Job Description P00509 Confidence 99.94% Date Thu Jan 5 10:56:40 GMT 2012 Rank 112 Aligned Residues 343 % Identity 12% Template c3bcxA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:cdp-6-deoxy-l-threo-d-glycero-4-hexulose-3- PDBTitle: e1 dehydrase Resolution 2.40 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	I	L	G	L	A	D	L	F	R	A	D	E	R	P	G	K	I	N	L	G	I	G	V	Y	K	D	E	T	G	K	T	P	V	L	T	S	V	K	K	A	E	Q	Y	L	L	E	N	E	T	T	K	N	Y	L	G	I	D	G	I	P	E	F	G	R	C	T	Q	E	L	L	F	G	K	G	S	A	L	I	N
Query Conservation
Alig confidence																				.																															.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																				.																															.	.	.																									.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	A	E	L	V	A	Q	Y	A	E	T	A	M	A	P	K	P	.	F	E	A	G	K	S	V	V	P	P	S	G	K	V	I	G	T	K	E	L	Q	L	M	V	E	A	S	L	D	G	.	.	.	W	L	T	T	G	R	F	N	D	A	F	E	K	K	L	G	E	Y	L	G	V	P	Y	V	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T					.			T	T	T	S		B		S																				T	.	.	.			B	S																T		S			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.																															.	.	.																									.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.				.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.								.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	R	A	R	T	A	Q	T	P	G	G	T	G	A	L	R	V	A	A	D	F	L	A	.	.	.	.	.	.	.	K	N	T	S	V	K	R	V	W	V	S	N	P	S	W	P	N	H	K	S	V	F	N	S	A	G	L	E	V	R	E	Y	A	Y	Y	D	A	E	N	H	T	L	D	F	D	A	L	I	N
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																												.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	L	T	T	T	S	G	S	S	A	N	L	L	A	L	T	A	L	T	S	P	K	L	G	V	R	A	L	K	P	G	D	E	V	I	T	V	A	A	G	F	P	T	T	V	N	P	T	I	Q	N	G	L	I	P	V	F	V	D	V	.	D	I	P	T	Y	N	V	N	A	S	L	I	E	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.				S													T	T		G	G	G	G	G	G	S			T	T							S	S	S											T	T								B	.		T	T	T		S	B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																												.
Template SS confidence
								81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	N	E	A	Q	A	G	D	V	V	L	F	H	G	C	C	H	N	P	T	G	I	D	P	T	L	E	Q	W	Q	T	L	A	Q	L	S	V	E	K	G	W	L	P	L	F	D	F	A	Y	Q	G	F	A	R	G	L	E	E	D	A	E	G	L	R	A	F	A	A	M	H	K	E	L	I	V	A	S	S	Y
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.										.	.	.										.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.										.	.	.										.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	.	.	.	S	D	K	T	K	A	I	M	I	.	.	.	A	H	T	L	G	N	L	F	D	.	.	.	L	A	E	V	R	R	V	A	D	K	Y	N	L	W	L	I	E	D	C	C	D	A	L	G	S	T	Y	D	G	K	M	A	G	T	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	T	V	S	F
Template Known Secondary structure				.	.	.		S	S							.	.	.			G	G	G					.	.	.												T								T	T		T	T				T	T			T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.										.	.	.										.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		154	.				.	.	.	.	160	.	.	.	.				.	.	.	.	.	170	.	.	.				.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210									.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	N	F	G	L	Y	N	E	R	V	G	A	C	T	L	V	A	A	D	S	E	T	V	D	R	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	M	K	A	A	I	R	A	N	Y	S	N	P	P	A	H	G	A	S	V	V	A	T	I	L	S	N	D	A	L	R	A	I
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	A	H	H	I	T	M	G	E	G	G	A	V	F	T	Q	S	A	E	L	K	S	I	I	E	S	F	R	D	W	G	R	D	C	Y	C	L	G	S	L	P	F	G	Y	D	H	K	Y	T	Y	S	H	L	G	Y	N	L	K	I	T	D	M	Q	A	A	C	G	L	A	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	T	T	S	S	S			S	S							S													B	T	T	B										T	T			G	G	G		B		S				B				B												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.						.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.					.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		W	E	Q	E	L	T	D	M	R	Q	R	I	Q	R	M	R	Q	L	F	V	N	T	L	Q	E	K	G	.	.	.	.	.	A	N	R	D	F	S	F	I	I	K	Q	N	G	M	F	S	F	S	.	.	.	.	G	L	T	K	E	Q	V	L	R	L	R	E	E	F	G	V	Y	A	V	A	S	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																										.	.	.	.	.																			.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	E	R	I	E	E	F	V	E	K	R	K	A	N	F	K	Y	L	K	D	A	L	Q	S	C	A	D	F	I	E	L	P	E	A	T	E	N	S	D	P	S	W	F	G	F	P	I	T	L	K	E	D	S	G	V	S	R	I	D	L	V	K	F	L	D	E	A	K	V	G	T	R	L	L	F	A	G	N	L
Template Known Secondary structure		.	.																					G	G	G	G	T	T	T								T	T						S	S							G	G	G	S	S												T	T	B			B			T	T	S	S	G
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
																													373	.	.	.	.		.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	V	N	V	.	A	G	M	T	P	D	N	M	A	P	L	C	E	A	I	V	A	V	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Template Conservation
Template Sequence		T	R	Q	P	Y	F	H	D	V	K	Y	R	V	V	G	E	L	T	N	T	D	R	I	M	N	Q	T	F	W	I	G	I	Y	P	G	L	T	H	D	H	L	D	Y	V	V	S	K	F	E	E	F	F
Template Known Secondary structure		G	G	S	G	G	G	T	T							S																		S	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.