Job Description P0ABD3 Confidence 97.21% Date Thu Jan 5 11:15:13 GMT 2012
Rank 86 Aligned Residues 127
% Identity 16% Template c3fseB_
PDB info
PDB header: hydrolaseChain: B: PDB Molecule: two-domain protein containing dj-1/thij/pfpi-like and
PDBTitle: crystal structure of a two-domain protein containing dj-1/thij/pfpi-2 like and ferritin-like domains (ava_4496) from anabaena variabilis3 atcc 29413 at 1.90 a resolution
Resolution 1.90 Å
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5 . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . .
. . .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . .
Query SS confidence  
.
.
.
.
.
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.
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Query Sequence  
T K V I N Y L N K L L G N E L V A I N Q Y F L H A R M F K N W G L K R L N D V E Y H E S I D E M K H A D R Y I E R I L F L E G L P N L Q D .
.
.
.
.
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.
L G K
Query Conservation  
                                                                                          . . . . . . . .      
Alig confidence  
. . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                                            . . .                                                                                              
Template Sequence  
G D I V R G L N T A L G G E R Y S L E A L E K Y T E K E S D .
.
.
V E A K A L F Q E X I T N K Q R H I E Y L E T Y L T R L G E K P S L S A N I A N Q Y A K V K T
Template Known Secondary structure  
S . . . T T T T T
Template Predicted Secondary structure  
. . .
Template SS confidence  
   
208 . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . .
. . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . .
 
   
77 . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
L N I G E D V E E M L R S D L A L E L D G A K N L R E A I G Y A D S V H D Y V S R D M M I E I L R D E E G H I D W L E T E
Query Conservation  
                                                                                             
Alig confidence  
. . .
Template Conservation  
                                                        . . .                                                            
Template Sequence  
A L T G S D D I Y Q I R S A L G D I Q T G I G D I G N L .
.
.
C A X Y T D P I A T A I F K E I Y K D L V K Y E Q R L V S L
Template Known Secondary structure  
S . . . T T T S
Template Predicted Secondary structure  
. . .
Template SS confidence  
   
285 . . . . 290 . . . . . . . . . 300 . . . . . . . . . 310 . .
. . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]