Job Description P37650 Confidence 97.32% Date Wed Jan 25 15:20:52 GMT 2012 Rank 104 Aligned Residues 217 % Identity 17% Template c2x4mD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:coagulase/fibrinolysin; PDBTitle: yersinia pestis plasminogen activator pla Resolution 2.55 Å

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		902	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.				930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.													.
Predicted Secondary structure																														.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	I	G	P	L	G	Y	T	V	N	A	H	R	R	P	I	S	S	S	L	L	A	F	G	G	Q	K	.	.	.	D	S	P	S	N	T	G	K	K	W	G	G	V	R	A	D	G	V	G	L	S	L	S	Y	D	K	G	E	A	N	G	V	W	A	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Query Conservation																														.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.					.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.
Template Sequence		P	N	I	S	P	D	S	F	T	V	A	A	S	T	G	M	L	S	G	K	S	H	E	M	L	Y	D	A	E	T	G	R	K	I	S	.	.	Q	L	D	W	K	I	K	N	V	A	I	L	K	G	D	I	S	W	D	P	Y	S	F	L	T	L	N	A	R	G	W	T	S	L	A	S	G	S	G	N	M	D	D
Template Known Secondary structure						T	T																						T	T	T						.	.																					S	T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.			.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		967	.	.	970	.	.	.	.												.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	Q	L	T	G	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	D	N	W	R	V	R	W	M	T	G	Y	Y	Y	K	V	I	N	Q	N	N	R	R	V	T	I	G	L	N	N	M	I	W	H	Y	D	K	D	L	S	G	Y	S	L	G	Q	G	G	Y	Y	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	A	W	M	N	E	N	Q	S	E	W	T	D	H	S	S	H	P	A	T	N	V	N	H	A	N	E	Y	D	L	N	V	K	G	W	L	L	Q	D	E	N	Y	K	A	G	I	T	A	G	Y	Q	E	T	R	F	S	W	T	A	T	.	.	.	.	.	.	G	G	S	Y	S	Y	N	N	G	A	Y	T	G	N
Template Known Secondary structure							S	S		S	S		S						T																		S				S	S																				.	.	.	.	.	.	S						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.							.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
													1028	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	Y	L	S	F	A	I	P	V	M	W	R	E	R	T	E	N	W	S	W	E	L	G	A	S	G	S	W	S	H	S	R	T	K	T	M	P	R	Y	P	L	M	N	L	I	P	T	D	W	Q	E	E	A	A	R	Q	S	N	D	G	G	S	S	Q	G	F	G	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	P	K	G	V	R	V	I	G	Y	N	Q	R	F	S	M	P	Y	I	G	L	A	G	Q	Y	R	I	N	D	F	E	L	N	A	L	F	K	F	S	D	W	V	R	A	H	D	N	D	E	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	R	D	L	T	F	R	E	K	T	S	G	S	R	Y	Y
Template Known Secondary structure				T	T																								T	T																						G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.														210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		1097	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.															.	1120	.	.	.	.	.	.	.													.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	R	A	L	L	E	R	R	V	T	S	N	W	F	V	G	T	A	I	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	A	K	D	Y	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	F	L	L	Y	V	R	Y	S	A	A	G
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	V	I	N	A	G	Y	Y	V	T	P	N	A	K	V	F	A	E	F	T	Y	S	K	Y	D	E	G	K	G	G	T	Q	T	I	D	K	N	S	G	D	S	V	S	I	G	G	D	A	A	G	I	S	N	K	N	Y	T	V	T	A	G	L	Q	Y	R	F	G	G
Template Known Secondary structure													T	T																								T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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