Job Description P45549 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 12:03:06 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 339 % Identity 14% Template c2x98A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: h.salinarum alkaline phosphatase Resolution 1.70 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	F	V	V	L	V	I	D	S	F	G	V	G	A	M	K	D	V	T	L	V	R	P	Q	D	A	G	A	N	T	C	G	H	I	L	S	Q	L	P	H	L	Q	L	P	T	L	E	T	L	G	L	I	N	A	L	G	Y	A	P	G	D	M	Q	P	S	D	S	A	T	W	G	V	A	E	L	Q	H	E	G
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.
Template Conservation																																			.	.
Template Sequence		A	N	A	I	A	Y	I	V	D	G	M	G	Q	T	Q	I	S	A	A	R	Y	L	N	A	Y	K	T	A	P	E	R	F	P	.	.	L	N	V	S	P	A	E	T	P	T	G	F	D	A	F	S	S	R	G	S	M	T	T	F	P	D	D	P	Y	E	T	T	T	D	S	A	A	A	A	T	A	F	A	S	G
Template Known Secondary structure		S																												T	T	T	T	T	.	.	G	G	G	S	T	T	T	S			T	G	G	G	S	S												S	S		S	S													S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80			.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.				.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.
Query Sequence		G	D	T	F	M	G	H	Q	E	I	L	G	T	R	P	L	P	P	L	R	M	P	F	R	D	V	I	D	R	V	E	Q	A	L	V	S	A	G	W	Q	V	E	R	R	G	.	.	.	D	D	L	Q	F	L	W	V	N	Q	A	V	A	I	G	D	N	L	E	A	D	L	G	Q	V	Y	N	I	T	A	N	L
Query Conservation																																															.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	T	Y	.	.	.	.	.	.	N	G	A	I	G	G	V	Q	T	S	G	G	G	F	Q	R	V	D	T	V	L	E	R	A	S	A	Q	G	Y	A	T	G	L	I	T	T	T	E	A	T	H	A	T	P	A	A	F	A	A	H	V	E	D	R	G	N	Q	T	E	I	A	R	Q	Y	I	E	E	T	Q	P
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	T	T		B	S					T	T	T																T											T	T	S										B	S	S	T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.							130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	I	S	F	D	D	A	I	K	I	G	R	I	V	R	E	Q	V	Q	V	G	R	V	I	T	F	G	G	L	L	T	D	S	Q	R	I	L	D	A	A	E	S	K	E	G	R	F	I	G	I	N	A	P	R	S	G	A	Y	D	N	G	F	Q	V	V	H	M	G	Y	G	V	D	E	K	V	Q	V	P	Q
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	I	L	G	G	Q	R	R	D	F	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	S	N	G	G	T	L	V	D	A	A	R	D	N	G	Y	T	I	A	E	T	A	A	E	L	D	A	V	D	D	P	P	V	L	G	L	F	S	Q	E	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S							G	G	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		S	S	S	S	B								T	T						S									S	S								S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.					.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.
Query Sequence		K	L	Y	E	A	G	V	P	T	V	L	V	G	K	V	A	D	I	V	N	N	P	Y	G	V	S	W	Q	N	L	V	D	S	Q	R	I	M	D	I	T	L	N	E	F	N	T	.	.	.	.	H	P	T	A	F	I	C	T	N	I	Q	E	T	D	L	A	G	H	A	E	D	V	A	R	Y	A	E	R	L	Q
Query Conservation																																																.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.																											.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	Y	Y	L	D	R	K	N	D	P	E	N	T	Q	P	N	L	D	A	M	V	D	A	G	V	D	L	L	S	S	A	G	D	P	D	K	G	F	F	L	L	V	E	S	G	R	V	D	H	A	G	H	A	N	Y	P	A	Q	V	A	.	E	Q	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T																				S	S		S	S											S								T		T	T				.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																														.
Template SS confidence
																	256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.		.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.				.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.												.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.												.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	V	D	R	N	L	A	R	L	V	E	A	M	Q	.	.	.	P	D	D	C	L	V	V	M	A	D	H	.	.	.	G	N	D	P	T	I	G	H	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.												.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.												.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	T	Q	V	A	G	Q	L	V	E	Y	A	E	T	T	A	E	P	T	F	L	V	S	T	G	D	H	E	C	G	G	L	T	L	G	R	D	S	P	Y	E	V	E	Y	D	V	L	A	A	Q	K	A	T	T	S	R	L	R	D	L	L	A	G	V	R	S	A	D	E	L	E	S	I	V	A	A	H	T	G
Template Known Secondary structure																		S	S													S			B	S	S		S	S		S												S										T	T															S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																					350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	R	E	V	V	P	V	L	V	Y	Q	Q	G	M	I	A	T	Q	L	G	V	R	T	T	L	S	D	V	G	A	T	V	C	E	F	F	R	A	P	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																																			.	.
Template Sequence		I	T	A	L	T	D	R	E	V	A	K	L	R	D	A	P	G	S	I	S	T	I	L	A	E	R	A	G	I	A	F	T	T	D	G	H	T	G	T	D	V	P	V	F	A	H	G	P	N	.	.	A	A	R	F	D	A	A	R	D	N	T	A	V	A	D	A	L	A	A	A	L	G	V	S	L
Template Known Secondary structure																	G	G	G										T		B				S	S												S	T	T	.	.	G	G	G	G	S	S				T	T											T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.			.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.