![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 21 | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | ||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | C | N | I | S | S | S | I | Q | N | . | . | I | D | Y | G | K | R | S | A | A | M | R | Q | V | D | R | G | K | T | T | Q | L | A | D | R | T | I | T | L | V | M | Q | C | . | . | D | Q | D | A | H | I | R | V | Q | L | N | T | A | N | I | S | N | N | G | F | G | F | G | P | N | G | S | . | . | . | . | . | . | L | N |
Template Sequence |   | C | S | V | A | A | E | S | T | N | F | T | V | D | L | M | E | N | A | A | K | Q | F | N | N | I | G | A | T | . | . | . | T | P | V | V | P | F | R | I | L | L | S | P | C | G | N | A | V | S | A | V | K | V | G | F | T | G | V | A | D | S | H | N | A | N | L | L | A | L | E | N | T | V | S | A | A | A | G | L | G |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | . | . | . | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | B | S | S | S | S | S | B | S | S | S | B | B | S | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 16 | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | |||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 91 | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | L | I | A | S | D | A | F | S | G | S | N | N | L | D | L | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | I | Q | L | L | N | E | . | . | Q | Q | N | Q | I | P | L | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | . | . | T | S | B | T | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 93 | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|