Job Description P23173 Confidence 98.76% Date Thu Jan 5 11:39:16 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 383 % Identity 11% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		K	K	H	S	A	F	W	G	V	M	V	I	A	G	T	V	I	G	G	G	M	F	.	A	L	P	V	D	L	A	G	A	W	F	F	W	G	A	F	I	L	I	I	A	W	F	S	M	L	H	S	G	L	L	L	L	E	A	N	L	N	Y	P	V	G	S	S	F	N	T	I	T	K	D	L	I	G	N	T	W
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.												.																															.
Template Conservation																																				.																															.
Template Sequence		V	S	L	P	W	W	A	V	G	A	S	L	I	A	A	N	I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	S	G	Y	S	I	G	L	.	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	I	F	I	E	K	G	I	Y	.	T	I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K	L
Template Known Secondary structure															G	G	G	S	S														T		G	.	G	G	G																T								T	T			.	S									T
Template Predicted Secondary structure																																				.																															.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.		.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100		.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		N	I	I	S	G	I	T	V	A	F	V	L	Y	I	L	.	T	Y	A	Y	I	S	A	N	G	A	I	I	S	E	T	I	S	M	N	L	G	Y	H	A	N	P	R	I	V	G	I	C	T	A	I	F	V	A	S	V	L	W	L	S	S	L	A	A	S	R	I	T	S	L	F	L	G	L	K	I	I	S	F	V
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		K	T	I	L	A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	.	.	.	.	.	I	P	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T
Template Known Secondary structure																T																			.	.	.	.	.																				T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.						160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	F	G	S	F	F	F	Q	V	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	L	R	D	A	T	S	S	T	A	G	T	S	Y	F	P	Y	I	F	M	A	L	P	V	C	L	A	S	F	G	F	H	G	N	I	P	S	L	I	I	C	Y	G	K	R	K	D	K	L	I
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	M	A	V	S	F	I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q
Template Known Secondary structure										G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T		S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.															.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	S	V	V	F	G	S	L	L	A	L	V	I	Y	L	F	W	L	Y	C	T	M	G	N	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	S	F	K	A	I	I	S	S	G	G	N	V	D	S	L	V	K	S	F	L	G	T	K	Q	H	G	I	I	E	F	C	L	L	V	F	S	N	L
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	I	V	F	A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M
Template Known Secondary structure											T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	A	S	S	F	F	G	V	T	L	G	L	F	D	Y	L	A	D	L	F	K	I	D	N	S	H	G	G	R	F	K	T	V	L	L	T	F	L	P	P	A	L	L	Y	L	I	F	P	N	G	F	I	Y	G	I	G	G	A	G	L	C	A	T	I	W	A	V	I	I	P	A	V	L	A	I	K	A	R	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	N	S	T	A	T	I	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	W	K
Template Known Secondary structure													T					T		S																										G	G	G	G	G	G		B											T	T	T															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	F	P	N	Q	M	F	T	V	W	G	G	N	L	I	P	A	I	V	I	L	F	G	I	T	V	I	L	C	W	F	G
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F
Template Known Secondary structure		T			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		450	.	.										.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.