	S	K	I	L	A	F	A	H	I	M	M	V	L	T	V	M	F	F	V	F	S	C	V	L	S	L	T	P	A	D	L	A	A	A	K	E	Q	N	I	S	I	L	S	Y	L	A	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence																																																																																.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	I	F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G	A	F	N	L	G	F	I	T	L	P
Template Known Secondary structure									T	T	T	S	S							T	T	S		T	T	S																			T	T																										S	S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
						294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	N	H	F	N	A	P	V	I	A	W	M	A	P	I	I	A	I	I	A	I	T	K	S	F	L	G	H	Y	L	G	A	R	E	G	F	N	G	M	V	I	K	S	L	R	G	K	G	K	S	I	E	I	N	K	L	N	R	I	T	A	L	F	M	L	V	T	T	W	I	V	A	T	L	N	P	S
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	F	S	Q	T	A	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A	I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K
Template Known Secondary structure					T	T	S	T	T																																		T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.											.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.																.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	G	M	I	E	T	L	G	G	P	I	I	A	M	I	L	F	L	M	P	M	Y	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	K	V	P	A	M	R	K	Y	S	G	H	I	S	N	V	F	V	V	V	M	G	L	I	A	I	S	A	I	F	Y	S
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	L	D	E	M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E	E	I	N	R	G	G	I	I	K	V	P	R	I	Y	Y	Y	V	M	R	Y	I	T	P	A	F	L	A	V	L	L	V	V	W	A	R	E
Template Known Secondary structure										T	T	T																T	T	S											T	T		S	S				T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470