Job Description P37650 Confidence 99.91% Date Wed Jan 25 15:20:52 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 511 % Identity 9% Template d2ooea1 SCOP info alpha-alpha superhelix TPR-like HAT/Suf repeat Resolution 3.00

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		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	K	L	F	N	G	A	P	P	E	G	D	I	A	V	E	Y	W	S	T	V	A	K	I	P	A	R	R	G	E	A	I	N	Q	L	K	R	I	N	A	D	A	P	G	N	T	G	L	Q	N	N	L	A	L	L	L	F	S	S	D	R	R	D	E	G	F	A	V	L	E	Q	M	A	K	S	N	A	G	R	E
Query Conservation
Alig confidence																					.	.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		E	K	K	L	E	E	N	P	Y	D	L	D	A	W	S	I	L	I	R	.	.	E	A	Q	N	Q	P	I	D	K	A	R	K	T	Y	E	R	L	V	A	Q	F	P	S	S	G	R	F	W	K	L	Y	I	E	A	E	I	K	A	K	N	Y	D	K	V	E	K	L	F	Q	R	C	L	M	K	V	L	H	I	D
Template Known Secondary structure									T	T											.	.				S	S														T	T		T	T															T	T													T	T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40			.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	S	K	I	W	Y	G	Q	I	K	D	M	P	V	S	D	A	S	V	S	A	L	K	K	Y	L	S	I	F	S	D	G	D	S	V	A	A	A	Q	S	Q	L	A	E	Q	Q	K	Q	L	A	D	P	A	F	R	A	R	A	Q	G	L	A	A	V	D	S	G	M	A	G	K	A	I	P	E	L	Q	Q	A
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	W	K	C	Y	L	S	Y	V	R	E	T	K	G	K	L	P	S	Y	K	E	K	M	A	Q	A	Y	D	F	A	L	D	K	I	G	M	E	I	M	S	Y	Q	I	W	V	D	Y	I	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	T	T	S	T	T																T	T	T	S	T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	A	N	P	K	D	S	E	A	L	G	A	L	G	Q	A	Y	S	Q	K	G	D	R	A	N	A	V	A	N	L	E	K	A	L	A	L	D	P	H	S	S	N	N	D	K	W	N	S	L	L	K	V	N	R	Y	W	L	A	I	Q	Q	G	D	A	A	L	K	A	N	N	P	D	R	A	E	R	L	F	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	G	V	E	A	V	G	S	Y	A	E	N	Q	R	I	T	A	V	R	R	V	Y	Q	R	G	C	V	N	P	M	I	N	I	E	Q	L	W	R	D	Y	N	K	Y	E	E	G	I	N	I	H	L	A	K	K	M	I	E	D	R	S	R	D	Y	M	N	A	R	R	V	A	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.				S				S	S	T	T																T	T	S			T	T																										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	R	N	V	D	N	T	D	S	Y	A	V	L	G	L	G	D	V	A	M	A	R	K	D	Y	P	A	A	E	R	Y	Y	Q	Q	T	L	R	M	D	S	G	N	T	N	A	V	R	G	L	A	N	I	Y	R	Q	Q	S	P	E	K	A	E	A	F	I	A	S	L	S	A	S	Q	R	R	S	I	D	D	I
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	Y	E	T	V	M	K	G	L	D	R	N	A	P	S	V	P	P	Q	P	Q	E	A	Q	Q	V	D	M	W	K	K	Y	I	Q	W	E	K	S	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R
Template Known Secondary structure												S	S	S																											S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.																																							.	.
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.		.	.	.	.	530	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.
Query SS confidence																																																																								.
Query Sequence		E	R	S	L	Q	N	D	R	L	A	Q	Q	A	E	A	L	E	N	Q	G	K	W	A	Q	A	A	A	L	Q	R	Q	R	L	A	L	D	P	G	S	V	W	I	T	Y	R	L	S	Q	D	L	W	Q	A	G	Q	R	S	Q	A	D	T	L	M	R	N	L	A	Q	Q	K	.	S	N	D	P	E	Q	V	Y	A
Query Conservation																																																																								.
Alig confidence																																																																								.
Template Conservation
Template Sequence		T	E	D	Q	T	L	I	T	K	R	V	M	F	A	Y	E	Q	C	L	L	V	L	G	H	H	P	D	I	W	Y	E	A	A	Q	Y	L	E	Q	S	S	K	L	L	A	E	K	G	D	M	N	N	A	K	L	F	S	D	E	A	A	N	I	Y	E	R	A	I	S	T	L	L	K	K	N	M	L	L	Y	F	A
Template Known Secondary structure			S		S																			T	T																					T	T	T																				T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	L	Y	L	S	G	H	D	Q	D	R	A	A	L	A	H	I	N	S	L	P	R	A	Q	W	N	S	N	I	Q	E	L	V	N	R	L	Q	S	D	Q	V	L	E	T	A	N	R	L	R	E	S	G	K	E	A	E	A	E	A	M	L	R	Q	Q	P	P	S	T	R	I	D	L	T	L	A	D	W	A	Q
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	A	D	Y	E	E	S	R	M	K	Y	E	K	V	H	S	I	Y	N	R	L	L	A	I	E	D	I	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	V	Y	I	Q	Y	M	K	F	A	R
Template Known Secondary structure									T	T															S	S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																		.
Query SS confidence																																		.
Query Sequence		Q	R	R	D	Y	T	A	A	R	A	A	Y	Q	N	V	L	T	R	E	P	A	N	A	D	A	I	L	G	L	T	E	V	.	D	I	A	A	G	D	K	A	A	A	R	S	Q	L	A	K	L	P	A	T	D	N	A	S	L	N	T	Q	R	R	V	A	L	A	Q	A	Q	L	G	D	T	A	A	A	Q	R	T
Query Conservation																																		.
Alig confidence																																		.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	E	G	I	K	S	G	R	M	I	F	K	K	A	R	E	D	A	R	T	R	H	H	V	Y	V	T	A	A	L	M	E	Y	Y	C	S	K	D	K	S	V	A	F	K	I	F	E	L	G	L	K	K	Y	G	D	I	P	E	Y	V	L	A	Y	I	D	Y	L	S	H	L	N	E	D	N	N	T	R	V	L
Template Known Secondary structure																		T		T	T			T														T																		T	T													T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	N	K	L	I	P	Q	A	K	S	Q	P	P	S	M	E	S	A	M	V	L	R	D	G	A	K	F	E	A	Q	A	G	D	P	T	Q	A	L	E	T	Y	K	D	A	M	V	A	S	G	V	T	T	T	R	P	Q	D	N	D	T	F	T	R	L	T	R	N	D	E	K	D	D
Query Conservation
Alig confidence																		.	.
Template Conservation																		.	.
Template Sequence		F	E	R	V	L	T	S	G	S	L	P	P	E	K	S	G	.	.	E	I	W	A	R	F	L	A	F	E	S	N	I	G	D	L	A	S	I	L	K	V	E	K	R	R	F	T	A	F	R	E	E	Y	E	G	K	E	T	A	L	L	V	D	R	Y	K	F	M	D	L	Y	P	C
Template Known Secondary structure								S			S		G	G	G			.	.													S	S																T					T	T							G	G	G	T		B	T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.
Template SS confidence
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.			.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.