Job Description P45549 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 12:03:06 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 309 % Identity 15% Template c3a52A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:cold-active alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of cold-active alkailne phosphatase from2 psychrophile shewanella sp. Resolution 2.20 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	V	V	L	V	I	D	S	F	G	V	G	A	M	K	D	V	T	L	V	R	P	Q	D	A	G	A	N	T	C	G	H	I	L	S	Q	L	P	H	L	Q	L	P	T	L	E	T	L	G	L	I	N	A	L	G	Y	A	P	G	D	M	Q	P	S	D	S	A	T	W	G	V	A	E	L	Q	H	E	G	G
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Sequence		G	M	I	I	M	V	G	D	G	M	G	P	A	Y	T	S	A	Y	R	Y	F	Q	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	T	E	E	I	E	Q	T	V	F	D	R	L	L	.	V	G	M	A	S	T	Y	P	A	R	E	S	G	Y	V	T	D	S	A	A	S	A	T	A	L	A	T	G	F
Template Known Secondary structure									T	T																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S	S											.										G	G	G		S														S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.												.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.				.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.
Query Sequence		D	T	F	M	G	H	Q	E	I	L	G	T	R	P	L	P	P	L	R	M	P	F	R	D	V	I	D	R	V	E	Q	A	L	V	S	A	G	W	Q	V	E	R	R	G	.	.	.	D	D	L	Q	F	L	W	V	N	Q	A	V	A	I	G	D	N	L	E	A	D	L	G	Q	V	Y	N	I	T	A	N	L	S
Query Conservation																																														.	.	.
Alig confidence								.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation								.	.	.											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	Y	N	G	A	.	.	.	I	A	V	D	I	N	K	R	P	L	.	.	.	.	.	.	.	T	T	I	M	Q	M	A	K	A	R	G	M	S	T	G	V	A	V	T	A	Q	V	N	H	A	T	P	A	A	F	L	T	H	N	E	S	R	K	N	Y	E	A	I	A	A	D	M	L	K	S	D	A	D	V
Template Known Secondary structure					T	T		.	.	.	B	S	B		T	T			B		.	.	.	.	.	.	.										T	T											T	T	S										B	S		T	T													T		S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.				.	.	.	.	80	.	.	.	.	.								.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	S	F	D	D	A	I	K	I	G	R	I	V	R	E	Q	V	Q	V	G	R	V	I	T	F	G	G	L	L	T	D	S	Q	R	I	L	D	A	A	E	S	K	E	G	R	F	I	G	I	N	A	P	R	S	G	A	Y	D	N	G	F	Q	V	V	H	M	G	Y	G	V	D	E	K	V	Q	V	P	Q	K
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	G	G	G	R	K	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	A	L	V	S	Q	F	S	A	K	G	Y	Q	H	I	T	E	L	A	Q	L	D	S	I	T	Q	P	K	V	L	G	L	F	A	E	V	Q	L	P	W	V	I	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T						S	G	G	G	G	G	G			S	S							S	S	S	S				G	G	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		140	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290		.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		L	Y	E	A	G	V	P	T	V	L	V	G	K	V	A	D	I	V	N	N	P	Y	G	V	S	W	Q	N	L	V	D	S	Q	R	I	M	D	I	T	L	N	E	F	N	T	H	P	T	A	F	I	.	C	T	N	I	Q	E	T	D	L	A	G	H	A	E	D	V	A	R	Y	A	E	R	L	Q	V	V	D	R
Query Conservation																																																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	T	D	A	N	T	L	S	K	L	T	Q	K	S	L	D	L	L	S	Q	N	E	K	G	F	V	L	L	V	E	G	S	L	I	D	W	A	G	H	N	N	D	I	A	T	A	M	A	E	M	Q	G	F	A	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	S		S															T	T		T	T									T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.			.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure												.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	L	A	R	L	V	E	A	M	Q	.	.	P	D	D	C	L	V	V	M	A	D	H	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	E	V	V	E	Q	Y	I	R	Q	H	P	D	T	L	L	V	V	T	A	D	H	N	T	G	G	L	S	I	G	A	N	G	E	Y	Q	W	D	T	K	L	P	K	G	I	S	A	S	P	A	S	I	A	T	H	A	I	A	A	D	D	W	Q	A	G	V	N	Q	Q	L	G	F	D	V	N	S	T	E	L
Template Known Secondary structure															S								S				T	T				S	B	T	T	B										T			S													S	S										T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
																												342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	T	I	G	H	S	H	H	T	R	E	V	V	P	V	L	V	Y	Q	Q	G	M	I	A	T	Q	L	G	V	R	T	T	L	S	D	V	G	A	T	V	C	E	F	F	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		Q	Q	L	T	N	A	R	M	Q	G	K	S	T	L	E	V	A	L	K	K	I	I	D	T	R	S	Y	T	G	W	T	T	S	G	H	T	G	V	D	V	Q	V	F	A	M	G	P	A	.	.	A	D	L	F	K	G	N	Q	D	N	T	H	I	A	E	K	M	M	S	L	L	P
Template Known Secondary structure																												T				S		S	S												S	T	T	.	.	G	G	G	G																T	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.