Job Description P37650 Confidence 99.96% Date Wed Jan 25 15:20:52 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 387 % Identity 17% Template d1w3ba_ SCOP info alpha-alpha superhelix TPR-like Tetratricopeptide repeat (TPR) Resolution 2.85

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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	E	Q	V	R	L	G	E	A	T	H	R	E	D	L	V	Q	Q	S	L	Y	R	L	E	L	I	D	P	N	N	P	D	V	V	A	A	R	F	R	S	L	L	R	Q	G	D	I	D	G	A	Q	K	Q	L	D	R	L	S	Q	L	A	P	S	S	N	A	Y	K	S	S	R	T	T	M	L	L	S	T	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	M	E	L	A	H	R	E	Y	Q	A	G	D	F	E	A	A	E	R	H	C	M	Q	L	W	R	Q	E	P	D	N	T	G	V	L	L	L	L	S	S	I	H	F	Q	C	R	R	L	D	R	S	A	H	F	S	T	L	A	I	K	Q	N	P	L	L	A	E	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T									T																	T	T															T	T																	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	R	Q	A	L	Q	Q	A	R	L	Q	A	T	T	G	H	A	E	E	A	V	A	S	Y	N	K	L	F	N	G	A	P	P	E	G	D	I	A	V	E	Y	W	S	T	V	A	K	I	P	A	R	R	G	E	A	I	N	Q	L	K	R	I	N	A	D	A	P	G	N	T	G	L	Q	N	N	L	A	L	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	S	N	L	G	N	V	Y	K	E	R	G	Q	L	Q	E	A	I	E	H	Y	R	H	A	L	R	L	K	P	D	F	I	D	.	G	Y	I	N	L	A	A	A	L	V	A	A	G	D	M	E	G	A	V	Q	A	Y	V	S	A	L	Q	Y	N	P	D	L	Y	C	V	R	S	D	L	G	N	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.											T																	T	T				.													S		S	S														T	T		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
							83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.		.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	S	S	D	R	R	D	E	G	F	A	V	L	E	Q	M	A	K	S	N	A	G	R	E	G	A	S	K	I	W	Y	G	Q	I	K	D	M	P	V	S	D	A	S	V	S	A	L	K	K	Y	L	S	I	F	S	D	G	D	S	V	A	A	A	Q	S	Q	L	A	E	Q	Q	K	Q	L	A	D	P	A	F
Query Conservation
Alig confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	A	L	G	R	L	E	E	A	K	A	C	Y	L	K	A	I	E	T	Q	P	N	F	A	V	A	W	S	N	L	G	C	V	F	N	A	Q	G	E	I	W	L	A	I	H	H	F	E	K	A	V	T	L	D	P	N	F	L	D	A	Y	I	N	L	G	N	V	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S																	T	T														T	T	T																	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	A	R	A	Q	G	L	A	A	V	D	S	G	M	A	G	K	A	I	P	E	L	Q	Q	A	V	R	A	N	P	K	D	S	E	A	L	G	A	L	G	Q	A	Y	S	Q	K	G	D	R	A	N	A	V	A	N	L	E	K	A	L	A	L	D	P	H	S	S	N	N	D	K	W	N	S	L	L	K	V	N	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	L	A	I	Q	Q	G	D	A	A	L	K	A	N	N	P	D	R	A	E	R	L	F	Q	Q	A	R	N	V	D	N	T	D	S	Y	A	V	L	G	L	G	D	V	A	M	A	R	K	D	Y	P	A	A	E	R	Y	Y	Q	Q	T	L	R	M	D	S	G	N	T	N	A	V	R	G	L	A	N	I	Y	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	S	P	E	K	A	E	A	F	I	A	S	L	S	A	S	Q	R	R	S	I	D	D	I	E	R	S	L	Q	N	D	R	L	A	Q	Q	A	E	A	L	E	N	Q	G	K	W	A	Q	A	A	A	L	Q	R	Q	R	L	A	L	D	P	G	S	V	W	I	T	Y	R	L	S	Q	D	L	W	Q	A	G	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	R	I	F	D	R	A	V	A	A	Y	L	R	A	L	S	L	S	P	N	H	A	V	V	H	G	N	L	A	C	V	Y	Y	E	Q	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T		T	T														T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																												227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	Q	A	D	T	L	M	R	N	L	A	Q	Q	K	S	N	D	P	E	Q	V	Y	A	Y	G	L	Y	L	S	G	H	D	Q	D	R	A	A	L	A	H	I	N	S	L	P	R	A	Q	W	N	S	N	I	Q	E	L	V	N	R	L	Q	S	D	Q	V	L	E	T	A	N	R	L	R	E	S	G	K	E	A
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	L	A	I	D	T	Y	R	R	A	I	E	L	Q	P	H	F	P	D	A	Y	C	N	L	A	N	A	L	K	E	K	G	S	V	A	E	A	E	D	C	Y	N	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T		S	S																S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	E	A	M	L	R	Q	Q	P	P	S	T	R	I	D	L	T	L	A	D	W	A	Q	Q	R	R	D	Y	T	A	A	R	A	A	Y	Q	N	V	L	T	R	E	P	A	N	A	D	A	I	L	G	L	T	E	V	D	I	A	A	G	D	K	A	A	A	R	S	Q	L	A	K	L	P	A	T	D	N	A	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	L	R	L	C	P	T	H	A	D	S	L	N	N	L	A	N	I	K	R	E	Q	G	N	I	E	E	A	V	R	L	Y	R	K	A	L	E	V	F	P	E	F	A	A	A	H	S	N	L	A	S	V	L	Q	Q	Q	G	K	L	Q	E	A	L	M	H	Y	K	E	A	I	R	I	S	P	T	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.					T	T														T	T	T													T	T	S		T	T														T	T	T														T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
		671	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	T	Q	R	R	V	A	L	A	Q	A	Q	L	G	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	D	A	Y	S	N	M	G	N	T	L	K	E	M	Q	D
Template Known Secondary structure															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400